Red Sage Omics 丹参基因组信息平台
首页 基因查询 ID 对照表 功能注释 结构域预测 Pfam 基因组工具 蛋白互作 亚细胞定位 表达量 共表达 同源/共线性 GO/KEGG 注释 TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变 JBrowse BLAST 下载 关于 帮助
数据资源
ID 对照表 功能注释 功能检索 次生代谢专题 文献证据 结构域预测 Pfam 同源/共线性
分析工具
基因组工具 引物设计 同源重组引物设计 核酸翻译 BLAST 蛋白互作 亚细胞定位 共表达 GO/KEGG 注释 功能检索
调控/突变
TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变
帮助
关于 帮助 资源与版本
中文 EN

转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004579; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010264-RA_Salv SmilChr01G004579 MYB XP_057787263.1 MP00132 CTTTTCCAACCACCTTTTC

可能结合的靶基因

9926 个结合位点 7583 个候选靶基因 第 86 / 152 下载 TSV

上一页 86 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G002030 Chr02 NC_080388.1:36533749-36533767promoter 内 363-381 bp + 3620 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 36528752-36530129(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 ATGTATGTAGTTGGAAGTT
SmilChr04G000087 Chr04 NC_080390.1:787063-787081promoter 内 363-381 bp - 3620 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 778210-783443(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CTTTGCCAACCACATAGTT
SmilChr04G001932 Chr04 NC_080390.1:31415740-31415758promoter 内 350-368 bp - 3633 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 31419391-31438355(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CTAGTTGTGGTTGGTGTCG
SmilChr02G004534 Chr02 NC_080388.1:67909879-67909897promoter 内 339-357 bp - 3644 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 67904465-67906235(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TGCCGTCAACCACAATCAC
SmilChr02G001621 Chr02 NC_080388.1:30150018-30150036promoter 内 287-305 bp - 3696 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 30153732-30155286(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TAAGCAGTGGTTGAAATGG
SmilChr01G004364 Chr01 NC_080387.1:61842550-61842568promoter 内 271-289 bp + 3712 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 61834267-61838838(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 ATAATGGTGGTTGAATTGT
SmilChr02G004970 Chr02 NC_080388.1:71600668-71600686promoter 内 249-267 bp + 3734 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 71595479-71596934(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CCTAAATTGGTTGGAACAG
SmilChr02G003697 Chr02 NC_080388.1:58427987-58428005promoter 内 180-198 bp + 3803 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 58431808-58433480(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CATAGCCAACCAACTTGGC
SmilChr02G000610 Chr02 NC_080388.1:8914631-8914649promoter 内 153-171 bp + 3830 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 8918479-8918931(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TCTCCTCCACCACCTCCCT
SmilChr02G000208 Chr02 NC_080388.1:2737409-2737427promoter 内 136-154 bp - 3847 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 2741274-2744026(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TTATAGGTGGTTGATATAG
SmilChr05G001910 Chr05 NC_080391.1:19366022-19366040promoter 内 107-125 bp - 3876 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 19369916-19371708(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GTTAGGGTGGTTGCAAAGC
SmilChr05G001549 Chr05 NC_080391.1:14214476-14214494promoter 内 92-110 bp - 3891 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 14218385-14220254(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GAAGCGGTGGTTGCCGCAC
SmilChr02G003298 Chr02 NC_080388.1:54254478-54254496promoter 内 19-37 bp + 3964 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 54248813-54250514(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GCCAAGTTGGTTGGCTATG
SmilChr01G002806 Chr01 NC_080387.1:46608980-46608998promoter 内 15-33 bp + 3968 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 46601773-46605012(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CGGTTGGTGGTTGGCTGAC
SmilChr05G002061 Chr05 NC_080391.1:21484993-21485011promoter 内 12-30 bp + 3971 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 21475153-21481022(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GTGATTGTGGTTGACGGCA
SmilChr04G001496 Chr04 NC_080390.1:24517256-24517274promoter 内 3952-3970 bp + 31 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 4 24511870-24517225(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GGTTGAGTGGTTGGATGGT
SmilChr02G004102 Chr02 NC_080388.1:63340865-63340883promoter 内 3411-3429 bp - 572 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 3 63337866-63340293(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 AGCTCCCAACCAATTTCAA
SmilChr02G005127 Chr02 NC_080388.1:72743214-72743232promoter 内 3326-3344 bp + 657 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 3 72743889-72747425(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CATCCACAACCACTCTTAA
SmilChr04G004131 Chr04 NC_080390.1:56132682-56132700promoter 内 2936-2954 bp + 1047 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 3 56133747-56135357(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 ACCCCCCGACCACCTACCC
SmilChr01G002439 Chr01 NC_080387.1:41974577-41974595promoter 内 3433-3451 bp + 550 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 41968455-41974027(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GTGTAAATGGTTGGAAAGG
SmilChr01G000578 Chr01 NC_080387.1:12098406-12098424promoter 内 3175-3193 bp - 808 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 12099232-12911775(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 AAGGCTGTGGTTGAGAGAT
SmilChr01G001581 Chr01 NC_080387.1:29824251-29824269promoter 内 2821-2839 bp - 1162 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 29825431-29831603(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 ACGTAAATGGTTGGAGAAG
SmilChr02G005198 Chr02 NC_080388.1:73247045-73247063promoter 内 2543-2561 bp + 1440 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 73248503-73250639(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 ATTCCCCAACCAAAACCCT
SmilChr05G003063 Chr05 NC_080391.1:38486595-38486613promoter 内 2492-2510 bp + 1491 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 38488104-38489132(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GTGTTCCAACCAATTCTCT
SmilChr04G000916 Chr04 NC_080390.1:11920091-11920109promoter 内 2259-2277 bp + 1724 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 11914037-11918367(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TATTGGGTGGTTGTGGGTG
SmilChr05G000366 Chr05 NC_080391.1:2717424-2717442promoter 内 2198-2216 bp + 1785 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 2719227-2721484(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TAGGCCCAACCAACTCACA
SmilChr01G001111 Chr01 NC_080387.1:22730319-22730337promoter 内 2168-2186 bp + 1815 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 22726595-22728504(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CAGGTGGTGGTTGCTATGG
SmilChr01G004617 Chr01 NC_080387.1:64157897-64157915promoter 内 1933-1951 bp - 2050 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 64159965-64160930(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 AGTGAGGTGGTTGTATGTA
SmilChr04G000193 Chr04 NC_080390.1:1716841-1716859promoter 内 1869-1887 bp - 2114 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 1711053-1714727(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TTCTGCCAACCATCTCTGC
SmilChr02G002504 Chr02 NC_080388.1:43531679-43531697promoter 内 1838-1856 bp + 2145 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 43533842-43537575(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GCTATACAACCACCTCTAG
SmilChr05G000591 Chr05 NC_080391.1:4460377-4460395promoter 内 1792-1810 bp - 2191 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 4462586-4464733(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GAGGCGGTGGTTGTCACAT
SmilChr04G000659 Chr04 NC_080390.1:7445778-7445796promoter 内 1508-1526 bp + 2475 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 7448271-7451141(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GCTATACAACCACCTCTAG
SmilChr02G000108 Chr02 NC_080388.1:1382948-1382966promoter 内 1340-1358 bp + 2643 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 1377569-1380305(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GAACAGTTGGTTGGCGTGT
SmilChr02G001407 Chr02 NC_080388.1:26702887-26702905promoter 内 708-726 bp + 3275 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 26706180-26709397(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 AAGATCCAACCACAAACGC
SmilChr02G004054 Chr02 NC_080388.1:62859167-62859185promoter 内 497-515 bp + 3486 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 62862671-62864748(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TCATGGCAACCACCTTTTT
SmilChr04G002098 Chr04 NC_080390.1:33820869-33820887promoter 内 440-458 bp + 3543 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 33814811-33817326(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 AGGAAAGTGGTTGTCATAG
SmilChr05G002366 Chr05 NC_080391.1:25838596-25838614promoter 内 401-419 bp - 3582 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 25834379-25835014(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 ATGTACCAACCACCGCACA
SmilChr01G001599 Chr01 NC_080387.1:30158669-30158687promoter 内 365-383 bp - 3618 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 30154242-30155051(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TCTTCTCAACCACACTCTG
SmilChr03G003026 Chr03 NC_080389.1:47164652-47164670promoter 内 279-297 bp - 3704 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 47158180-47160948(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TACCCCCAACCAATACAAT
SmilChr03G001992 Chr03 NC_080389.1:29341176-29341194promoter 内 209-227 bp + 3774 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 29331425-29337402(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GCTTGGGTGGTTGAACCTT
SmilChr04G003968 Chr04 NC_080390.1:55152898-55152916promoter 内 55-73 bp + 3928 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 55156844-55158172(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 AAAATCCAACCACCCGATC
SmilChr01G005213 Chr01 NC_080387.1:69742732-69742750promoter 内 3975-3993 bp - 8 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 69742758-69744892(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 ATTAAGTTAGTTGGAATGG
SmilChr04G001510 Chr04 NC_080390.1:24870344-24870362promoter 内 3954-3972 bp + 29 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 24870391-24875186(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 ATTATTCAACCACAACCGC
SmilChr05G000245 Chr05 NC_080391.1:1880430-1880448promoter 内 3779-3797 bp + 204 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 1875483-1880226(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 ATGAAATTGGTTGGAAAAC
SmilChr02G003955 Chr02 NC_080388.1:61710074-61710092promoter 内 3778-3796 bp + 205 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 61704822-61709869(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 AAAAAGGTAGTTGTTGATG
SmilChr05G002167 Chr05 NC_080391.1:22943582-22943600promoter 内 3699-3717 bp + 284 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 22928597-22943298(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GAATGTGTGGTTGAGATTG
SmilChr02G002894 Chr02 NC_080388.1:49221549-49221567promoter 内 3645-3663 bp + 338 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 49221905-49222980(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 AATTACCAACCACATTCCA
SmilChr01G004199 Chr01 NC_080387.1:60469987-60470005promoter 内 3642-3660 bp - 341 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 60470346-60474440(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CATGTGGTGGTTGAGTTTC
SmilChr01G004471 Chr01 NC_080387.1:62805238-62805256promoter 内 3521-3539 bp - 462 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 62801628-62804776(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TTCCACCAACCAACTTTAT
SmilChr02G003064 Chr02 NC_080388.1:51474829-51474847promoter 内 3394-3412 bp + 589 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 51472108-51474240(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CAGGTGGTGGTTGCTATGG