转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr03G004179; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00012156-RA_Salv SmilChr03G004179 WRKY XP_057799230.1 MP00464 AGCGTTGACTTTTT

可能结合的靶基因

9864 个结合位点 7299 个候选靶基因 第 86 / 146 下载 TSV

上一页 86 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G000704 Chr02 NC_080388.1:11322870-11322883promoter 内 1246-1259 bp - 2742 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 11317401-11320128(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 CTAGTTGACTTCGC
SmilChr02G002836 Chr02 NC_080388.1:48506492-48506505promoter 内 1241-1254 bp + 2747 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 48502269-48503745(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 AAGAAGTCAACAAA
SmilChr03G000958 Chr03 NC_080389.1:10826026-10826039promoter 内 1232-1245 bp + 2756 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 10828795-10831314(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GTTTTTGACTTTTT
SmilChr03G002504 Chr03 NC_080389.1:39887030-39887043promoter 内 1209-1222 bp - 2779 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 39882983-39884251(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 CATGTTGACTTGTG
SmilChr03G003110 Chr03 NC_080389.1:48237157-48237170promoter 内 1205-1218 bp - 2783 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 48232517-48234374(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GGCATTGACTTTAA
SmilChr03G003710 Chr03 NC_080389.1:56051548-56051561promoter 内 1200-1213 bp + 2788 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 56054349-56056859(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GTATTTGACTTTGC
SmilChr03G004589 Chr03 NC_080389.1:63738742-63738755promoter 内 1178-1191 bp + 2810 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 63731539-63735932(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TAACAGTCAACCAC
SmilChr04G001362 Chr04 NC_080390.1:22101012-22101025promoter 内 1158-1171 bp - 2830 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 22103855-22107668(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 AGAAAGTCAAACAT
SmilChr03G004585 Chr03 NC_080389.1:63697282-63697295promoter 内 1132-1145 bp - 2856 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 63700151-63704020(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 CCAAAGTCAAATAT
SmilChr04G000371 Chr04 NC_080390.1:3735944-3735957promoter 内 1091-1104 bp + 2897 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 3729974-3733047(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TTAAAGTCAAATCC
SmilChr02G002526 Chr02 NC_080388.1:43950867-43950880promoter 内 1063-1076 bp + 2925 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 43953805-43955960(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GTTTTTGACTTTTT
SmilChr02G005437 Chr02 NC_080388.1:74785824-74785837promoter 内 1062-1075 bp - 2926 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 74777892-74782898(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ACGGTTGACTGTGG
SmilChr03G004130 Chr03 NC_080389.1:60141470-60141483promoter 内 1059-1072 bp - 2929 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 60132350-60138541(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 CAGTTTGACTTTTC
SmilChr04G002369 Chr04 NC_080390.1:38188715-38188728promoter 内 1008-1021 bp - 2980 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 38182282-38185735(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 AATGTTGACTATTT
SmilChr02G002540 Chr02 NC_080388.1:44235852-44235865promoter 内 938-951 bp + 3050 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 44229787-44232802(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ATGAAGTCAACCTA
SmilChr02G004713 Chr02 NC_080388.1:69397237-69397250promoter 内 924-937 bp + 3064 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 69400314-69401812(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 AACATTGACTTTGG
SmilChr03G001607 Chr03 NC_080389.1:20432082-20432095promoter 内 920-933 bp - 3068 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 20435163-20436275(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GAAGAGTCAACTGA
SmilChr03G003048 Chr03 NC_080389.1:47382265-47382278promoter 内 919-932 bp - 3069 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 47385347-47389171(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GCAAAGTCAAATAC
SmilChr03G001062 Chr03 NC_080389.1:12335149-12335162promoter 内 859-872 bp - 3129 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 12331670-12332020(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TCAGTTGACTCTTC
SmilChr03G001357 Chr03 NC_080389.1:15945028-15945041promoter 内 813-826 bp - 3175 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 15940801-15941853(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TACTTTGACTTCTT
SmilChr01G003977 Chr01 NC_080387.1:58225998-58226011promoter 内 715-728 bp + 3273 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 58229284-58236430(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TCCGTTGACCTGAT
SmilChr02G001678 Chr02 NC_080388.1:31012422-31012435promoter 内 655-668 bp - 3333 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 31015768-31017540(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ATAAAGTCAATGCT
SmilChr04G002524 Chr04 NC_080390.1:40289146-40289159promoter 内 646-659 bp - 3342 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 40284342-40285804(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GCAGTTGACTATAA
SmilChr04G002742 Chr04 NC_080390.1:43079366-43079379promoter 内 605-618 bp + 3383 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 43082762-43085372(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ACCGTTGACTGGTT
SmilChr01G002944 Chr01 NC_080387.1:48224000-48224013promoter 内 604-617 bp + 3384 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 48218939-48220616(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GCAAAGTCAAATAC
SmilChr03G001305 Chr03 NC_080389.1:15284749-15284762promoter 内 592-605 bp - 3396 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 15280207-15281353(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GTATTTGACTTTGC
SmilChr02G001283 Chr02 NC_080388.1:23668766-23668779promoter 内 575-588 bp + 3413 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 23672192-23676036(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TTCGTTGACTGTAG
SmilChr03G003000 Chr03 NC_080389.1:46816345-46816358promoter 内 507-520 bp + 3481 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 46819839-46820705(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GTATTTGACTTTGC
SmilChr01G006062 Chr01 NC_080387.1:76049815-76049828promoter 内 498-511 bp - 3490 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 76053318-76053403(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 AGAATGTCAACGAA
SmilChr01G001729 Chr01 NC_080387.1:31842245-31842258promoter 内 492-505 bp + 3496 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 31845754-31846979(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GCCATTGACTTTCC
SmilChr04G000491 Chr04 NC_080390.1:5336470-5336483promoter 内 439-452 bp - 3549 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 5340032-5340947(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GCAAAGTCAAACAT
SmilChr02G001411 Chr02 NC_080388.1:26745438-26745451promoter 内 284-297 bp + 3704 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 26749155-26752912(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GTATTTGACTTTGC
SmilChr01G000297 Chr01 NC_080387.1:5845797-5845810promoter 内 227-240 bp + 3761 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 5841108-5842036(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 AAGAAGTCAAACCT
SmilChr04G004136 Chr04 NC_080390.1:56169940-56169953promoter 内 207-220 bp - 3781 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 56161622-56166159(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TGCGTTGACCATCA
SmilChr04G004132 Chr04 NC_080390.1:56143979-56143992promoter 内 201-214 bp + 3787 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 56135328-56140192(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ATAAAGTCAAACTC
SmilChr04G001582 Chr04 NC_080390.1:26306018-26306031promoter 内 179-192 bp - 3809 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 26301584-26302209(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GTATTTGACTTTGC
SmilChr02G001147 Chr02 NC_080388.1:20867865-20867878promoter 内 178-191 bp + 3810 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 20871688-20874281(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 AAATTTGACTTTTC
SmilChr04G003079 Chr04 NC_080390.1:47405404-47405417promoter 内 127-140 bp + 3861 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 47399044-47401543(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TATAAGTCAAAGCA
SmilChr04G000765 Chr04 NC_080390.1:9321904-9321917promoter 内 126-139 bp - 3862 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 9315101-9318042(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ATGTTTGACTTTGC
SmilChr02G000873 Chr02 NC_080388.1:15054555-15054568promoter 内 117-130 bp - 3871 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 15058439-15063644(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GAAAAGTCAAATTT
SmilChr03G002547 Chr03 NC_080389.1:40625964-40625977promoter 内 115-128 bp - 3873 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 40629850-40631590(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GGAAAGTCAAACCG
SmilChr01G001463 Chr01 NC_080387.1:28431163-28431176promoter 内 112-125 bp - 3876 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 28435052-28435123(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 CCAGAGTCAACCTG
SmilChr03G002806 Chr03 NC_080389.1:44528913-44528926promoter 内 104-117 bp - 3884 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 44519219-44525029(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TCGGTTGACTTAAT
SmilChr02G001700 Chr02 NC_080388.1:31318718-31318731promoter 内 58-71 bp - 3930 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 31322661-31326472(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 AAGAAGTCAAAGTG
SmilChr04G003449 Chr04 NC_080390.1:50989691-50989704promoter 内 56-69 bp + 3932 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 50993636-50994322(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TACTTTGACTTCTT
SmilChr01G003916 Chr01 NC_080387.1:57441796-57441809promoter 内 46-59 bp + 3942 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 57435045-57437854(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ACAAAGTCAGCGCC
SmilChr04G004117 Chr04 NC_080390.1:56068053-56068066promoter 内 46-59 bp + 3942 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 56060212-56064111(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 AAGAAGTCAAAGTA
SmilChr03G003111 Chr03 NC_080389.1:48237157-48237170promoter 内 31-44 bp - 3957 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 48241127-48242517(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TTAAAGTCAATGCC
SmilChr04G002378 Chr04 NC_080390.1:38307383-38307396promoter 内 9-22 bp - 3979 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 38293653-38303404(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 CTCTTTGACTTGTT
SmilChr02G000102 Chr02 NC_080388.1:1301696-1301709promoter 内 1599-1612 bp + 2389 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 4 1298563-1299307(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ACACAGTCAACCAC