转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 86 / 149 下载 TSV

上一页 86 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G001648 Chr01 NC_080387.1:30540877-30540887promoter 内 3245-3255 bp + 746 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 30538737-30540131(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGGCAGCTGGT
SmilChr01G000247 Chr01 NC_080387.1:4651053-4651063promoter 内 3243-3253 bp + 748 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 4649148-4650305(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAT
SmilChr02G001048 Chr02 NC_080388.1:18540326-18540336promoter 内 3237-3247 bp - 754 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 18541090-18542998(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAT
SmilChr07G002163 Chr07 NC_080393.1:19798039-19798049promoter 内 3232-3242 bp - 759 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 19793471-19797280(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCAGCTGTCC
SmilChr03G001234 Chr03 NC_080389.1:14251569-14251579promoter 内 3220-3230 bp - 771 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 14249971-14250798(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AACAGCTGTAA
SmilChr03G003897 Chr03 NC_080389.1:58058079-58058089promoter 内 3200-3210 bp + 791 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 58058880-58058953(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AACAGCTGTAA
SmilChr05G003011 Chr05 NC_080391.1:37338825-37338835promoter 内 3143-3153 bp + 848 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 37337077-37337977(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAT
SmilChr06G000094 Chr06 NC_080392.1:665052-665062promoter 内 2969-2979 bp + 1022 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 666084-670549(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCAGCTGTCC
SmilChr02G003690 Chr02 NC_080388.1:58307278-58307288promoter 内 2934-2944 bp + 1057 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 58303033-58306221(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTTT
SmilChr03G004342 Chr03 NC_080389.1:61720929-61720939promoter 内 2899-2909 bp - 1092 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 61722031-61724488(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAT
SmilChr05G000444 Chr05 NC_080391.1:3378338-3378348promoter 内 2830-2840 bp + 1161 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 3375357-3377177(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGGCAGCTGGT
SmilChr06G002799 Chr06 NC_080392.1:40680942-40680952promoter 内 2801-2811 bp + 1190 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 40682142-40689564(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAAGCTGTCG
SmilChr06G002962 Chr06 NC_080392.1:42406062-42406072promoter 内 2789-2799 bp + 1202 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 42402488-42404860(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGGCAGCTGGT
SmilChr01G003988 Chr01 NC_080387.1:58307123-58307133promoter 内 2733-2743 bp + 1258 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 58308391-58311924(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AACAGCTGTAA
SmilChr02G003837 Chr02 NC_080388.1:60066182-60066192promoter 内 2722-2732 bp - 1269 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 60064419-60064913(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAAGCTGTCG
SmilChr03G004345 Chr03 NC_080389.1:61734305-61734315promoter 内 2722-2732 bp + 1269 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 61735584-61736510(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCTAGCTGTCC
SmilChr04G000373 Chr04 NC_080390.1:3767714-3767724promoter 内 2611-2621 bp + 1380 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 3765168-3766334(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTTT
SmilChr04G000372 Chr04 NC_080390.1:3756938-3756948promoter 内 2610-2620 bp + 1381 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 3754391-3755557(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTTT
SmilChr01G002121 Chr01 NC_080387.1:37220164-37220174promoter 内 2596-2606 bp - 1395 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 37221569-37221931(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAAC
SmilChr07G000530 Chr07 NC_080393.1:3683399-3683409promoter 内 2464-2474 bp - 1527 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 3684936-3686594(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAT
SmilChr01G002504 Chr01 NC_080387.1:42905462-42905472promoter 内 2454-2464 bp - 1537 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 42907009-42908794(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGGCAGCTGGT
SmilChr03G000049 Chr03 NC_080389.1:512023-512033promoter 内 2400-2410 bp + 1591 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 504684-510432(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTTT
SmilChr03G003307 Chr03 NC_080389.1:51277100-51277110promoter 内 2354-2364 bp + 1637 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 51278747-51280247(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCAGCTGTCT
SmilChr06G002858 Chr06 NC_080392.1:41368545-41368555promoter 内 2340-2350 bp + 1651 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 41370206-41373213(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAAGCTGTCG
SmilChr02G005283 Chr02 NC_080388.1:73869771-73869781promoter 内 2313-2323 bp + 1678 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 73866389-73868093(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGTT
SmilChr01G002735 Chr01 NC_080387.1:45692212-45692222promoter 内 2284-2294 bp - 1707 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 45693929-45694047(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAT
SmilChr01G001352 Chr01 NC_080387.1:26800352-26800362promoter 内 2238-2248 bp - 1753 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 26794181-26798599(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AACAGCTGTAA
SmilChr05G003010 Chr05 NC_080391.1:37338825-37338835promoter 内 2235-2245 bp + 1756 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 37335707-37337069(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAT
SmilChr06G003276 Chr06 NC_080392.1:45347965-45347975promoter 内 2234-2244 bp + 1757 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 45341977-45346208(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAAC
SmilChr06G000465 Chr06 NC_080392.1:3801089-3801099promoter 内 2226-2236 bp - 1765 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 3802864-3804811(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGGCAGCTGGT
SmilChr01G005418 Chr01 NC_080387.1:71387330-71387340promoter 内 2223-2233 bp - 1768 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 71389108-71390183(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAT
SmilChr05G000419 Chr05 NC_080391.1:3169711-3169721promoter 内 2207-2217 bp + 1784 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 3164749-3167927(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTTT
SmilChr03G001488 Chr03 NC_080389.1:17951958-17951968promoter 内 2196-2206 bp + 1795 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 17948018-17950163(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTGAA
SmilChr02G002257 Chr02 NC_080388.1:40004217-40004227promoter 内 2159-2169 bp + 1832 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 40006059-40006637(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCAGCTGTCT
SmilChr05G003509 Chr05 NC_080391.1:46862519-46862529promoter 内 2155-2165 bp + 1836 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 46856813-46860683(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGGCAGCTGGT
SmilChr06G002422 Chr06 NC_080392.1:34966257-34966267promoter 内 2115-2125 bp + 1876 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 34968143-34972739(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGCCA
SmilChr07G001542 Chr07 NC_080393.1:12542108-12542118promoter 内 2092-2102 bp + 1899 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 12533866-12540209(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGGCAGCTGGT
SmilChr02G005418 Chr02 NC_080388.1:74642053-74642063promoter 内 2087-2097 bp - 1904 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 74637606-74640149(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AACAGCTGTAA
SmilChr03G004199 Chr03 NC_080389.1:60632672-60632682promoter 内 2057-2067 bp + 1934 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 60627061-60630738(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAAC
SmilChr07G001505 Chr07 NC_080393.1:12012333-12012343promoter 内 2049-2059 bp + 1942 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 12004082-12010391(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGGCAGCTGGT
SmilChr07G000528 Chr07 NC_080393.1:3683399-3683409promoter 内 2044-2054 bp - 1947 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 3679464-3681452(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCAGCTGTCT
SmilChr04G001314 Chr04 NC_080390.1:21004769-21004779promoter 内 1999-2009 bp - 1992 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 21002259-21002777(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCAGCTGTCT
SmilChr07G000698 Chr07 NC_080393.1:4800951-4800961promoter 内 1995-2005 bp - 1996 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 4796029-4798955(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAAGCTGTCG
SmilChr02G000594 Chr02 NC_080388.1:8526547-8526557promoter 内 1939-1949 bp + 2052 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 8523336-8524495(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGGCAGCTGGT
SmilChr07G001120 Chr07 NC_080393.1:8332121-8332131promoter 内 1924-1934 bp + 2067 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 8329205-8330054(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAT
SmilChr07G002838 Chr07 NC_080393.1:28435787-28435797promoter 内 1919-1929 bp - 2072 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 28427582-28433715(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AACAGCTGTAA
SmilChr01G000734 Chr01 NC_080387.1:16301805-16301815promoter 内 1875-1885 bp + 2116 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 16299172-16299689(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGGCAGCTGGT
SmilChr03G003809 Chr03 NC_080389.1:57154314-57154324promoter 内 1871-1881 bp - 2120 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 57149189-57152194(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AACAGCTGTAA
SmilChr07G001513 Chr07 NC_080393.1:12088812-12088822promoter 内 1853-1863 bp - 2138 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 12082291-12086674(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGCCA
SmilChr05G000438 Chr05 NC_080391.1:3321774-3321784promoter 内 1805-1815 bp + 2186 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 3317114-3319588(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTTT