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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G003955; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00019539-RA_Salv SmilChr04G003955 ERF XP_057805828.1 MP00120 GATATTGTCGGTGGT

可能结合的靶基因

7514 个结合位点 6144 个候选靶基因 第 88 / 123 下载 TSV

上一页 88 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G000999 Chr05 NC_080391.1:8111879-8111893promoter 内 492-506 bp - 3495 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 8107229-8108384(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GTCACCGGCGGTGGT
SmilChr06G001092 Chr06 NC_080392.1:10929376-10929390promoter 内 487-501 bp + 3500 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 10932890-10934768(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACTGTCGTCGGTGCG
SmilChr04G004014 Chr04 NC_080390.1:55432027-55432041promoter 内 428-442 bp - 3559 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 55426993-55428468(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TCCGATGGCGGTGGT
SmilChr04G002158 Chr04 NC_080390.1:34646606-34646620promoter 内 419-433 bp - 3568 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 34641264-34643038(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GTCACCGGCGGTGGT
SmilChr02G003087 Chr02 NC_080388.1:51763623-51763637promoter 内 301-315 bp + 3686 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 51758673-51759937(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGCCATGGCT
SmilChr01G001377 Chr01 NC_080387.1:27138254-27138268promoter 内 296-310 bp + 3691 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 27133255-27134563(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GTCACCGACTAAACC
SmilChr01G001860 Chr01 NC_080387.1:33554173-33554187promoter 内 270-284 bp + 3717 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 33557904-33559029(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TGTTTTGTCGGTGTG
SmilChr05G003916 Chr05 NC_080391.1:52884271-52884285promoter 内 267-281 bp - 3720 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 52878754-52880551(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 AGCTTCGTCGGTGTC
SmilChr02G003991 Chr02 NC_080388.1:62206896-62206910promoter 内 235-249 bp - 3752 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 62210662-62215677(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TCCACCGACCTCGGC
SmilChr01G000054 Chr01 NC_080387.1:847475-847489promoter 内 205-219 bp - 3782 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 851271-853373(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GTCACCGACGGTGAA
SmilChr03G004576 Chr03 NC_080389.1:63651885-63651899promoter 内 198-212 bp + 3789 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 63655688-63656368(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GGGACGGTCGGTGGG
SmilChr05G002246 Chr05 NC_080391.1:24133168-24133182promoter 内 198-212 bp - 3789 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 24125645-24129379(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GTCACCGGCGGTGGT
SmilChr02G005316 Chr02 NC_080388.1:74051119-74051133promoter 内 193-207 bp + 3794 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 74044426-74047325(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 AACACCGACAATTTT
SmilChr04G001891 Chr04 NC_080390.1:30877124-30877138promoter 内 187-201 bp + 3800 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 30880938-30891666(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 CTCGGCGGCGGTGGT
SmilChr01G002415 Chr01 NC_080387.1:41528977-41528991promoter 内 172-186 bp - 3815 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 41532806-41533526(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGCCGGTGAC
SmilChr04G001883 Chr04 NC_080390.1:30778442-30778456promoter 内 132-146 bp + 3855 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 30782311-30793000(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 CTCGGCGGCGGTGGT
SmilChr06G001103 Chr06 NC_080392.1:11149494-11149508promoter 内 126-140 bp - 3861 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 11144304-11145633(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GGGGAGGTCGGTGGA
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SmilChr07G000359 Chr07 NC_080393.1:2468839-2468853promoter 内 110-124 bp - 3877 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 2461921-2464962(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 CTCGGCGGCGGTGGT
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SmilChr02G002412 Chr02 NC_080388.1:42092737-42092751promoter 内 61-75 bp + 3926 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 42088118-42088811(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GACACCGACGCGTTC
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SmilChr07G001978 Chr07 NC_080393.1:17381981-17381995promoter 内 54-68 bp - 3933 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 17375426-17378048(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GTCACCGGCGGTGGT
SmilChr05G003971 Chr05 NC_080391.1:53515448-53515462promoter 内 39-53 bp - 3948 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 53503955-53511500(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GTCACCGGCGGTGGT
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SmilChr06G001841 Chr06 NC_080392.1:21604839-21604853promoter 内 16-30 bp - 3971 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 21598542-21600868(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TTCACCGTCGGTGAC
SmilChr06G000464 Chr06 NC_080392.1:3800368-3800382promoter 内 12-26 bp - 3975 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 3793803-3796393(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 CTCGGCGGCGGTGGT
SmilChr01G005089 Chr01 NC_080387.1:68759188-68759202promoter 内 11-25 bp + 3976 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 68763178-68764269(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 AATATTGTCGGTGTT
SmilChr06G000614 Chr06 NC_080392.1:5303761-5303775promoter 内 3389-3403 bp - 598 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 4 5304373-5307830(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TACACCGACATATAC
SmilChr08G003309 Chr08 NC_080394.1:34285703-34285717promoter 内 3400-3414 bp + 587 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 3 34282811-34285116(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGCCAAGTGT
SmilChr08G000558 Chr08 NC_080394.1:4055325-4055339promoter 内 1646-1660 bp - 2341 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 3 4057680-4062131(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 CCCACCGACTCCCCT
SmilChr01G002904 Chr01 NC_080387.1:47739409-47739423promoter 内 3822-3836 bp + 165 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 47739588-47750761(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GTGGTCGGCGGTGGT
SmilChr01G002770 Chr01 NC_080387.1:46145980-46145994promoter 内 3558-3572 bp - 429 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 46144436-46145551(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 CTCGACGTCGGTGCC
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SmilChr04G002943 Chr04 NC_080390.1:45729524-45729538promoter 内 2889-2903 bp - 1098 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 45730636-45732886(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 CCCACCGACCACACG
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SmilChr07G003650 Chr07 NC_080393.1:43330627-43330641promoter 内 3710-3724 bp - 277 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 43330918-43333287(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 CTCACCGACATGGTT
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SmilChr05G003839 Chr05 NC_080391.1:51840655-51840669promoter 内 3457-3471 bp - 530 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 51841199-51845766(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGTCAAAATA
SmilChr08G002751 Chr08 NC_080394.1:27171349-27171363promoter 内 3338-3352 bp + 649 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 27166736-27170700(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TCCACCGACGTCCAA