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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G005851; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00011948-RA_Salv SmilChr01G005851 MYB XP_057789306.1 MP00055 CAGATAAGGT

可能结合的靶基因

9685 个结合位点 6638 个候选靶基因 第 89 / 133 下载 TSV

上一页 89 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G005435 Chr01 NC_080387.1:71486010-71486019promoter 内 103-112 bp - 3889 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 71489908-71490550(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ATCTTATCTG
SmilChr01G001944 Chr01 NC_080387.1:34629158-34629167promoter 内 3983-3992 bp + 9 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 34622560-34629149(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CCATTATCTG
SmilChr01G005304 Chr01 NC_080387.1:70309137-70309146promoter 内 3954-3963 bp + 38 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 70307271-70309099(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AACTTATCTG
SmilChr02G003046 Chr02 NC_080388.1:51250673-51250682promoter 内 3954-3963 bp + 38 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 51250720-51252868(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAATGG
SmilChr01G000702 Chr01 NC_080387.1:15746203-15746212promoter 内 3947-3956 bp - 45 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 15745337-15746158(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 TAGATAAGCT
SmilChr01G005279 Chr01 NC_080387.1:70194568-70194577promoter 内 3927-3936 bp - 65 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 70194642-70199710(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CCATTATCTG
SmilChr02G005332 Chr02 NC_080388.1:74155688-74155697promoter 内 3904-3913 bp - 88 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 74153415-74155600(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 TAGATAAGCT
SmilChr01G002465 Chr01 NC_080387.1:42339251-42339260promoter 内 3894-3903 bp + 98 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 42339358-42340635(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAGAT
SmilChr01G001931 Chr01 NC_080387.1:34472803-34472812promoter 内 3891-3900 bp + 101 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 34472913-34474261(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAGAT
SmilChr02G005190 Chr02 NC_080388.1:73189511-73189520promoter 内 3881-3890 bp + 111 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 73189631-73193461(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 TAGATAAGCT
SmilChr02G001632 Chr02 NC_080388.1:30276835-30276844promoter 内 3874-3883 bp - 118 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 30272237-30276717(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAGAT
SmilChr01G005334 Chr01 NC_080387.1:70544281-70544290promoter 内 3800-3809 bp + 192 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 70542168-70544089(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ATCTTATCTG
SmilChr01G002650 Chr01 NC_080387.1:44827607-44827616promoter 内 3788-3797 bp - 204 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 44825256-44827403(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAGTT
SmilChr01G000141 Chr01 NC_080387.1:2394873-2394882promoter 内 3729-3738 bp + 263 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 2395145-2403224(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAGAT
SmilChr02G003171 Chr02 NC_080388.1:52745592-52745601promoter 内 3696-3705 bp - 296 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 52745190-52745296(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAAGT
SmilChr01G000892 Chr01 NC_080387.1:18978656-18978665promoter 内 3694-3703 bp - 298 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 18964249-18978358(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAGAT
SmilChr03G000277 Chr03 NC_080389.1:3157991-3158000promoter 内 3688-3697 bp + 304 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 3155663-3157687(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ATCTTATCTG
SmilChr02G004436 Chr02 NC_080388.1:66749171-66749180promoter 内 3652-3661 bp + 340 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 66749520-66753009(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAGAT
SmilChr01G001434 Chr01 NC_080387.1:28011550-28011559promoter 内 3636-3645 bp + 356 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 28010553-28011194(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ATCTTATCTG
SmilChr01G001930 Chr01 NC_080387.1:34472803-34472812promoter 内 3621-3630 bp + 371 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 34471363-34472432(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ATCTTATCTG
SmilChr02G005110 Chr02 NC_080388.1:72632036-72632045promoter 内 3599-3608 bp + 393 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 72628655-72631643(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AGCTTATCTA
SmilChr02G005476 Chr02 NC_080388.1:75000051-75000060promoter 内 3551-3560 bp + 441 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 74998728-74999610(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AGCTTATCTA
SmilChr01G005621 Chr01 NC_080387.1:72703284-72703293promoter 内 3521-3530 bp + 471 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 72703764-72706336(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAGAT
SmilChr02G000869 Chr02 NC_080388.1:14927914-14927923promoter 内 3519-3528 bp - 473 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 14928396-14936575(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CCATTATCTG
SmilChr03G000217 Chr03 NC_080389.1:2518100-2518109promoter 内 3508-3517 bp + 484 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 2518593-2525041(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAAGT
SmilChr02G005415 Chr02 NC_080388.1:74623377-74623386promoter 内 3498-3507 bp + 494 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 74623880-74624549(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 TAGATAAGCT
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SmilChr02G000018 Chr02 NC_080388.1:138112-138121promoter 内 3477-3486 bp + 515 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 133440-137597(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ACTTTATCTG
SmilChr01G003616 Chr01 NC_080387.1:54691472-54691481promoter 内 3460-3469 bp - 532 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 54685594-54690940(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAGAT
SmilChr02G002990 Chr02 NC_080388.1:50568115-50568124promoter 内 3444-3453 bp + 548 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 50568672-50577417(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAGAT
SmilChr01G000535 Chr01 NC_080387.1:10896206-10896215promoter 内 3441-3450 bp - 551 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 10891586-10895655(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAGAT
SmilChr01G004103 Chr01 NC_080387.1:59506261-59506270promoter 内 3434-3443 bp + 558 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 59503982-59505703(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AGCTTATCTA
SmilChr01G002510 Chr01 NC_080387.1:42995794-42995803promoter 内 3412-3421 bp + 580 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 42996383-43000308(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAAGT
SmilChr01G002542 Chr01 NC_080387.1:43471981-43471990promoter 内 3408-3417 bp - 584 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 43472574-43473839(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ATCTTATCTG
SmilChr01G003903 Chr01 NC_080387.1:57302103-57302112promoter 内 3405-3414 bp + 587 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 57302699-57302894(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAGTT
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SmilChr02G005567 Chr02 NC_080388.1:75579930-75579939promoter 内 3378-3387 bp - 614 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 75580553-75583002(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ACTTTATCTG
SmilChr01G002776 Chr01 NC_080387.1:46201549-46201558promoter 内 3363-3372 bp - 629 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 46202187-46210470(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CCATTATCTG
SmilChr01G000262 Chr01 NC_080387.1:5084210-5084219promoter 内 3352-3361 bp - 640 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 5059298-5083570(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 TAGATAAGCT
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SmilChr03G000607 Chr03 NC_080389.1:6707751-6707760promoter 内 3273-3282 bp - 719 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 6706463-6707032(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAGAT
SmilChr02G002006 Chr02 NC_080388.1:36195102-36195111promoter 内 3264-3273 bp + 728 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 36195839-36196471(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAGAT
SmilChr02G003690 Chr02 NC_080388.1:58306966-58306975promoter 内 3247-3256 bp + 745 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 58303033-58306221(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AGCTTATCTA
SmilChr01G003001 Chr01 NC_080387.1:48985675-48985684promoter 内 3243-3252 bp - 749 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 48986433-48988887(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AACTTATCTG
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SmilChr02G004577 Chr02 NC_080388.1:68273526-68273535promoter 内 3225-3234 bp - 767 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 68262909-68272759(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAGTT
SmilChr01G003953 Chr01 NC_080387.1:57916578-57916587promoter 内 3218-3227 bp + 774 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 57917361-57918624(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAGAT
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SmilChr03G000376 Chr03 NC_080389.1:4202369-4202378promoter 内 3089-3098 bp + 903 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 4203281-4204678(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAGTT
SmilChr01G003858 Chr01 NC_080387.1:56855618-56855627promoter 内 3068-3077 bp + 924 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 56856551-56860208(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 TAGATAAGCT