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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因，每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G004607; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00002089-RA_Salv SmilChr02G004607 C2H2 XP_057791470.1 MP00608 AAAAACAGAGCA

可能结合的靶基因

9817 个结合位点 6398 个候选靶基因 第 92 / 128 下载 TSV

上一页 92 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G000664 Chr03 NC_080389.1:7436595-7436606promoter 内 46-57 bp + 3944 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 7440550-7442221(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GAAAACAGAAGT
SmilChr01G000355 Chr01 NC_080387.1:7356894-7356905promoter 内 1-12 bp - 3989 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 7344787-7352905(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAAAG
SmilChr02G002562 Chr02 NC_080388.1:44569293-44569304promoter 内 2076-2087 bp + 1914 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 4 44564245-44567379(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGCTCTGTCCCT
SmilChr01G000122 Chr01 NC_080387.1:2050613-2050624promoter 内 3500-3511 bp - 490 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 2 2051114-2052985(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGCTCTGTCCCT
SmilChr01G003508 Chr01 NC_080387.1:53665695-53665706promoter 内 3268-3279 bp - 722 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 2 53666428-53671839(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GCTTCTGTTTTA
SmilChr02G000145 Chr02 NC_080388.1:1937514-1937525promoter 内 3106-3117 bp - 884 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 2 1938409-1944296(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGCTCTGTTTAG
SmilChr02G003650 Chr02 NC_080388.1:57888686-57888697promoter 内 1739-1750 bp + 2251 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 2 57880193-57886435(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CATTCTGTTTTC
SmilChr02G004119 Chr02 NC_080388.1:63471538-63471549promoter 内 1541-1552 bp - 2449 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 2 63473998-63478395(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CATTCTGTTTCC
SmilChr03G001754 Chr03 NC_080389.1:23818494-23818505promoter 内 641-652 bp - 3349 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 2 23821854-23824307(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GCTTCTGTTTTA
SmilChr01G000101 Chr01 NC_080387.1:1821274-1821285promoter 内 464-475 bp + 3526 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 2 1814760-1817748(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGCTCTGTCCCT
SmilChr03G001565 Chr03 NC_080389.1:19791050-19791061promoter 内 260-271 bp + 3730 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 2 19787214-19787320(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGCTCTGTCCCT
SmilChr03G001222 Chr03 NC_080389.1:14086489-14086500promoter 内 134-145 bp - 3856 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 2 14078360-14082633(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGGGACAGAGCG
SmilChr01G004959 Chr01 NC_080387.1:67687453-67687464promoter 内 3807-3818 bp + 183 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 67687647-67692378(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CTAAACAGAGCG
SmilChr02G004487 Chr02 NC_080388.1:67377430-67377441promoter 内 3660-3671 bp - 330 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 67375579-67377100(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CTAAACAGAGCG
SmilChr01G005832 Chr01 NC_080387.1:74331221-74331232promoter 内 3583-3594 bp + 407 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 74331639-74338489(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TAAAACAGAAGC
SmilChr01G005862 Chr01 NC_080387.1:74559737-74559748promoter 内 2896-2907 bp - 1094 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 74552627-74558643(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAAACAGAAGC
SmilChr01G001281 Chr01 NC_080387.1:25595579-25595590promoter 内 2799-2810 bp - 1191 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 25596781-25598648(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGCTCTGTTTAG
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SmilChr02G001621 Chr02 NC_080388.1:30151681-30151692promoter 内 1950-1961 bp - 2040 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 30153732-30155286(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GCTTCTGTTTCA
SmilChr01G000577 Chr01 NC_080387.1:11989352-11989363promoter 内 1406-1417 bp + 2584 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 11991947-11992411(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CATAACAGAGGA
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SmilChr01G001722 Chr01 NC_080387.1:31728981-31728992promoter 内 1054-1065 bp + 2936 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 31731928-31733705(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAAACAGAAGC
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SmilChr01G001799 Chr01 NC_080387.1:32863648-32863659promoter 内 883-894 bp + 3107 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 32866766-32868592(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAAACAGAAGC
SmilChr02G004117 Chr02 NC_080388.1:63471538-63471549promoter 内 808-819 bp - 3182 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 63462544-63468356(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GGAAACAGAATG
SmilChr03G000941 Chr03 NC_080389.1:10692661-10692672promoter 内 734-745 bp + 3256 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 10695928-10697625(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAAACAGAAGC
SmilChr02G002352 Chr02 NC_080388.1:41314845-41314856promoter 内 732-743 bp - 3258 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 41309914-41311587(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GAAAACAGAATG
SmilChr02G005485 Chr02 NC_080388.1:75049024-75049035promoter 内 661-672 bp + 3329 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 75044541-75045695(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GCTTCTGTTTCA
SmilChr02G002346 Chr02 NC_080388.1:41238881-41238892promoter 内 523-534 bp - 3467 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 41234565-41235414(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GGAAACAGAATG
SmilChr01G003291 Chr01 NC_080387.1:51610817-51610828promoter 内 506-517 bp - 3484 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 51604540-51607333(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGGGACAGAGCG
SmilChr01G003530 Chr01 NC_080387.1:53925143-53925154promoter 内 491-502 bp - 3499 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 53928653-53930473(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TCCTCTGTTATG
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SmilChr01G005655 Chr01 NC_080387.1:72901407-72901418promoter 内 326-337 bp + 3664 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 72905082-72906357(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGATGCAGAGCA
SmilChr01G003062 Chr01 NC_080387.1:49503933-49503944promoter 内 155-166 bp + 3835 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 49495889-49500098(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GCTTCTGTTTCA
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SmilChr01G000884 Chr01 NC_080387.1:18819194-18819205promoter 内 3876-3887 bp - 114 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 18818467-18819080(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AATAGCAGAGCA
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SmilChr01G000660 Chr01 NC_080387.1:14724409-14724420promoter 内 1729-1740 bp - 2261 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 14726681-14734421(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCATCC
SmilChr01G003246 Chr01 NC_080387.1:51193946-51193957promoter 内 689-700 bp - 3301 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 51197258-51198600(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCTACT
SmilChr03G000885 Chr03 NC_080389.1:10049980-10049991promoter 内 3535-3546 bp - 455 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 10042909-10049525(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GGTAACAGAGGA
SmilChr01G005137 Chr01 NC_080387.1:69160286-69160297promoter 内 3467-3478 bp - 523 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 69160820-69162997(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCATTG
SmilChr01G003983 Chr01 NC_080387.1:58284019-58284030promoter 内 3458-3469 bp + 532 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 58281499-58283487(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCTTAG
SmilChr02G002056 Chr02 NC_080388.1:37006689-37006700promoter 内 3368-3379 bp - 622 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 37004239-37006067(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AATAGCAGAGCA
SmilChr01G004535 Chr01 NC_080387.1:63516300-63516311promoter 内 3361-3372 bp - 629 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 63516940-63520314(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TCCTCTGTTTAA
SmilChr01G000505 Chr01 NC_080387.1:10225231-10225242promoter 内 3323-3334 bp - 667 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 10222400-10224564(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AATAGCAGAGCA
SmilChr02G005358 Chr02 NC_080388.1:74302615-74302626promoter 内 3320-3331 bp + 670 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 74303296-74303367(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AATAGCAGAGCA
SmilChr02G005091 Chr02 NC_080388.1:72500221-72500232promoter 内 3119-3130 bp - 871 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 72501103-72503096(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTTCAG
SmilChr02G002844 Chr02 NC_080388.1:48577170-48577181promoter 内 3089-3100 bp - 901 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 48578082-48580292(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TCCTCTGTTATC