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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G000040; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00000579-RA_Salv SmilChr04G000040 ERF XP_057808382.1 MP00312 AATTGTCGGTGGAGT

可能结合的靶基因

8490 个结合位点 7006 个候选靶基因 第 92 / 141 下载 TSV

上一页 92 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr08G002415 Chr08 NC_080394.1:22958128-22958142promoter 内 3601-3615 bp - 386 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 22958528-22963101(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGGCGGCCGACAACT
SmilChr01G004890 Chr01 NC_080387.1:66953022-66953036promoter 内 3511-3525 bp - 476 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 66950196-66952546(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CAGTGTCGGTTCAGT
SmilChr01G004401 Chr01 NC_080387.1:62133123-62133137promoter 内 3500-3514 bp - 487 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 62133624-62135549(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TAATCACCGACGGCA
SmilChr07G003044 Chr07 NC_080393.1:31558136-31558150promoter 内 3497-3511 bp - 490 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 31556424-31557646(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GTGTGTCGGTAGATA
SmilChr07G000730 Chr07 NC_080393.1:5089813-5089827promoter 内 3483-3497 bp - 504 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 5083408-5089309(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TGCCGTCGGTGATTA
SmilChr02G003233 Chr02 NC_080388.1:53602446-53602460promoter 内 3466-3480 bp - 521 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 53600462-53601925(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCGTGGCGGTGGACT
SmilChr05G001276 Chr05 NC_080391.1:10913788-10913802promoter 内 3454-3468 bp - 533 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 10910348-10913255(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 AAATGTCGGTGCATA
SmilChr01G005529 Chr01 NC_080387.1:72153621-72153635promoter 内 3399-3413 bp + 588 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 72149820-72153033(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 ACGTGACCGACACAA
SmilChr07G003798 Chr07 NC_080393.1:46776590-46776604promoter 内 3357-3371 bp - 630 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 46765445-46775960(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TTGCGGCGGTGGAGA
SmilChr06G001564 Chr06 NC_080392.1:17088781-17088795promoter 内 3354-3368 bp - 633 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 17089428-17091676(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 AATCCACCGCCGCCG
SmilChr08G002480 Chr08 NC_080394.1:23708013-23708027promoter 内 3351-3365 bp - 636 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 23706326-23707377(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCGTGGCGGTGGAAA
SmilChr02G002261 Chr02 NC_080388.1:40052110-40052124promoter 内 3316-3330 bp + 671 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 40049104-40051439(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TAGTCACCGACGGAC
SmilChr02G000231 Chr02 NC_080388.1:2988984-2988998promoter 内 3297-3311 bp - 690 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 2987045-2988294(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TTGTGTCGGTTGCTT
SmilChr04G002919 Chr04 NC_080390.1:45418031-45418045promoter 内 3246-3260 bp + 741 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 45418786-45420645(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TAATGTCGGTGCATT
SmilChr02G005026 Chr02 NC_080388.1:72001802-72001816promoter 内 3243-3257 bp + 744 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 72002560-72007132(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TGTCGTCGGTGATCA
SmilChr04G002945 Chr04 NC_080390.1:45788498-45788512promoter 内 3188-3202 bp + 799 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 45789311-45796067(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TTATGTCGGTGTCCG
SmilChr04G002946 Chr04 NC_080390.1:45795640-45795654promoter 内 3164-3178 bp + 823 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 45793024-45794817(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 ACAGCACCGACTCCA
SmilChr08G001951 Chr08 NC_080394.1:17169267-17169281promoter 内 3149-3163 bp + 838 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 17170119-17176994(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCCTGGCGGTGGATG
SmilChr03G000569 Chr03 NC_080389.1:6197986-6198000promoter 内 3132-3146 bp + 855 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 6198855-6199947(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GGCGGTCGGTGGCGG
SmilChr04G003879 Chr04 NC_080390.1:54646456-54646470promoter 内 3113-3127 bp - 874 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 54642432-54645582(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TCGCGTCGGTGTAGT
SmilChr07G000965 Chr07 NC_080393.1:6972930-6972944promoter 内 3093-3107 bp - 894 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 6966219-6972036(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 ATGTGTCGGTGTGCA
SmilChr07G001258 Chr07 NC_080393.1:9695246-9695260promoter 内 3038-3052 bp - 949 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 9692028-9694297(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 ATGAGTCGGTGGAAC
SmilChr05G003068 Chr05 NC_080391.1:38560652-38560666promoter 内 2971-2985 bp + 1016 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 38559289-38559636(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 ACAACACCGACGACC
SmilChr07G002962 Chr07 NC_080393.1:30101460-30101474promoter 内 2965-2979 bp - 1022 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 30102496-30103729(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CAACAACCGACAGAG
SmilChr03G003355 Chr03 NC_080389.1:51865663-51865677promoter 内 2884-2898 bp + 1103 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 51866780-51873414(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GGCCGTCGGTGAATT
SmilChr08G002413 Chr08 NC_080394.1:22919407-22919421promoter 内 2874-2888 bp - 1113 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 22917547-22918294(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TAGTGTCGGTTATGG
SmilChr05G001213 Chr05 NC_080391.1:10199526-10199540promoter 内 2854-2868 bp - 1133 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 10197398-10198393(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TGGCGGCGGTGGATG
SmilChr07G001065 Chr07 NC_080393.1:7848114-7848128promoter 内 2819-2833 bp + 1168 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 7844832-7846946(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTCCACCGTCGTCG
SmilChr08G000411 Chr08 NC_080394.1:2903671-2903685promoter 内 2719-2733 bp + 1268 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 2904953-2910765(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TGGCGGCGGTGGATG
SmilChr05G000245 Chr05 NC_080391.1:1881499-1881513promoter 内 2714-2728 bp - 1273 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 1875483-1880226(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 AAGTGGCGGTGGAAC
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SmilChr02G001039 Chr02 NC_080388.1:18481945-18481959promoter 内 2655-2669 bp + 1332 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 18483291-18489780(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TCGCGTCGGTGTAGT
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SmilChr08G003699 Chr08 NC_080394.1:41440862-41440876promoter 内 2603-2617 bp + 1384 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 41442260-41443227(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GGCGGTCGGTGGCGG
SmilChr03G001348 Chr03 NC_080389.1:15723061-15723075promoter 内 2599-2613 bp + 1388 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 15718797-15721673(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 ACTGAACCGACACTG
SmilChr02G002344 Chr02 NC_080388.1:41179028-41179042promoter 内 2586-2600 bp - 1401 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 41180443-41183329(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 AATCCACCGCCGCCG
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SmilChr04G003351 Chr04 NC_080390.1:50125364-50125378promoter 内 2559-2573 bp + 1428 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 50121532-50123936(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 AATCCACCGCCGCCG
SmilChr02G002717 Chr02 NC_080388.1:47009738-47009752promoter 内 2548-2562 bp - 1439 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 47011191-47012495(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TGGACACCGACAAAA
SmilChr05G003661 Chr05 NC_080391.1:49334904-49334918promoter 内 2489-2503 bp + 1498 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 49329933-49333406(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 ACTCCACCGTCAATA
SmilChr02G005194 Chr02 NC_080388.1:73210682-73210696promoter 内 2472-2486 bp + 1515 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 73208114-73209167(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 ATTTCACCGACGAAT
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SmilChr04G000845 Chr04 NC_080390.1:10686446-10686460promoter 内 2248-2262 bp - 1739 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 10688199-10689450(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 ACTCAACCGACAAAA
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SmilChr01G001957 Chr01 NC_080387.1:34835872-34835886promoter 内 2066-2080 bp - 1921 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 34837807-34859598(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 ACAGCACCGACTCCA