转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003955; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00007215-RA_Salv SmilChr01G003955 WRKY XP_057779712.1 MP00450 AGCGTTGACTTTTT

可能结合的靶基因

9901 个结合位点 8044 个候选靶基因 第 93 / 161 下载 TSV

上一页 93 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr07G004180 Chr07 NC_080393.1:53742444-53742457promoter 内 998-1011 bp - 2990 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 53745447-53747042(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TTATAGTCAACGCG
SmilChr02G003936 Chr02 NC_080388.1:61439008-61439021promoter 内 982-995 bp + 3006 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 61434867-61436002(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 CAAAAGTCAAAACT
SmilChr07G004283 Chr07 NC_080393.1:55380283-55380296promoter 内 964-977 bp + 3024 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 55371845-55377259(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 CAAAAGTCAAAACT
SmilChr03G000308 Chr03 NC_080389.1:3523469-3523482promoter 内 882-895 bp + 3106 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 3517678-3520363(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TTATAGTCAACGCG
SmilChr04G002753 Chr04 NC_080390.1:43242546-43242559promoter 内 849-862 bp + 3139 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 43228900-43239407(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 AAGAAGTCAAAGTT
SmilChr01G001541 Chr01 NC_080387.1:29430284-29430297promoter 内 830-843 bp + 3158 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 29433455-29433526(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 ATATTTGACTTTTA
SmilChr02G000372 Chr02 NC_080388.1:4709941-4709954promoter 内 824-837 bp - 3164 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 4713118-4719768(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 AAAGAGTCAACCAC
SmilChr04G001194 Chr04 NC_080390.1:18272020-18272033promoter 内 817-830 bp + 3171 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 18275204-18281066(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TGGTTTGACTTTCT
SmilChr01G001524 Chr01 NC_080387.1:29200187-29200200promoter 内 748-761 bp - 3240 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 29203440-29206343(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 CAAAAGTCAAAACT
SmilChr06G001248 Chr06 NC_080392.1:12976590-12976603promoter 内 714-727 bp - 3274 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 12972954-12973316(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 AGTTTTGACTTTTG
SmilChr04G004013 Chr04 NC_080390.1:55421820-55421833promoter 内 672-685 bp + 3316 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 55425149-55427025(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 GGTGTTGACTTCCC
SmilChr06G000211 Chr06 NC_080392.1:1420139-1420152promoter 内 670-683 bp - 3318 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 1423470-1426365(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TAAAAGTCAAACTC
SmilChr07G003292 Chr07 NC_080393.1:34689430-34689443promoter 内 665-678 bp - 3323 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 34682889-34686107(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TCCATTGACTTTTT
SmilChr06G002133 Chr06 NC_080392.1:28731279-28731292promoter 内 656-669 bp + 3332 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 28726910-28727947(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 GAGTAGTCAACGCT
SmilChr08G000385 Chr08 NC_080394.1:2712224-2712237promoter 内 614-627 bp + 3374 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 2702802-2708850(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 CAAATGTCAACGTG
SmilChr02G001565 Chr02 NC_080388.1:28963959-28963972promoter 内 606-619 bp + 3382 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 28967354-28969139(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 AGTTTTGACTTTTG
SmilChr07G000039 Chr07 NC_080393.1:166503-166516promoter 内 539-552 bp + 3449 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 169965-173166(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TTCGTTGACTATCA
SmilChr01G000162 Chr01 NC_080387.1:2698389-2698402promoter 内 519-532 bp - 3469 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 2701871-2702522(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 AAAAAGTCAATGGA
SmilChr02G004414 Chr02 NC_080388.1:66495206-66495219promoter 内 457-470 bp + 3531 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 66486928-66491675(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 AAAAAGTCAATGGA
SmilChr05G002695 Chr05 NC_080391.1:30785421-30785434promoter 内 397-410 bp - 3591 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 30789025-30790187(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TATAAGTCAACCAG
SmilChr05G001356 Chr05 NC_080391.1:12070917-12070930promoter 内 367-380 bp - 3621 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 12074551-12075985(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TAAAAGTCAAATGG
SmilChr05G000774 Chr05 NC_080391.1:6039243-6039256promoter 内 309-322 bp + 3679 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 6034367-6035564(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TAAAAGTCAAACTC
SmilChr06G002982 Chr06 NC_080392.1:42622948-42622961promoter 内 273-286 bp - 3715 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 42626676-42628672(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TAAAAGTCAAATAT
SmilChr07G003145 Chr07 NC_080393.1:33343194-33343207promoter 内 244-257 bp + 3744 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 33346951-33349902(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 GACGTTGACTTGAG
SmilChr07G002105 Chr07 NC_080393.1:19148242-19148255promoter 内 240-253 bp - 3748 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 19152003-19156324(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TAAAAGTCAAATAT
SmilChr07G001748 Chr07 NC_080393.1:14818156-14818169promoter 内 237-250 bp + 3751 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 14821920-14824006(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 CCATTTGACTTTTA
SmilChr03G001332 Chr03 NC_080389.1:15563145-15563158promoter 内 216-229 bp + 3772 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 15559292-15559373(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 ATTAAGTCAACCCT
SmilChr02G001149 Chr02 NC_080388.1:20914997-20915010promoter 内 129-142 bp - 3859 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 20918869-20924304(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 ACGAAGTCAACCTA
SmilChr07G002029 Chr07 NC_080393.1:18314588-18314601promoter 内 108-121 bp + 3880 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 18318481-18319237(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 AGTTTTGACTTTTG
SmilChr01G004785 Chr01 NC_080387.1:66058381-66058394promoter 内 71-84 bp + 3917 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 66062311-66064074(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 ACCGTTGACCTCGG
SmilChr02G000967 Chr02 NC_080388.1:16892607-16892620promoter 内 26-39 bp + 3962 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 16885478-16888645(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 CCATAGTCAACCCT
SmilChr05G002623 Chr05 NC_080391.1:29563878-29563891promoter 内 1-14 bp + 3987 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 29557008-29559891(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TATAAGTCAACCAG
SmilChr05G003338 Chr05 NC_080391.1:43830047-43830060promoter 内 3703-3716 bp - 285 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 4 43828170-43829762(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 GAATTTGACTTTGT
SmilChr06G000342 Chr06 NC_080392.1:2564069-2564082promoter 内 2721-2734 bp - 1267 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 4 2565349-2567265(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 ACAAAGTCAAATTC
SmilChr02G000265 Chr02 NC_080388.1:3424356-3424369promoter 内 1588-1601 bp + 2400 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 4 3426769-3427796(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 GAATTTGACTTTGT
SmilChr05G003337 Chr05 NC_080391.1:43830047-43830060promoter 内 1588-1601 bp - 2400 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 4 43826620-43827647(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 GAATTTGACTTTGT
SmilChr02G004459 Chr02 NC_080388.1:67016027-67016040promoter 内 3840-3853 bp + 148 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 3 66989070-67015879(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 AAAAAGTCAAATTA
SmilChr07G001798 Chr07 NC_080393.1:15354843-15354856promoter 内 3703-3716 bp - 285 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 3 15351597-15354558(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 CGCGTTGACCTCCG
SmilChr06G000088 Chr06 NC_080392.1:632387-632400promoter 内 2995-3008 bp - 993 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 3 633393-635237(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TCCAAGTCAACGTT
SmilChr07G003043 Chr07 NC_080393.1:31550410-31550423promoter 内 2934-2947 bp + 1054 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 3 31544367-31549356(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 AAGAAGTCAACAAA
SmilChr03G000089 Chr03 NC_080389.1:1012457-1012470promoter 内 2677-2690 bp + 1311 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 3 1013781-1017093(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 GCAGTTGACTTAAT
SmilChr04G002740 Chr04 NC_080390.1:43071297-43071310promoter 内 1281-1294 bp - 2707 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 3 43068506-43068590(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 AGCGTTGGCCTTTG
SmilChr06G000089 Chr06 NC_080392.1:632387-632400promoter 内 1094-1107 bp - 2894 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 3 635294-636451(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TCCAAGTCAACGTT
SmilChr04G001622 Chr04 NC_080390.1:26990551-26990564promoter 内 3803-3816 bp - 185 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 26990749-26993464(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 GGAAAGTCAAATGC
SmilChr02G002912 Chr02 NC_080388.1:49420481-49420494promoter 内 3768-3781 bp - 220 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 49416026-49420261(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 GAATTTGACTTTGT
SmilChr01G000393 Chr01 NC_080387.1:8074507-8074520promoter 内 3762-3775 bp - 226 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 8068297-8074281(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 CAGTTTGACTTTTG
SmilChr04G002926 Chr04 NC_080390.1:45540923-45540936promoter 内 3726-3739 bp + 262 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 45536303-45540661(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 AAAAAGTCAAATTA
SmilChr05G002328 Chr05 NC_080391.1:25133924-25133937promoter 内 3709-3722 bp - 279 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 25134216-25139725(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 CGAAAGTCAAATCA
SmilChr07G004364 Chr07 NC_080393.1:56185531-56185544promoter 内 3664-3677 bp - 324 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 56185868-56188598(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 GAGAAGTCAACAAT
SmilChr02G002411 Chr02 NC_080388.1:42085814-42085827promoter 内 3239-3252 bp - 749 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 42084993-42085065(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 AACGTTGACTTGGA