转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 96 / 143 下载 TSV

上一页 96 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr08G000647 Chr08 NC_080394.1:4812552-4812563promoter 内 1469-1480 bp + 2521 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 4815084-4816329(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACTACAGCTGAT
SmilChr08G000646 Chr08 NC_080394.1:4812552-4812563promoter 内 1173-1184 bp + 2817 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 4809655-4809735(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTAGT
SmilChr02G001558 Chr02 NC_080388.1:28870022-28870033promoter 内 1059-1070 bp + 2931 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 28865728-28867091(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTAGT
SmilChr01G003795 Chr01 NC_080387.1:56342070-56342081promoter 内 910-921 bp - 3080 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 56336337-56338990(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTCAA
SmilChr02G004602 Chr02 NC_080388.1:68541409-68541420promoter 内 902-913 bp + 3088 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 68537309-68538321(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CATAGCTGTCCT
SmilChr03G003264 Chr03 NC_080389.1:50557290-50557301promoter 内 742-753 bp - 3248 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 50560549-50561271(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTACA
SmilChr07G002060 Chr07 NC_080393.1:18743116-18743127promoter 内 710-721 bp + 3280 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 18746407-18751276(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTGCT
SmilChr07G004084 Chr07 NC_080393.1:52355777-52355788promoter 内 704-715 bp - 3286 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 52349907-52352491(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGTACAGCTGTT
SmilChr03G004336 Chr03 NC_080389.1:61707192-61707203promoter 内 684-695 bp + 3306 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 61697804-61703886(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGCAGCTGTCAC
SmilChr04G004159 Chr04 NC_080390.1:56271122-56271133promoter 内 463-474 bp + 3527 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 56274660-56278615(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTATT
SmilChr05G003537 Chr05 NC_080391.1:47226637-47226648promoter 内 178-189 bp + 3812 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 47230460-47230873(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATAACAGCTGGA
SmilChr07G003336 Chr07 NC_080393.1:35739804-35739815promoter 内 3957-3968 bp - 33 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 35739848-35741977(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTACT
SmilChr03G000234 Chr03 NC_080389.1:2797622-2797633promoter 内 3903-3914 bp + 87 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 2794881-2797535(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTTCAC
SmilChr07G001563 Chr07 NC_080393.1:12801993-12802004promoter 内 3794-3805 bp - 196 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 12802200-12803344(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCTT
SmilChr07G001562 Chr07 NC_080393.1:12792464-12792475promoter 内 3735-3746 bp - 255 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 12792730-12793785(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCTT
SmilChr02G002179 Chr02 NC_080388.1:39014556-39014567promoter 内 3711-3722 bp - 279 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 39013190-39014277(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGTACAGCTGTG
SmilChr01G001399 Chr01 NC_080387.1:27491581-27491592promoter 内 3705-3716 bp + 285 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 27490289-27491296(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCTT
SmilChr07G001185 Chr07 NC_080393.1:9011988-9011999promoter 内 3686-3697 bp - 304 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 9012303-9018089(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACTAGCTGTCCT
SmilChr02G003878 Chr02 NC_080388.1:60842657-60842668promoter 内 3598-3609 bp + 392 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 60843060-60846333(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTCAA
SmilChr01G005411 Chr01 NC_080387.1:71347526-71347537promoter 内 3563-3574 bp + 427 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 71347964-71351252(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTCAT
SmilChr04G004158 Chr04 NC_080390.1:56271122-56271133promoter 内 3551-3562 bp + 439 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 56271572-56274371(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTATT
SmilChr07G001599 Chr07 NC_080393.1:13322892-13322903promoter 内 3525-3536 bp - 465 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 13319461-13322427(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGGACAGCTAGT
SmilChr02G000656 Chr02 NC_080388.1:9969873-9969884promoter 内 3418-3429 bp - 572 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 9968660-9969301(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACTACAGCTGAT
SmilChr06G003280 Chr06 NC_080392.1:45360966-45360977promoter 内 3417-3428 bp + 573 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 45357299-45360393(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGATG
SmilChr07G003593 Chr07 NC_080393.1:41997400-41997411promoter 内 3199-3210 bp - 791 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 41998202-42003218(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCTT
SmilChr02G002868 Chr02 NC_080388.1:48876450-48876461promoter 内 3068-3079 bp + 922 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 48877383-48880617(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGAAAGCTGTA
SmilChr01G003245 Chr01 NC_080387.1:51189522-51189533promoter 内 3062-3073 bp + 928 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 51190461-51192069(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTCAA
SmilChr06G002994 Chr06 NC_080392.1:42828872-42828883promoter 内 2915-2926 bp - 1075 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 42829958-42834168(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGAGCTGTCTC
SmilChr01G000052 Chr01 NC_080387.1:833735-833746promoter 内 2911-2922 bp + 1079 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 830932-832656(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGAGCTGTCTC
SmilChr02G004226 Chr02 NC_080388.1:64476932-64476943promoter 内 2568-2579 bp - 1422 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 64478365-64486743(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGATG
SmilChr05G000011 Chr05 NC_080391.1:54248-54259promoter 内 2536-2547 bp - 1454 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 48990-52794(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTAACAGCTGGG
SmilChr04G000935 Chr04 NC_080390.1:12218461-12218472promoter 内 2419-2430 bp + 1571 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 12215541-12216890(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCCG
SmilChr05G000480 Chr05 NC_080391.1:3752972-3752983promoter 内 2276-2287 bp + 1714 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 3741736-3751258(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CATAGCTGTCCT
SmilChr02G000366 Chr02 NC_080388.1:4671502-4671513promoter 内 2249-2260 bp - 1741 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 4673254-4673950(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGCAGCTGTCAC
SmilChr03G001319 Chr03 NC_080389.1:15461525-15461536promoter 内 2218-2229 bp + 1772 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 15458438-15459753(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTAGT
SmilChr08G003533 Chr08 NC_080394.1:37944857-37944868promoter 内 2191-2202 bp - 1799 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 37946667-37948333(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTAGG
SmilChr03G001423 Chr03 NC_080389.1:16860428-16860439promoter 内 2189-2200 bp + 1801 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 16857776-16858627(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTAGT
SmilChr05G001946 Chr05 NC_080391.1:19822442-19822453promoter 内 1995-2006 bp - 1995 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 19824448-19825367(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTTCAC
SmilChr05G000707 Chr05 NC_080391.1:5326215-5326226promoter 内 1969-1980 bp + 2021 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 5328247-5332836(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTCAA
SmilChr04G000695 Chr04 NC_080390.1:8131329-8131340promoter 内 1954-1965 bp - 2036 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 8127825-8129293(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGACAGCTAAT
SmilChr04G000513 Chr04 NC_080390.1:5637491-5637502promoter 内 1893-1904 bp + 2097 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 5634144-5635394(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTTCAC
SmilChr02G002405 Chr02 NC_080388.1:41965917-41965928promoter 内 1874-1885 bp - 2116 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 41968044-41971926(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGAGCTGTCCG
SmilChr08G003097 Chr08 NC_080394.1:31151998-31152009promoter 内 1831-1842 bp + 2159 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 31154168-31157533(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGGACAGCTATG
SmilChr08G001140 Chr08 NC_080394.1:8991110-8991121promoter 内 1805-1816 bp + 2185 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 8984938-8988925(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CATAGCTGTCCT
SmilChr08G000697 Chr08 NC_080394.1:5178136-5178147promoter 内 1801-1812 bp + 2189 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 5175327-5175947(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATAGCTGTCCA
SmilChr02G003389 Chr02 NC_080388.1:55017521-55017532promoter 内 1727-1738 bp - 2263 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 55011354-55015258(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTCAT
SmilChr04G002004 Chr04 NC_080390.1:32439805-32439816promoter 内 1689-1700 bp + 2301 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 32435983-32437504(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTTCAC
SmilChr07G000161 Chr07 NC_080393.1:964874-964885promoter 内 1598-1609 bp + 2392 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 960392-962482(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGAGCTGTCTC
SmilChr01G001714 Chr01 NC_080387.1:31610857-31610868promoter 内 1580-1591 bp - 2410 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 31605432-31608447(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTCAT
SmilChr01G005410 Chr01 NC_080387.1:71347526-71347537promoter 内 1546-1557 bp + 2444 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 71345009-71345082(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAGCTGTCGG