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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004199; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010571-RA_Salv SmilChr01G004199 bHLH XP_057782208.1 MP00074 AGAAGGTCACGTGG

可能结合的靶基因

9969 个结合位点 7396 个候选靶基因 第 97 / 148 下载 TSV

上一页 97 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G002353 Chr06 NC_080392.1:34227330-34227343promoter 内 654-667 bp + 3334 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 34230677-34230782(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTCTTTTCACGTGG
SmilChr02G002553 Chr02 NC_080388.1:44422157-44422170promoter 内 587-600 bp + 3401 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 44425571-44436481(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATCATCTCACGTGA
SmilChr05G003082 Chr05 NC_080391.1:38953591-38953604promoter 内 587-600 bp - 3401 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 38957005-38979398(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAAAAGAC
SmilChr05G002784 Chr05 NC_080391.1:32543258-32543271promoter 内 559-572 bp + 3429 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 32546700-32546806(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTCTTTTCACGTGG
SmilChr07G004078 Chr07 NC_080393.1:52224641-52224654promoter 内 440-453 bp - 3548 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 52228202-52230806(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAAAAGAC
SmilChr03G001958 Chr03 NC_080389.1:27996792-27996805promoter 内 430-443 bp - 3558 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 27992014-27993234(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTCTTTTCACGTGG
SmilChr02G001018 Chr02 NC_080388.1:17953822-17953835promoter 内 425-438 bp + 3563 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 17957398-17959035(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTTGGTTCACGTGT
SmilChr06G000786 Chr06 NC_080392.1:7377706-7377719promoter 内 402-415 bp - 3586 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 7381305-7391870(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTTGTCTA
SmilChr03G001033 Chr03 NC_080389.1:12027953-12027966promoter 内 399-412 bp + 3589 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 12031555-12031661(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTCTTTTCACGTGG
SmilChr03G000004 Chr03 NC_080389.1:53175-53188promoter 内 395-408 bp + 3593 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 48274-49582(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGACAATCG
SmilChr07G003012 Chr07 NC_080393.1:30970934-30970947promoter 内 348-361 bp - 3640 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 30963572-30967294(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTTGGTTCACGTGT
SmilChr01G000122 Chr01 NC_080387.1:2047460-2047473promoter 内 347-360 bp + 3641 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 2051114-2052985(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTCTTTTCACGTGG
SmilChr05G002863 Chr05 NC_080391.1:34144584-34144597promoter 内 324-337 bp - 3664 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 34148261-34149547(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAAAAGAC
SmilChr04G000693 Chr04 NC_080390.1:8084198-8084211promoter 内 310-323 bp - 3678 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 8077173-8080520(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTCTTTTCACGTGG
SmilChr01G001117 Chr01 NC_080387.1:22810366-22810379promoter 内 282-295 bp + 3706 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 22804136-22806660(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAAAAGAC
SmilChr06G002070 Chr06 NC_080392.1:27311497-27311510promoter 内 259-272 bp - 3729 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 27315239-27318545(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAAAAGAC
SmilChr01G006053 Chr01 NC_080387.1:76022923-76022936promoter 内 256-269 bp + 3732 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 76018001-76019191(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGACGTCG
SmilChr04G001414 Chr04 NC_080390.1:23007150-23007163promoter 内 204-217 bp + 3784 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 22995943-23003366(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCTTAGCC
SmilChr04G002857 Chr04 NC_080390.1:44677266-44677279promoter 内 174-187 bp + 3814 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 44681093-44683097(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTTGGTTCACGTGT
SmilChr08G000869 Chr08 NC_080394.1:6439056-6439069promoter 内 136-149 bp + 3852 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 6442921-6447219(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGGCTTACACGTGG
SmilChr03G002108 Chr03 NC_080389.1:32806411-32806424promoter 内 87-100 bp + 3901 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 32799689-32802510(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAAAAGAC
SmilChr01G000120 Chr01 NC_080387.1:2047460-2047473promoter 内 55-68 bp + 3933 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 2043018-2043527(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAAAAGAC
SmilChr02G005269 Chr02 NC_080388.1:73776888-73776901promoter 内 3886-3899 bp + 102 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 73772664-73776786(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCAATTA
SmilChr04G003962 Chr04 NC_080390.1:55127359-55127372promoter 内 3546-3559 bp + 442 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 55127814-55127886(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGATTCCCACGTGG
SmilChr06G002164 Chr06 NC_080392.1:29761664-29761677promoter 内 3424-3437 bp - 564 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 29762241-29766561(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGAGACACG
SmilChr03G001972 Chr03 NC_080389.1:28415303-28415316promoter 内 3349-3362 bp - 639 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 28415955-28416551(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCTGATT
SmilChr03G001003 Chr03 NC_080389.1:11348039-11348052promoter 内 3299-3312 bp - 689 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 11348741-11353651(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGAGAGCTC
SmilChr05G002893 Chr05 NC_080391.1:34712482-34712495promoter 内 2890-2903 bp - 1098 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 34707061-34711384(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AATCAGGCACGTGG
SmilChr01G004422 Chr01 NC_080387.1:62333633-62333646promoter 内 2803-2816 bp + 1185 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 62329403-62332448(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGATTTCAA
SmilChr01G000400 Chr01 NC_080387.1:8210168-8210181promoter 内 2545-2558 bp - 1443 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 8211624-8212178(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGGGAGTT
SmilChr04G001126 Chr04 NC_080390.1:16318342-16318355promoter 内 2519-2532 bp + 1469 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 16314342-16316873(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGACAATAG
SmilChr02G003148 Chr02 NC_080388.1:52508274-52508287promoter 内 2357-2370 bp + 1631 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 52505293-52506643(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGAGACCTT
SmilChr06G001502 Chr06 NC_080392.1:16068054-16068067promoter 内 2261-2274 bp + 1727 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 16069794-16071752(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GAGGTTTCACGTGA
SmilChr07G002973 Chr07 NC_080393.1:30276391-30276404promoter 内 1793-1806 bp + 2195 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 30278599-30328585(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TTAATTTCACGTGG
SmilChr03G001816 Chr03 NC_080389.1:24834142-24834155promoter 内 1752-1765 bp - 2236 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 24836391-24838682(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGGTATCA
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SmilChr06G002737 Chr06 NC_080392.1:39633216-39633229promoter 内 1021-1034 bp + 2967 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 39636196-39639098(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AACTCCCCACGTGG
SmilChr05G003263 Chr05 NC_080391.1:42221855-42221868promoter 内 838-851 bp + 3150 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 42214271-42218705(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGGGAGTT
SmilChr07G002287 Chr07 NC_080393.1:21158164-21158177promoter 内 834-847 bp - 3154 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 21153841-21155010(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGATGTCCACGTGG
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SmilChr01G005505 Chr01 NC_080387.1:71912350-71912363promoter 内 112-125 bp - 3876 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 71906613-71908474(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGTCACACACGTGG
SmilChr01G005472 Chr01 NC_080387.1:71697634-71697647promoter 内 3975-3988 bp + 13 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 71697660-71701511(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AATATGTCACGTGT
SmilChr03G002932 Chr03 NC_080389.1:46064563-46064576promoter 内 3942-3955 bp + 46 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 46062193-46064517(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGACTATTT
SmilChr04G000153 Chr04 NC_080390.1:1333775-1333788promoter 内 3933-3946 bp - 55 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 1333843-1339955(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTAACAAT
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SmilChr03G000162 Chr03 NC_080389.1:1784829-1784842promoter 内 3843-3856 bp - 145 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 1784987-1786606(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAAGGGAA