转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G004447; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027346-RA_Salv SmilChr02G004447 HD-ZIP XP_057797242.1 MP00200 AAAAGTAATGATTAC

可能结合的靶基因

9930 个结合位点 6661 个候选靶基因 第 97 / 134 下载 TSV

上一页 97 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G005236 Chr01 NC_080387.1:69934935-69934949promoter 内 1309-1323 bp + 2678 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 69931647-69932257(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATTTTTTTC
SmilChr01G005169 Chr01 NC_080387.1:69457164-69457178promoter 内 1050-1064 bp + 2937 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 69460115-69467600(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TATTGAAATGATTAA
SmilChr03G001682 Chr03 NC_080389.1:22167674-22167688promoter 内 260-274 bp - 3727 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 22171415-22173315(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GCCATAATTACTTGC
SmilChr02G004518 Chr02 NC_080388.1:67701629-67701643promoter 内 3973-3987 bp + 14 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 67701657-67703416(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATACGTAATGATAAT
SmilChr02G005374 Chr02 NC_080388.1:74421394-74421408promoter 内 3780-3794 bp - 207 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 74421615-74424248(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATCATTGTA
SmilChr03G003352 Chr03 NC_080389.1:51858134-51858148promoter 内 3707-3721 bp + 280 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 51854711-51857854(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTTATCATTATAAAT
SmilChr02G000569 Chr02 NC_080388.1:8038648-8038662promoter 内 3703-3717 bp + 284 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 8038946-8040914(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GCATGAAATGATTAT
SmilChr02G000570 Chr02 NC_080388.1:8049287-8049301promoter 内 3703-3717 bp + 284 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 8049585-8051478(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GCATGAAATGATTAT
SmilChr01G002182 Chr01 NC_080387.1:37953702-37953716promoter 内 3699-3713 bp + 288 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 37950605-37953414(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CCCATCATTAGTAAA
SmilChr01G001243 Chr01 NC_080387.1:24934605-24934619promoter 内 3683-3697 bp + 304 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 24933517-24934301(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CTAATCATTTCTGTT
SmilChr02G004287 Chr02 NC_080388.1:65180966-65180980promoter 内 3679-3693 bp - 308 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 65174032-65180658(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATGTATGATGATTAA
SmilChr01G004154 Chr01 NC_080387.1:60059136-60059150promoter 内 3652-3666 bp - 335 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 60059485-60062271(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CCAATCATTAAATTT
SmilChr02G002192 Chr02 NC_080388.1:39147287-39147301promoter 内 3602-3616 bp + 385 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 39147686-39149943(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GAGGTTAATGATGGG
SmilChr01G003288 Chr01 NC_080387.1:51564566-51564580promoter 内 3581-3595 bp - 406 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 51558949-51564160(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TGATCTAATGATTGA
SmilChr01G004110 Chr01 NC_080387.1:59609665-59609679promoter 内 3574-3588 bp - 413 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 59608054-59609252(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTGACTAATGATTAA
SmilChr01G005901 Chr01 NC_080387.1:74907858-74907872promoter 内 3416-3430 bp + 571 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 74908443-74909244(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAGACTAATGATAAC
SmilChr01G001029 Chr01 NC_080387.1:21438909-21438923promoter 内 3414-3428 bp - 573 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 21435235-21438336(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATTGTTAATGATGAA
SmilChr01G000260 Chr01 NC_080387.1:5024544-5024558promoter 内 3399-3413 bp - 588 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 5022327-5023956(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GCATGAAATGATTAT
SmilChr01G005280 Chr01 NC_080387.1:70200015-70200029promoter 内 3368-3382 bp - 619 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 70200648-70203983(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATTTTTTTC
SmilChr02G001608 Chr02 NC_080388.1:29947307-29947321promoter 内 3191-3205 bp + 796 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 29944973-29946511(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATCATCATTAATTGT
SmilChr02G000129 Chr02 NC_080388.1:1753574-1753588promoter 内 3166-3180 bp + 821 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 1754409-1755279(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GATTAAAATGATTAG
SmilChr02G003432 Chr02 NC_080388.1:55550191-55550205promoter 内 3152-3166 bp + 835 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 55551040-55555242(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TGTTCCAATGATTAA
SmilChr03G001192 Chr03 NC_080389.1:13726039-13726053promoter 内 3145-3159 bp + 842 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 13723941-13725197(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTAATCATTTCTCAA
SmilChr02G002291 Chr02 NC_080388.1:40434514-40434528promoter 内 3139-3153 bp + 848 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 40435376-40439292(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATTGTTAATGATGAA
SmilChr01G003562 Chr01 NC_080387.1:54218986-54219000promoter 内 3138-3152 bp + 849 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 54219849-54224105(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TACCACAATGATTAA
SmilChr01G004871 Chr01 NC_080387.1:66831879-66831893promoter 内 3134-3148 bp + 853 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 66828607-66831026(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ACAATCATTGCCGAG
SmilChr03G002879 Chr03 NC_080389.1:45462017-45462031promoter 内 3127-3141 bp + 860 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 45460372-45461157(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTCATCATTAACAAT
SmilChr02G001076 Chr02 NC_080388.1:19253652-19253666promoter 内 3071-3085 bp + 916 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 19254582-19260044(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ACGATTAATGATTAC
SmilChr01G004055 Chr01 NC_080387.1:58993154-58993168promoter 内 3034-3048 bp + 953 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 58984815-58992201(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTAATCATTAATCGT
SmilChr02G003440 Chr02 NC_080388.1:55679362-55679376promoter 内 3018-3032 bp - 969 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 55674626-55678393(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTGATTAATGATGAT
SmilChr01G005619 Chr01 NC_080387.1:72682816-72682830promoter 内 2902-2916 bp + 1085 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 72683915-72688856(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TGATGAAATGATTAT
SmilChr01G004469 Chr01 NC_080387.1:62788728-62788742promoter 内 2889-2903 bp - 1098 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 62786523-62787630(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTTTGCAATGATTTC
SmilChr01G000159 Chr01 NC_080387.1:2683565-2683579promoter 内 2825-2839 bp - 1162 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 2684741-2685373(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTCATCATTAACAAT
SmilChr01G001217 Chr01 NC_080387.1:24453172-24453186promoter 内 2824-2838 bp + 1163 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 24450229-24452009(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTCATCATTAACAAT
SmilChr03G000868 Chr03 NC_080389.1:9867616-9867630promoter 内 2819-2833 bp + 1168 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 9868798-9874360(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATTGTTAATGATGAA
SmilChr01G004523 Chr01 NC_080387.1:63368013-63368027promoter 内 2798-2812 bp + 1189 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 63363596-63366824(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAAATCATTGCAATT
SmilChr03G000866 Chr03 NC_080389.1:9867616-9867630promoter 内 2790-2804 bp + 1197 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 9864071-9866419(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTCATCATTAACAAT
SmilChr03G000869 Chr03 NC_080389.1:9873955-9873969promoter 内 2790-2804 bp + 1197 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 9870410-9872758(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTCATCATTAACAAT
SmilChr01G001213 Chr01 NC_080387.1:24349809-24349823promoter 内 2784-2798 bp + 1203 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 24351026-24356447(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATTGTTAATGATGAA
SmilChr01G001223 Chr01 NC_080387.1:24517956-24517970promoter 内 2780-2794 bp + 1207 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 24519177-24522740(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATTGTTAATGATGAA
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SmilChr03G002353 Chr03 NC_080389.1:37168091-37168105promoter 内 2619-2633 bp - 1368 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 37165220-37166723(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATTGTTAATGATGAA
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SmilChr01G003294 Chr01 NC_080387.1:51634139-51634153promoter 内 2564-2578 bp - 1423 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 51635576-51642970(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CACATCATTATTTTC
SmilChr02G000940 Chr02 NC_080388.1:16393626-16393640promoter 内 2388-2402 bp - 1599 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 16388761-16392027(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAAAGTAATCATAAT
SmilChr01G006124 Chr01 NC_080387.1:76752694-76752708promoter 内 2375-2389 bp + 1612 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 76750274-76751082(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTCATCATTAACAAT
SmilChr01G006122 Chr01 NC_080387.1:76747136-76747150promoter 内 2373-2387 bp + 1614 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 76744716-76745522(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTCATCATTAACAAT