转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 98 / 143 下载 TSV

上一页 98 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G001018 Chr04 NC_080390.1:14189113-14189124promoter 内 2395-2406 bp - 1595 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 14190719-14191526(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCCA
SmilChr01G002785 Chr01 NC_080387.1:46326220-46326231promoter 内 2283-2294 bp - 1707 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 46323516-46324513(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTCAT
SmilChr04G001364 Chr04 NC_080390.1:22161458-22161469promoter 内 2262-2273 bp + 1728 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 22158958-22159730(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTTAGCTGTCTC
SmilChr07G002061 Chr07 NC_080393.1:18746837-18746848promoter 内 2190-2201 bp + 1800 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 18748648-18749553(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTCAT
SmilChr06G003298 Chr06 NC_080392.1:45515742-45515753promoter 内 2082-2093 bp + 1908 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 45517661-45518257(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATACAGCTGAC
SmilChr02G003349 Chr02 NC_080388.1:54685552-54685563promoter 内 2000-2011 bp + 1990 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 54687553-54688263(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTCAA
SmilChr02G001400 Chr02 NC_080388.1:26577172-26577183promoter 内 1921-1932 bp + 2069 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 26579252-26582728(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGGACAGCTATT
SmilChr05G000408 Chr05 NC_080391.1:3084874-3084885promoter 内 1917-1928 bp + 2073 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 3074322-3082801(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGATG
SmilChr03G003431 Chr03 NC_080389.1:52664361-52664372promoter 内 1831-1842 bp - 2159 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 52666531-52691520(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CGCAGCTGTCAA
SmilChr06G000025 Chr06 NC_080392.1:269052-269063promoter 内 1757-1768 bp + 2233 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 271296-275883(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTCAT
SmilChr07G000326 Chr07 NC_080393.1:2228353-2228364promoter 内 1706-1717 bp + 2284 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 2220627-2226069(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGAGCTGTCTA
SmilChr06G001762 Chr06 NC_080392.1:20590060-20590071promoter 内 1591-1602 bp + 2399 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 20592470-20594707(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTCAA
SmilChr07G002206 Chr07 NC_080393.1:20309446-20309457promoter 内 1491-1502 bp + 2499 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 20305401-20306947(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCCG
SmilChr02G004822 Chr02 NC_080388.1:70335529-70335540promoter 内 1315-1326 bp - 2675 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 70328542-70332854(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTCAA
SmilChr06G000794 Chr06 NC_080392.1:7468000-7468011promoter 内 1245-1256 bp + 2745 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 7470756-7471918(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGCG
SmilChr04G000627 Chr04 NC_080390.1:7135999-7136010promoter 内 1179-1190 bp - 2811 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 7132128-7133188(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTCAA
SmilChr01G000299 Chr01 NC_080387.1:5888655-5888666promoter 内 1170-1181 bp - 2820 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 5891486-5897014(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAGCTGTCTC
SmilChr06G002674 Chr06 NC_080392.1:38664517-38664528promoter 内 1160-1171 bp - 2830 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 38658973-38661687(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTCAT
SmilChr04G002343 Chr04 NC_080390.1:37788323-37788334promoter 内 1092-1103 bp - 2898 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 37791232-37795242(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTATC
SmilChr07G001366 Chr07 NC_080393.1:10583246-10583257promoter 内 1060-1071 bp + 2930 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 10578598-10580316(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCCA
SmilChr05G000749 Chr05 NC_080391.1:5800817-5800828promoter 内 933-944 bp + 3057 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 5803885-5804777(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTAACAGCTGTG
SmilChr06G000793 Chr06 NC_080392.1:7468000-7468011promoter 内 836-847 bp + 3154 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 7462337-7464846(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CGCAGCTGTCAA
SmilChr06G002460 Chr06 NC_080392.1:35400325-35400336promoter 内 832-843 bp - 3158 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 35403494-35405565(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAGCTGTCTC
SmilChr06G002676 Chr06 NC_080392.1:38664517-38664528promoter 内 734-745 bp - 3256 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 38667784-38676358(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAGCTGTCTC
SmilChr07G003785 Chr07 NC_080393.1:46436612-46436623promoter 内 601-612 bp + 3389 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 46440012-46445600(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTAAC
SmilChr08G000025 Chr08 NC_080394.1:178638-178649promoter 内 229-240 bp - 3761 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 170780-174877(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTCAT
SmilChr02G000635 Chr02 NC_080388.1:9612243-9612254promoter 内 195-206 bp + 3795 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 9606645-9608448(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCCA
SmilChr03G000857 Chr03 NC_080389.1:9800501-9800512promoter 内 94-105 bp + 3896 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 9789202-9796605(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTTAC
SmilChr03G001745 Chr03 NC_080389.1:23581281-23581292promoter 内 3072-3083 bp + 918 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 4 23582210-23582713(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAAAGCTGTA
SmilChr03G000432 Chr03 NC_080389.1:4682201-4682212promoter 内 3785-3796 bp - 205 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 4682417-4684700(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAGCTGTCTA
SmilChr08G001878 Chr08 NC_080394.1:16242343-16242354promoter 内 3511-3522 bp - 479 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 16238801-16241864(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTAACAGCTGTT
SmilChr03G000860 Chr03 NC_080389.1:9819121-9819132promoter 内 2383-2394 bp + 1607 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 9820739-9825687(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTAACAGCTGGG
SmilChr06G000641 Chr06 NC_080392.1:5668813-5668824promoter 内 2257-2268 bp - 1733 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 5660467-5667080(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTAACAGCTGTG
SmilChr01G001052 Chr01 NC_080387.1:21858502-21858513promoter 内 1118-1129 bp + 2872 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 21854656-21855630(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTTAC
SmilChr05G003378 Chr05 NC_080391.1:44681212-44681223promoter 内 3889-3900 bp + 101 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 44677296-44681111(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTTCAA
SmilChr03G000165 Chr03 NC_080389.1:1815528-1815539promoter 内 3821-3832 bp + 169 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 1813038-1815359(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAGCTGTCTA
SmilChr03G001049 Chr03 NC_080389.1:12219422-12219433promoter 内 3819-3830 bp + 171 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 12216912-12219251(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAGCTGTCTA
SmilChr01G004026 Chr01 NC_080387.1:58670227-58670238promoter 内 3802-3813 bp + 188 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 58667914-58670039(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAGCTGTCTA
SmilChr02G001590 Chr02 NC_080388.1:29645700-29645711promoter 内 3789-3800 bp - 201 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 29644545-29645499(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTAACAGCTGGG
SmilChr04G002243 Chr04 NC_080390.1:36225688-36225699promoter 内 3781-3792 bp - 209 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 36223288-36225479(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAAAGCTGTA
SmilChr03G001437 Chr03 NC_080389.1:17054809-17054820promoter 内 3755-3766 bp + 235 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 17050990-17054574(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CGCAGCTGTCAT
SmilChr02G002541 Chr02 NC_080388.1:44275136-44275147promoter 内 3734-3745 bp - 256 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 44263095-44274880(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAAAGCTGTA
SmilChr06G001561 Chr06 NC_080392.1:17021311-17021322promoter 内 3717-3728 bp + 273 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 17021595-17022871(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTAACAGCTGGG
SmilChr01G000727 Chr01 NC_080387.1:16177240-16177251promoter 内 3700-3711 bp + 290 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 16177541-16178969(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTAACAGCTGGG
SmilChr02G001226 Chr02 NC_080388.1:22543567-22543578promoter 内 3683-3694 bp + 307 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 22542391-22543260(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCCT
SmilChr03G001054 Chr03 NC_080389.1:12251935-12251946promoter 内 3676-3687 bp + 314 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 12246577-12251621(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAGCTGTCTA
SmilChr01G000725 Chr01 NC_080387.1:16171296-16171307promoter 内 3655-3666 bp + 335 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 16171642-16173010(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTAACAGCTGGG
SmilChr03G002336 Chr03 NC_080389.1:36843998-36844009promoter 内 3637-3648 bp - 353 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 36842803-36843645(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTAACAGCTGGG
SmilChr07G002669 Chr07 NC_080393.1:25984206-25984217promoter 内 3624-3635 bp + 366 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 25984583-25985245(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTAACAGCTGGG
SmilChr06G001861 Chr06 NC_080392.1:22046182-22046193promoter 内 3618-3629 bp + 372 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 22046565-22050595(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTAACAGCTGGG