转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004199; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010571-RA_Salv SmilChr01G004199 bHLH XP_057782208.1 MP00074 AGAAGGTCACGTGG

可能结合的靶基因

9969 个结合位点 7396 个候选靶基因 第 98 / 148 下载 TSV

上一页 98 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G001050 Chr02 NC_080388.1:18726801-18726814promoter 内 3813-3826 bp + 175 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 18726989-18730100(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATTTGGTCACGTGA
SmilChr01G000527 Chr01 NC_080387.1:10748230-10748243promoter 内 3756-3769 bp - 232 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 10744899-10747998(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATTTGGTCACGTGA
SmilChr01G002283 Chr01 NC_080387.1:39619852-39619865promoter 内 3651-3664 bp - 337 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 39613927-39619515(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTTAATGCACGTGG
SmilChr01G003435 Chr01 NC_080387.1:52974922-52974935promoter 内 3620-3633 bp + 368 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 52975303-52976891(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGGGTATCACGTGA
SmilChr02G000014 Chr02 NC_080388.1:114033-114046promoter 内 3577-3590 bp - 411 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 110968-113622(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTGAATCACGTGC
SmilChr02G005019 Chr02 NC_080388.1:71961122-71961135promoter 内 3546-3559 bp - 442 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 71961577-71965484(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTAAGTCT
SmilChr03G001026 Chr03 NC_080389.1:11978760-11978773promoter 内 3491-3504 bp - 497 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 11975015-11978263(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTGAATCACGTGC
SmilChr03G003469 Chr03 NC_080389.1:53155741-53155754promoter 内 3347-3360 bp - 641 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 53156395-53162901(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGATTCACC
SmilChr02G002156 Chr02 NC_080388.1:38781567-38781580promoter 内 3339-3352 bp - 649 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 38778878-38780918(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTGAATCACGTGC
SmilChr06G001592 Chr06 NC_080392.1:17594624-17594637promoter 内 3326-3339 bp - 662 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 17592979-17593962(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AACCTGTCACGTGA
SmilChr03G000091 Chr03 NC_080389.1:1029901-1029914promoter 内 3314-3327 bp + 674 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 1027224-1029227(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAAGGGAA
SmilChr02G000958 Chr02 NC_080388.1:16670874-16670887promoter 内 3240-3253 bp + 748 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 16671635-16675520(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTTTTCTCACGTGG
SmilChr02G004415 Chr02 NC_080388.1:66494444-66494457promoter 内 3198-3211 bp - 790 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 66495247-66496458(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGACAATAG
SmilChr04G002286 Chr04 NC_080390.1:37146127-37146140promoter 内 3182-3195 bp - 806 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 37136204-37145321(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAGGTCTCACGTGT
SmilChr03G002812 Chr03 NC_080389.1:44586357-44586370promoter 内 3181-3194 bp + 807 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 44587177-44590718(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAGGTCTCACGTGT
SmilChr03G000801 Chr03 NC_080389.1:9177004-9177017promoter 内 3154-3167 bp + 834 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 9176064-9176170(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAAATTAA
SmilChr03G000824 Chr03 NC_080389.1:9435604-9435617promoter 内 3144-3157 bp + 844 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 9427890-9434760(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGAGTTTAA
SmilChr05G000056 Chr05 NC_080391.1:265243-265256promoter 内 3121-3134 bp + 867 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 266123-267396(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CATGTGTCACGTGT
SmilChr05G000903 Chr05 NC_080391.1:7154037-7154050promoter 内 3108-3121 bp + 880 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 7154930-7157290(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CAGAACTCACGTGC
SmilChr07G002299 Chr07 NC_080393.1:21283347-21283360promoter 内 3105-3118 bp - 883 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 21281059-21282464(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AATAACACACGTGG
SmilChr01G005443 Chr01 NC_080387.1:71527170-71527183promoter 内 3061-3074 bp + 927 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 71528110-71529022(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAATTGTCACGTGC
SmilChr01G005442 Chr01 NC_080387.1:71527170-71527183promoter 内 3008-3021 bp + 980 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 71524945-71526190(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGACAATTT
SmilChr03G004308 Chr03 NC_080389.1:61426195-61426208promoter 内 2973-2986 bp - 1015 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 61427223-61428110(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGATCTTTA
SmilChr07G000077 Chr07 NC_080393.1:360491-360504promoter 内 2959-2972 bp - 1029 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 361533-362094(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGAACTTTT
SmilChr03G000888 Chr03 NC_080389.1:10132993-10133006promoter 内 2934-2947 bp - 1054 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 10134060-10138604(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAAATTAA
SmilChr01G005829 Chr01 NC_080387.1:74299260-74299273promoter 内 2831-2844 bp + 1157 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 74294086-74298103(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTTGTCTG
SmilChr04G000748 Chr04 NC_080390.1:9173991-9174004promoter 内 2712-2725 bp - 1276 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 9169708-9172715(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGGTCTTCACGTGC
SmilChr08G000342 Chr08 NC_080394.1:2377357-2377370promoter 内 2705-2718 bp + 1283 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 2378653-2383978(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATGATTTCACGTGC
SmilChr02G003868 Chr02 NC_080388.1:60689823-60689836promoter 内 2692-2705 bp + 1296 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 60691132-60696390(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TTCCCTTCACGTGG
SmilChr01G000528 Chr01 NC_080387.1:10748230-10748243promoter 内 2658-2671 bp - 1330 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 10749573-10851771(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGACCAAAT
SmilChr03G002030 Chr03 NC_080389.1:30437659-30437672promoter 内 2628-2641 bp + 1360 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 30435691-30436299(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGGGAGTT
SmilChr01G001971 Chr01 NC_080387.1:35108910-35108923promoter 内 2592-2605 bp - 1396 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 35104121-35107514(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTTAATGCACGTGG
SmilChr07G001111 Chr07 NC_080393.1:8206514-8206527promoter 内 2567-2580 bp - 1421 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 8207948-8209238(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGTACTTC
SmilChr08G000753 Chr08 NC_080394.1:5551683-5551696promoter 内 2566-2579 bp + 1422 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 5553118-5557335(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTTAAATCACGTGG
SmilChr01G002637 Chr01 NC_080387.1:44667140-44667153promoter 内 2538-2551 bp + 1450 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 44659943-44665690(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTGCAGTG
SmilChr03G003771 Chr03 NC_080389.1:56849838-56849851promoter 内 2384-2397 bp - 1604 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 56851455-56857112(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGTTCACA
SmilChr03G003390 Chr03 NC_080389.1:52297621-52297634promoter 内 2345-2358 bp + 1643 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 52294179-52295978(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGATTCACT
SmilChr01G001400 Chr01 NC_080387.1:27500992-27501005promoter 内 2237-2250 bp - 1751 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 27497994-27499241(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCTGACCACGTGG
SmilChr01G002965 Chr01 NC_080387.1:48533566-48533579promoter 内 2179-2192 bp - 1809 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 48524866-48531757(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAGGTCTCACGTGT
SmilChr01G003334 Chr01 NC_080387.1:52047298-52047311promoter 内 2054-2067 bp - 1934 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 52049245-52052647(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGAAGTTCA
SmilChr04G003715 Chr04 NC_080390.1:53450018-53450031promoter 内 2004-2017 bp - 1984 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 53438018-53448034(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AACTCCGCACGTGG
SmilChr02G004823 Chr02 NC_080388.1:70340744-70340757promoter 内 1985-1998 bp + 2003 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 70334940-70338741(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCATTAAC
SmilChr01G001670 Chr01 NC_080387.1:30806507-30806520promoter 内 1970-1983 bp + 2018 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 30808538-30812016(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGGTTTGCACGTGG
SmilChr01G005823 Chr01 NC_080387.1:74237866-74237879promoter 内 1881-1894 bp + 2107 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 74231108-74235759(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTTGTCTG
SmilChr01G002087 Chr01 NC_080387.1:36854270-36854283promoter 内 1867-1880 bp + 2121 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 36856404-36857548(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTTAGTCACGTGT
SmilChr05G001028 Chr05 NC_080391.1:8435340-8435353promoter 内 1837-1850 bp - 2151 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 8430870-8433189(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATTACATCACGTGG
SmilChr03G003248 Chr03 NC_080389.1:50371292-50371305promoter 内 1823-1836 bp + 2165 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 50373470-50374730(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AATATGTCACGTGT
SmilChr02G000431 Chr02 NC_080388.1:5585313-5585326promoter 内 1816-1829 bp + 2172 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 5582653-5583141(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGATGCATC
SmilChr01G000739 Chr01 NC_080387.1:16371451-16371464promoter 内 1788-1801 bp + 2200 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 16373664-16393722(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATCAACTCACGTGA
SmilChr02G000938 Chr02 NC_080388.1:16369725-16369738promoter 内 1780-1793 bp - 2208 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 16358836-16367517(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGGTGACCACGTGG