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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr03G001252; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00025976-RA_Salv SmilChr03G001252 bZIP XP_057802461.1 MP00291 AATGGTCACGTGGCA

可能结合的靶基因

9321 个结合位点 6894 个候选靶基因 第 103 / 138 下载 TSV

上一页 103 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G001633 Chr06 NC_080392.1:18305276-18305290promoter 内 2366-2380 bp + 1621 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 18302279-18303655(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TTCCACGTGGCTCGC
SmilChr06G002145 Chr06 NC_080392.1:29134369-29134383promoter 内 2346-2360 bp + 1641 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 29136024-29143144(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GCGAGCCACGTGGAA
SmilChr02G001781 Chr02 NC_080388.1:32594730-32594744promoter 内 2302-2316 bp - 1685 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 32596429-32605638(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TTCCACGTGGCTCGC
SmilChr02G003074 Chr02 NC_080388.1:51641427-51641441promoter 内 2288-2302 bp - 1699 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 51643140-51644435(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TTCCACGTGGCTCGC
SmilChr03G001550 Chr03 NC_080389.1:19536952-19536966promoter 内 2026-2040 bp + 1961 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 19538927-19540509(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 ATCAGCCACGTGGCT
SmilChr03G001921 Chr03 NC_080389.1:26937383-26937397promoter 内 1464-1478 bp - 2523 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 26925349-26934860(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GCGAGCCACGTGGAA
SmilChr06G002402 Chr06 NC_080392.1:34799160-34799174promoter 内 1378-1392 bp - 2609 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 34790265-34796551(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GCGAGCCACGTGGAA
SmilChr01G000886 Chr01 NC_080387.1:18923856-18923870promoter 内 1130-1144 bp + 2857 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 18926727-18927868(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGATTCTACGTGGCA
SmilChr03G001963 Chr03 NC_080389.1:28131777-28131791promoter 内 442-456 bp - 3545 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 28123369-28128232(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GCGAGCCACGTGGAA
SmilChr03G001551 Chr03 NC_080389.1:19536952-19536966promoter 内 425-439 bp + 3562 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 19540528-19540599(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 ATCAGCCACGTGGCT
SmilChr02G001777 Chr02 NC_080388.1:32548395-32548409promoter 内 208-222 bp - 3779 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 32538679-32544616(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GCGAGCCACGTGGAA
SmilChr05G004294 Chr05 NC_080391.1:56686683-56686697promoter 内 187-201 bp - 3800 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 56680717-56682883(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CTCGTTCACGTGGCT
SmilChr02G001017 Chr02 NC_080388.1:17944117-17944131promoter 内 155-169 bp + 3832 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 17939512-17940285(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TTCCACGTGGAAAAT
SmilChr02G000062 Chr02 NC_080388.1:772593-772607promoter 内 125-139 bp - 3862 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 776469-779675(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AGCCACGTGACTTTG
SmilChr01G004883 Chr01 NC_080387.1:66900939-66900953promoter 内 3976-3990 bp - 11 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 66896875-66900928(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AAATGACACGTGGAG
SmilChr02G000930 Chr02 NC_080388.1:16205004-16205018promoter 内 3958-3972 bp - 29 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 16205047-16214520(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AGCCACGTGTACTTA
SmilChr08G004919 Chr08 NC_080394.1:58131830-58131844promoter 内 3783-3797 bp + 204 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 58132048-58136376(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AGATTTTACGTGGCA
SmilChr05G003064 Chr05 NC_080391.1:38494258-38494272promoter 内 3666-3680 bp + 321 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 38491519-38493937(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GTCCACGTGGGCGTT
SmilChr04G003865 Chr04 NC_080390.1:54570808-54570822promoter 内 3653-3667 bp + 334 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 54565330-54570474(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTAGTTAAC
SmilChr05G003112 Chr05 NC_080391.1:39652517-39652531promoter 内 3616-3630 bp - 371 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 39652902-39655262(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GTCCACGTGGGCGTT
SmilChr08G004381 Chr08 NC_080394.1:53556035-53556049promoter 内 3487-3501 bp - 500 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 53556549-53557953(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AGCCACGTCACTTTA
SmilChr05G003919 Chr05 NC_080391.1:52948621-52948635promoter 内 3451-3465 bp - 536 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 52949171-52957577(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TTCCACGTGTACTCA
SmilChr06G002691 Chr06 NC_080392.1:38829554-38829568promoter 内 3446-3460 bp - 541 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 38830109-38831029(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GGCCACGTCTAAATG
SmilChr05G001762 Chr05 NC_080391.1:17334716-17334730promoter 内 3312-3326 bp - 675 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 17332551-17334041(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GTAAGACACGTGGAA
SmilChr02G004252 Chr02 NC_080388.1:64703228-64703242promoter 内 3214-3228 bp + 773 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 64700080-64702455(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TTCCACGTGTTCCAA
SmilChr04G001282 Chr04 NC_080390.1:20438576-20438590promoter 内 2822-2836 bp - 1165 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 20439755-20440510(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CGCCACGTATGAAAG
SmilChr08G002610 Chr08 NC_080394.1:25470025-25470039promoter 内 2801-2815 bp + 1186 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 25465970-25468839(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GGCCACGTCGAAGAA
SmilChr08G001873 Chr08 NC_080394.1:16214875-16214889promoter 内 2797-2811 bp - 1190 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 16216079-16217182(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTAAGTTTG
SmilChr08G002736 Chr08 NC_080394.1:26992336-26992350promoter 内 2534-2548 bp + 1453 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 26977725-26990883(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GGCCACGTGAAAGAA
SmilChr06G002664 Chr06 NC_080392.1:38519479-38519493promoter 内 2528-2542 bp + 1459 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 38520952-38523849(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CCATCTCACGTGGAA
SmilChr01G001795 Chr01 NC_080387.1:32819371-32819385promoter 内 2360-2374 bp + 1627 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 32821012-32823779(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TTATGATACGTGGCG
SmilChr01G002027 Chr01 NC_080387.1:35818154-35818168promoter 内 2263-2277 bp + 1724 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 35819892-35822581(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TTGGAACACGTGGAA
SmilChr01G005545 Chr01 NC_080387.1:72259878-72259892promoter 内 2211-2225 bp + 1776 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 72261668-72264027(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GAGCGACACGTGGAA
SmilChr03G000573 Chr03 NC_080389.1:6235385-6235399promoter 内 1931-1945 bp + 2056 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 6232208-6233329(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AGCCACGTGGTCGGA
SmilChr02G005600 Chr02 NC_080388.1:75718521-75718535promoter 内 1852-1866 bp - 2135 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 75714527-75716386(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GATCAAGACGTGGCC
SmilChr03G003902 Chr03 NC_080389.1:58120309-58120323promoter 内 1840-1854 bp + 2147 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 58122470-58125884(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 ACAAGAGACGTGGCC
SmilChr08G004360 Chr08 NC_080394.1:53337178-53337192promoter 内 1799-1813 bp + 2188 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 53327651-53334990(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGACACGTGAAATTA
SmilChr02G003551 Chr02 NC_080388.1:56658463-56658477promoter 内 1602-1616 bp - 2385 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 56650319-56656078(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 ATATTCTACGTGGCA
SmilChr03G003065 Chr03 NC_080389.1:47598163-47598177promoter 内 1579-1593 bp - 2408 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 47600585-47603763(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTAGAATCA
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SmilChr06G001440 Chr06 NC_080392.1:15216189-15216203promoter 内 1317-1331 bp - 2670 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 15208420-15213519(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AATAGAGACGTGGCT
SmilChr08G002737 Chr08 NC_080394.1:26992336-26992350promoter 内 1274-1288 bp + 2713 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 26995063-26997014(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TTCTTTCACGTGGCC
SmilChr02G001639 Chr02 NC_080388.1:30410692-30410706promoter 内 1231-1245 bp - 2756 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 30413462-30415790(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AGCCACGTGGGGTGC
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SmilChr05G003489 Chr05 NC_080391.1:46378363-46378377promoter 内 804-818 bp + 3183 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 46381560-46381922(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AACGCCCACGTGGAC