Red Sage Omics 丹参基因组信息平台
首页 基因查询 ID 对照表 功能注释 结构域预测 Pfam 基因组工具 蛋白互作 亚细胞定位 表达量 共表达 同源/共线性 GO/KEGG 注释 TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变 JBrowse BLAST 下载 关于 帮助
数据资源
ID 对照表 功能注释 功能检索 次生代谢专题 文献证据 结构域预测 Pfam 同源/共线性
分析工具
基因组工具 引物设计 同源重组引物设计 核酸翻译 BLAST 蛋白互作 亚细胞定位 共表达 GO/KEGG 注释 功能检索
调控/突变
TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变
帮助
关于 帮助 资源与版本
中文 EN

转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001059; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00014491-RA_Salv SmilChr06G001059 Dof XP_057768449.1 MP00402 TTTTTTTTTTTTTTACTTTTT

可能结合的靶基因

9875 个结合位点 6278 个候选靶基因 第 107 / 126 下载 TSV

上一页 107 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G003452 Chr02 NC_080388.1:55809403-55809423promoter 内 182-202 bp - 3799 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 55802597-55805604(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 GAGTTTTCGACTCTACTTTTT
SmilChr02G001178 Chr02 NC_080388.1:21655837-21655857promoter 内 177-197 bp + 3804 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 21648406-21652033(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTGAGTTTAAGAGAAG
SmilChr02G003798 Chr02 NC_080388.1:59609502-59609522promoter 内 163-183 bp - 3818 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 59613340-59618997(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 ATAAAGTAAATAAATAAAATT
SmilChr02G004028 Chr02 NC_080388.1:62554891-62554911promoter 内 146-166 bp + 3835 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 62558746-62562572(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TTTGTTCCGTTGTTACTTTCT
SmilChr03G000093 Chr03 NC_080389.1:1046797-1046817promoter 内 49-69 bp - 3932 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 1036298-1042865(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 GAGTTTTCGACTCTACTTTTT
SmilChr01G004951 Chr01 NC_080387.1:67596867-67596887promoter 内 46-66 bp + 3935 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 67590086-67592932(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAGGTAAAAAAAGAAATTA
SmilChr02G000363 Chr02 NC_080388.1:4662854-4662874promoter 内 43-63 bp - 3938 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 4658293-4658916(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TTTAGGCTTCCTCTACTTTTC
SmilChr02G000980 Chr02 NC_080388.1:17173645-17173665promoter 内 38-58 bp + 3943 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 17177608-17183859(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TATTGTTCTGTCCAACTTTTT
SmilChr02G003662 Chr02 NC_080388.1:58008676-58008696promoter 内 2631-2651 bp + 1350 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 3 58010046-58016971(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TTGCTTAATAATTTACTTTTT
SmilChr03G000697 Chr03 NC_080389.1:7779827-7779847promoter 内 569-589 bp - 3412 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 3 7772687-7776415(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AATCACATCTTTCAACTTTTT
SmilChr01G002622 Chr01 NC_080387.1:44494112-44494132promoter 内 326-346 bp + 3655 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 3 44489247-44490457(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTTGAGTGCACGAGCA
SmilChr01G001374 Chr01 NC_080387.1:27067812-27067832promoter 内 290-310 bp + 3691 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 3 27061300-27064121(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TAAAAGTAAACCAATAGAGAG
SmilChr01G000832 Chr01 NC_080387.1:17935138-17935158promoter 内 3879-3899 bp + 102 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 2 17917246-17935036(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AGAAAGTAAAAAAGAGTTGGT
SmilChr01G004489 Chr01 NC_080387.1:63017403-63017423promoter 内 3249-3269 bp + 732 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 2 63015032-63016671(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTATCACAAAAAAAAT
SmilChr02G004082 Chr02 NC_080388.1:63100502-63100522promoter 内 2736-2756 bp - 1245 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 2 63097722-63099257(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 CTGATATCTCTTTTACTTTCT
SmilChr01G002983 Chr01 NC_080387.1:48758716-48758736promoter 内 2379-2399 bp + 1602 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 2 48760338-48763144(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 CTGATATCTCTTTTACTTTCT
SmilChr01G006115 Chr01 NC_080387.1:76675196-76675216promoter 内 1891-1911 bp - 2090 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 2 76677306-76680302(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTAATAAAAAATATAT
SmilChr03G000091 Chr03 NC_080389.1:1031539-1031559promoter 内 1669-1689 bp - 2312 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 2 1027224-1029227(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 CTGCAGTTGTTCCAACTTTTT
SmilChr02G002963 Chr02 NC_080388.1:50145717-50145737promoter 内 1231-1251 bp - 2750 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 2 50141901-50142967(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TTTTGGTCTCGTTGACTTTTT
SmilChr02G001757 Chr02 NC_080388.1:32305703-32305723promoter 内 1001-1021 bp - 2980 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 2 32308703-32310653(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AGAAGGGAAAAAAGAAAAAAA
SmilChr01G002507 Chr01 NC_080387.1:42948917-42948937promoter 内 580-600 bp + 3401 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 2 42941240-42945516(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTAAATGAAGATATTT
SmilChr02G005350 Chr02 NC_080388.1:74294924-74294944promoter 内 3972-3992 bp - 9 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 74294780-74294915(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 CTTGATTTTTGACTACTTTTT
SmilChr02G000807 Chr02 NC_080388.1:13502608-13502628promoter 内 3971-3991 bp + 10 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 13498082-13502598(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTAAAATTAAATACAT
SmilChr02G000808 Chr02 NC_080388.1:13539757-13539777promoter 内 3971-3991 bp + 10 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 13535231-13539747(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTAAAATTAAATACAT
SmilChr01G004222 Chr01 NC_080387.1:60583566-60583586promoter 内 3968-3988 bp + 13 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 60582237-60583553(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TAAAAGTAAAGTGTGAAGAAA
SmilChr01G003893 Chr01 NC_080387.1:57225786-57225806promoter 内 3964-3984 bp - 17 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 57225823-57234347(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTATACGAGACAAAAT
SmilChr02G004716 Chr02 NC_080388.1:69430555-69430575promoter 内 3955-3975 bp - 26 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 69422631-69430529(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 CCCGTGGTCCATCCACTTTTT
SmilChr02G001336 Chr02 NC_080388.1:24831424-24831444promoter 内 3912-3932 bp - 69 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 24831513-24832456(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTTAGTACAAACAAGA
SmilChr01G002283 Chr01 NC_080387.1:39619619-39619639promoter 内 3877-3897 bp + 104 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 39613927-39619515(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTCATAGTAAAAACCA
SmilChr01G002562 Chr01 NC_080387.1:43749120-43749140promoter 内 3871-3891 bp - 110 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 43749250-43751433(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TAAAAGTAAAAAGGGATTAAT
SmilChr01G004123 Chr01 NC_080387.1:59731589-59731609promoter 内 3866-3886 bp + 115 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 59731724-59733088(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TGACTCTTGACTTCACTTTTT
SmilChr01G006070 Chr01 NC_080387.1:76113106-76113126promoter 内 3795-3815 bp + 186 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 76113312-76114864(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TTTTTTTTTCATTAACTTTAA
SmilChr02G001799 Chr02 NC_080388.1:32841157-32841177promoter 内 3778-3798 bp + 203 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 32839932-32840954(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TAAAAGTAATAAAGTAGAAGA
SmilChr01G000654 Chr01 NC_080387.1:14545010-14545030promoter 内 3760-3780 bp + 221 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 14545251-14547409(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 GCAATTTCGATTTTACTTTTC
SmilChr02G002130 Chr02 NC_080388.1:38147975-38147995promoter 内 3742-3762 bp + 239 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 38146714-38147736(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TTAAAGAAAAAATAAAAAAAA
SmilChr01G002748 Chr01 NC_080387.1:45804120-45804140promoter 内 3700-3720 bp + 281 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 45802255-45803839(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTAAATCAAAATTGAT
SmilChr02G004744 Chr02 NC_080388.1:69653896-69653916promoter 内 3692-3712 bp + 289 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 69654205-69656876(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 ATGTTTAGTTATTAACTTTTT
SmilChr03G000637 Chr03 NC_080389.1:7010709-7010729promoter 内 3630-3650 bp - 351 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 7011080-7014569(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTCAATGTGAAATAGT
SmilChr01G003566 Chr01 NC_080387.1:54244117-54244137promoter 内 3588-3608 bp + 393 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 54242166-54243724(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTTACAAAACGACGTA
SmilChr01G002462 Chr01 NC_080387.1:42298302-42298322promoter 内 3576-3596 bp + 405 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 42298727-42301733(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 GTCTCAAATTTTCAACTTTTT
SmilChr01G004354 Chr01 NC_080387.1:61728058-61728078promoter 内 3567-3587 bp - 414 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 61727024-61727644(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TATATTTTAATGTTACTTTTT
SmilChr01G001913 Chr01 NC_080387.1:34271235-34271255promoter 内 3566-3586 bp + 415 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 34267156-34270820(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TAAAAGTAAAATTAAAGGATT
SmilChr01G005015 Chr01 NC_080387.1:68160160-68160180promoter 内 3565-3585 bp + 416 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 68156428-68159744(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTATAAGACATAAATG
SmilChr02G005569 Chr02 NC_080388.1:75589866-75589886promoter 内 3546-3566 bp - 435 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 75584703-75589431(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TCACATTTCCACTAACTTTTT
SmilChr02G003330 Chr02 NC_080388.1:54555220-54555240promoter 内 3469-3489 bp - 512 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 54553101-54554708(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AATTTTGGTCGTTTACTTTTG
SmilChr03G000478 Chr03 NC_080389.1:5078362-5078382promoter 内 3465-3485 bp - 516 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 5078898-5081586(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 CAAAAGTAAGATTTAAAAAAA
SmilChr01G005406 Chr01 NC_080387.1:71313217-71313237promoter 内 3322-3342 bp + 659 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 71311053-71312558(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 GAAAAGTAAATATATCGAAGG
SmilChr01G001220 Chr01 NC_080387.1:24476966-24476986promoter 内 3308-3328 bp - 673 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 24477659-24478409(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTACAAAAAACATAAT
SmilChr01G001547 Chr01 NC_080387.1:29457659-29457679promoter 内 3259-3279 bp + 722 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 29455509-29456937(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TTAAAGTAAAACAAGAGTGGT
SmilChr01G001869 Chr01 NC_080387.1:33682286-33682306promoter 内 3186-3206 bp + 795 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 33680262-33681491(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TAAAAGTAAAATTAAAGGATT