转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G002147; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004577-RA_Salv SmilChr07G002147 MYB XP_057774045.1 MP00500 AATATGGATAAGG

可能结合的靶基因

9681 个结合位点 6697 个候选靶基因 第 108 / 134 下载 TSV

上一页 108 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G003168 Chr01 NC_080387.1:50478842-50478854promoter 内 2076-2088 bp + 1913 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 50470002-50476929(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCATTTCA
SmilChr01G003727 Chr01 NC_080387.1:55593940-55593952promoter 内 1943-1955 bp + 2046 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 55588948-55591894(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AGTTATCCACAAA
SmilChr02G001008 Chr02 NC_080388.1:17832200-17832212promoter 内 1574-1586 bp + 2415 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 17826297-17829785(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCCTTGA
SmilChr02G005381 Chr02 NC_080388.1:74479710-74479722promoter 内 1515-1527 bp - 2474 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 74482196-74486036(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCCAAGA
SmilChr03G002016 Chr03 NC_080389.1:30098839-30098851promoter 内 1325-1337 bp + 2664 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 30095714-30096175(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCCTTGA
SmilChr01G004005 Chr01 NC_080387.1:58438311-58438323promoter 内 1206-1218 bp - 2783 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 58441106-58442543(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CTTTATCCACATA
SmilChr03G001988 Chr03 NC_080389.1:29134367-29134379promoter 内 1065-1077 bp + 2924 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 29124350-29131443(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCCTTGA
SmilChr01G004027 Chr01 NC_080387.1:58698384-58698396promoter 内 922-934 bp + 3067 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 58694404-58695317(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AGTTATCCACAAA
SmilChr01G001107 Chr01 NC_080387.1:22678714-22678726promoter 内 556-568 bp + 3433 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 22682159-22689602(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AAGGTGGATAATG
SmilChr02G002056 Chr02 NC_080388.1:37009551-37009563promoter 内 505-517 bp - 3484 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 37004239-37006067(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCAAGGGATAAGA
SmilChr01G005093 Chr01 NC_080387.1:68789479-68789491promoter 内 467-479 bp + 3522 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 68783775-68785957(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCCTTGA
SmilChr02G003630 Chr02 NC_080388.1:57645581-57645593promoter 内 412-424 bp - 3577 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 57636422-57642004(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GAACTGGATAACC
SmilChr02G002041 Chr02 NC_080388.1:36744010-36744022promoter 内 223-235 bp - 3766 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 36739942-36740244(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AAAGTGGATAATC
SmilChr02G000162 Chr02 NC_080388.1:2110398-2110410promoter 内 3959-3971 bp + 30 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 2110440-2110512(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CTATATGATAAGG
SmilChr03G002260 Chr03 NC_080389.1:35587497-35587509promoter 内 3935-3947 bp + 54 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 35582928-35587443(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GATTATCCATTTC
SmilChr01G002960 Chr01 NC_080387.1:48490142-48490154promoter 内 3931-3943 bp - 58 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 48490212-48491331(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TATTATCCAATTA
SmilChr02G005443 Chr02 NC_080388.1:74806932-74806944promoter 内 3910-3922 bp - 79 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 74807023-74811315(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CATTATCCACCTT
SmilChr02G000373 Chr02 NC_080388.1:4723806-4723818promoter 内 3748-3760 bp - 241 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 4724059-4727197(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TATTATCCAATTA
SmilChr01G004241 Chr01 NC_080387.1:60718732-60718744promoter 内 3703-3715 bp - 286 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 60719030-60723206(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GATTATCCATTTC
SmilChr03G001376 Chr03 NC_080389.1:16248602-16248614promoter 内 3614-3626 bp - 375 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 16248989-16250404(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCAGATTT
SmilChr01G003385 Chr01 NC_080387.1:52530875-52530887promoter 内 3612-3624 bp - 377 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 52531264-52532222(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GCTTATCCATCAA
SmilChr02G002000 Chr02 NC_080388.1:36159451-36159463promoter 内 3537-3549 bp - 452 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 36158124-36158999(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TAATTGGATAATA
SmilChr02G001952 Chr02 NC_080388.1:35213937-35213949promoter 内 3522-3534 bp - 467 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 35214416-35229933(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CATTATCCATCTC
SmilChr02G002050 Chr02 NC_080388.1:36917583-36917595promoter 内 3257-3269 bp - 732 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 36918327-36927870(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCATTTCA
SmilChr01G000090 Chr01 NC_080387.1:1643098-1643110promoter 内 3191-3203 bp - 798 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 1643908-1649585(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TATTATCCAATTA
SmilChr02G002245 Chr02 NC_080388.1:39867868-39867880promoter 内 3177-3189 bp + 812 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 39864346-39867056(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTCTGAC
SmilChr03G000754 Chr03 NC_080389.1:8626464-8626476promoter 内 3106-3118 bp + 883 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 8622387-8625581(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCATTTCA
SmilChr03G002359 Chr03 NC_080389.1:37196535-37196547promoter 内 3004-3016 bp - 985 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 37197532-37199867(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCAGCTCA
SmilChr01G003189 Chr01 NC_080387.1:50640495-50640507promoter 内 2824-2836 bp + 1165 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 50638009-50639330(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TATTATCCAGAAC
SmilChr01G004493 Chr01 NC_080387.1:63059410-63059422promoter 内 2704-2716 bp - 1285 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 63060707-63061386(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCTCGGT
SmilChr01G000430 Chr01 NC_080387.1:8590591-8590603promoter 内 2665-2677 bp + 1324 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 8591927-8592436(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GACGATGATAAGG
SmilChr01G006199 Chr01 NC_080387.1:77683674-77683686promoter 内 2522-2534 bp - 1467 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 77685153-77690418(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AGTTATCCAATTC
SmilChr03G001577 Chr03 NC_080389.1:19940602-19940614promoter 内 2456-2468 bp + 1533 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 19930203-19939069(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCCAAGA
SmilChr02G000410 Chr02 NC_080388.1:5154242-5154254promoter 内 2412-2424 bp - 1577 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 5155831-5158826(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCCTTGA
SmilChr03G000789 Chr03 NC_080389.1:8999710-8999722promoter 内 2381-2393 bp + 1608 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 8992586-8998102(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTGATGG
SmilChr03G001818 Chr03 NC_080389.1:24843216-24843228promoter 内 2353-2365 bp + 1636 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 24844864-24846175(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGGGCAGATAAGG
SmilChr02G005571 Chr02 NC_080388.1:75596165-75596177promoter 内 2344-2356 bp + 1645 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 75597822-75602866(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TTTGTGGATAACT
SmilChr01G002453 Chr01 NC_080387.1:42140733-42140745promoter 内 2325-2337 bp - 1664 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 42133849-42139069(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CTCACGGATAAGA
SmilChr01G000830 Chr01 NC_080387.1:17860951-17860963promoter 内 2241-2253 bp - 1748 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 17862711-17873987(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GATTATCCACTTT
SmilChr01G002743 Chr01 NC_080387.1:45730681-45730693promoter 内 2218-2230 bp + 1771 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 45732464-45733904(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AAAGTGGATAATC
SmilChr02G004444 Chr02 NC_080388.1:66788838-66788850promoter 内 2126-2138 bp - 1863 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 66790713-66793924(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCATTTCA
SmilChr03G002356 Chr03 NC_080389.1:37196535-37196547promoter 内 2086-2098 bp - 1903 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 37181113-37194632(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGAGCTGATAAGG
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SmilChr02G000854 Chr02 NC_080388.1:14549997-14550009promoter 内 1969-1981 bp - 2020 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 14546214-14547977(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GTCTGGGATAAGA
SmilChr03G000677 Chr03 NC_080389.1:7555147-7555159promoter 内 1961-1973 bp + 2028 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 7557187-7558956(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GAATTGGATAACT
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SmilChr01G001047 Chr01 NC_080387.1:21755463-21755475promoter 内 1775-1787 bp + 2214 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 21757689-21759255(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GCCTTGGATAAGA
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