转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G004392; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00022653-RA_Salv SmilChr05G004392 WRKY XP_057811204.1 MP00506 AAAAGTCAACGAC

可能结合的靶基因

9818 个结合位点 7173 个候选靶基因 第 11 / 144 下载 TSV

上一页 11 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G003457 Chr01 NC_080387.1:53144724-53144736promoter 内 923-935 bp + 3066 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 53138650-53141658(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GACGTTGACTTAG
SmilChr03G002387 Chr03 NC_080389.1:37790522-37790534promoter 内 801-813 bp + 3188 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 37784571-37787334(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GACGTTGACTTAG
SmilChr01G000713 Chr01 NC_080387.1:16005271-16005283promoter 内 797-809 bp + 3192 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 15999615-16002079(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GACGTTGACTTAG
SmilChr02G000141 Chr02 NC_080388.1:1887094-1887106promoter 内 712-724 bp + 3277 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 1881120-1883817(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GACGTTGACTTAG
SmilChr03G001353 Chr03 NC_080389.1:15800345-15800357promoter 内 635-647 bp - 3354 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 15796164-15796991(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GAAAGTCAAAGCC
SmilChr01G006110 Chr01 NC_080387.1:76636340-76636352promoter 内 584-596 bp - 3405 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 76639757-76649941(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TACGTTGACTTCT
SmilChr01G004789 Chr01 NC_080387.1:66112221-66112233promoter 内 575-587 bp - 3414 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 66115647-66117585(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 ATCGTTGACTTCG
SmilChr02G000878 Chr02 NC_080388.1:15119662-15119674promoter 内 375-387 bp - 3614 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 15104295-15116048(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AAGAGTCAACGCT
SmilChr04G000640 Chr04 NC_080390.1:7269269-7269281promoter 内 248-260 bp - 3741 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 7273022-7275924(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GGCGTTGACCATC
SmilChr01G006130 Chr01 NC_080387.1:76818321-76818333promoter 内 208-220 bp - 3781 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 76822114-76825762(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TACGTTGACTTCT
SmilChr03G003135 Chr03 NC_080389.1:48601848-48601860promoter 内 197-209 bp - 3792 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 48583252-48598056(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CAAAGTCAACCAC
SmilChr01G006152 Chr01 NC_080387.1:76966300-76966312promoter 内 118-130 bp + 3871 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 76970183-76971980(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AGAAGTCAACGTA
SmilChr02G000688 Chr02 NC_080388.1:10967083-10967095promoter 内 79-91 bp - 3910 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 10971005-10973024(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GTCGTTGACTTCA
SmilChr04G001715 Chr04 NC_080390.1:28359807-28359819promoter 内 1517-1529 bp - 2472 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 3 28362291-28365900(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 ATCGTTGACTATT
SmilChr03G002262 Chr03 NC_080389.1:35611797-35611809promoter 内 179-191 bp - 3810 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 3 35615619-35619293(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 ATCGTTGACTATT
SmilChr01G005702 Chr01 NC_080387.1:73265506-73265518promoter 内 3965-3977 bp - 24 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 73262006-73265482(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AAAAGTCAACCCT
SmilChr03G003956 Chr03 NC_080389.1:58605376-58605388promoter 内 3362-3374 bp + 627 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 58598636-58604749(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GCCGTTGACCCTT
SmilChr03G000608 Chr03 NC_080389.1:6717065-6717077promoter 内 2879-2891 bp + 1110 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 6714808-6715955(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TCGGTTGACTTTT
SmilChr02G003147 Chr02 NC_080388.1:52486844-52486856promoter 内 2724-2736 bp + 1265 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 52483738-52485579(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AGCGTTGACTTAG
SmilChr02G005187 Chr02 NC_080388.1:73179710-73179722promoter 内 1049-1061 bp + 2940 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 73182662-73184352(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AAAAGTCAACCGA
SmilChr03G002269 Chr03 NC_080389.1:35821221-35821233promoter 内 3985-3997 bp - 4 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 35819285-35821217(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GCAGGTCAACGGC
SmilChr03G002297 Chr03 NC_080389.1:36190245-36190257promoter 内 3796-3808 bp + 193 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 36185510-36190052(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TCGGTTGACTTTT
SmilChr03G003288 Chr03 NC_080389.1:50982416-50982428promoter 内 3538-3550 bp - 451 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 50980166-50981965(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AAGAGTCAACGCA
SmilChr01G000189 Chr01 NC_080387.1:3238182-3238194promoter 内 3116-3128 bp + 873 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 3239067-3240349(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AAGAGTCAACGCA
SmilChr02G003038 Chr02 NC_080388.1:51095555-51095567promoter 内 2743-2755 bp - 1246 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 51096813-51098669(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AGCGTTGACTTAG
SmilChr03G002312 Chr03 NC_080389.1:36380569-36380581promoter 内 2692-2704 bp - 1297 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 36378395-36379272(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AAGAGTCAACGCA
SmilChr03G003957 Chr03 NC_080389.1:58605376-58605388promoter 内 2527-2539 bp + 1462 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 58606850-58609894(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AAGGGTCAACGGC
SmilChr03G001295 Chr03 NC_080389.1:15159549-15159561promoter 内 751-763 bp - 3238 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 15153383-15156311(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AAGAGTCAACGCA
SmilChr04G001030 Chr04 NC_080390.1:14568478-14568490promoter 内 330-342 bp + 3659 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 14572149-14573445(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AAGAGTCAACGCA
SmilChr02G005186 Chr02 NC_080388.1:73179710-73179722promoter 内 138-150 bp + 3851 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 73172860-73175859(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TCGGTTGACTTTT
SmilChr01G001130 Chr01 NC_080387.1:22979808-22979820promoter 内 3641-3653 bp + 348 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 3 22978984-22979460(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GCCGTTGACTACG
SmilChr03G000212 Chr03 NC_080389.1:2468500-2468512promoter 内 399-411 bp + 3590 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 3 2472102-2472657(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AAAAGTCAACTGC
SmilChr02G001355 Chr02 NC_080388.1:25315403-25315415promoter 内 3642-3654 bp + 347 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 25306259-25315056(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GCCGTTGACTACG
SmilChr03G003558 Chr03 NC_080389.1:54237086-54237098promoter 内 2973-2985 bp + 1016 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 54234924-54236070(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GCCGTTGACTCTA
SmilChr03G001503 Chr03 NC_080389.1:18389985-18389997promoter 内 1320-1332 bp + 2669 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 18383325-18387316(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GCAGTTGACTTTT
SmilChr03G002683 Chr03 NC_080389.1:42601710-42601722promoter 内 1248-1260 bp - 2741 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 42604463-42611829(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AGCGTTGACCTCT
SmilChr03G002814 Chr03 NC_080389.1:44601946-44601958promoter 内 744-756 bp - 3245 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 44605203-44609089(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GTCGTTGACCTCG
SmilChr02G003355 Chr02 NC_080388.1:54721517-54721529promoter 内 3934-3946 bp + 55 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 54721584-54723574(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AAAAGTCAACCCA
SmilChr03G002148 Chr03 NC_080389.1:33417332-33417344promoter 内 3880-3892 bp - 109 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 33417453-33418998(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TGCGTTGACTGTG
SmilChr03G002656 Chr03 NC_080389.1:42237060-42237072promoter 内 3799-3811 bp + 190 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 42237262-42237342(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CAAAGTCAACCTC
SmilChr04G000408 Chr04 NC_080390.1:4260645-4260657promoter 内 3724-3736 bp - 265 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 4260922-4284704(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GCAGTTGACTTTT
SmilChr01G004502 Chr01 NC_080387.1:63129335-63129347promoter 内 3233-3245 bp - 756 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 63125172-63128579(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AGAAGTCAACGTG
SmilChr04G000402 Chr04 NC_080390.1:4195143-4195155promoter 内 3118-3130 bp - 871 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 4196026-4201934(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GCAGTTGACTTTT
SmilChr03G003557 Chr03 NC_080389.1:54220781-54220793promoter 内 2973-2985 bp + 1016 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 54218619-54219765(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GCCGTTGACTCTA
SmilChr03G001175 Chr03 NC_080389.1:13507595-13507607promoter 内 2933-2945 bp + 1056 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 13505637-13506539(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GCAGTTGACTTTT
SmilChr02G004792 Chr02 NC_080388.1:70117400-70117412promoter 内 2859-2871 bp - 1130 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 70114528-70116270(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AAAAGTCAACATC
SmilChr03G001565 Chr03 NC_080389.1:19789737-19789749promoter 内 1572-1584 bp - 2417 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 19787214-19787320(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GCAGGTCAACGCC
SmilChr03G001984 Chr03 NC_080389.1:28990485-28990497promoter 内 1353-1365 bp - 2636 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 28993133-28994051(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GAGGTTGACTTTG
SmilChr02G003356 Chr02 NC_080388.1:54721517-54721529promoter 内 1259-1271 bp + 2730 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 54724259-54726747(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AAAAGTCAACCCA
SmilChr03G003819 Chr03 NC_080389.1:57250931-57250943promoter 内 1233-1245 bp + 2756 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 57253699-57259592(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AAAAGTCAACTGC