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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G003117; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00008316-RA_Salv SmilChr04G003117 C2H2 XP_057809539.1 MP00592 AAGAAAACGACAAAAAA

可能结合的靶基因

9901 个结合位点 8519 个候选靶基因 第 110 / 171 下载 TSV

上一页 110 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G001145 Chr06 NC_080392.1:11559166-11559182promoter 内 584-600 bp - 3401 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 2 11562583-11584016(+) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 ATGGTTGTCGTTTTCCA
SmilChr06G003159 Chr06 NC_080392.1:44564816-44564832promoter 内 478-494 bp - 3507 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 2 44560251-44561309(-) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 TTCAACAAGACAAAAGA
SmilChr04G003838 Chr04 NC_080390.1:54409112-54409128promoter 内 3977-3993 bp + 8 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 54406072-54409104(-) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 ATTTTTGTTGTTTTTTG
SmilChr03G000205 Chr03 NC_080389.1:2361839-2361855promoter 内 3956-3972 bp + 29 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 2361884-2363159(+) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 GCTTAAAAGACAAAAGA
SmilChr07G001108 Chr07 NC_080393.1:8181408-8181424promoter 内 3951-3967 bp + 34 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 8179331-8181374(-) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 TTTCTTGTCATTTTCTT
SmilChr04G000656 Chr04 NC_080390.1:7428680-7428696promoter 内 3937-3953 bp - 48 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 7428744-7431916(+) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 TTTTTTGTCTATTTTTG
SmilChr01G003795 Chr01 NC_080387.1:56339041-56339057promoter 内 3934-3950 bp + 51 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 56336337-56338990(-) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 TTATTTGTCGTCTTAAT
SmilChr03G004591 Chr03 NC_080389.1:63747476-63747492promoter 内 3892-3908 bp - 93 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 63741001-63747383(-) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 GGCATACCGACAAAATT
SmilChr06G002820 Chr06 NC_080392.1:40913843-40913859promoter 内 3867-3883 bp + 118 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 40913977-40915692(+) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 AAGAAAACAACAAAATA
SmilChr08G000926 Chr08 NC_080394.1:6837969-6837985promoter 内 3855-3871 bp + 130 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 6838115-6840794(+) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 CTAAAAATGACAAAAAT
SmilChr06G003252 Chr06 NC_080392.1:45193532-45193548promoter 内 3803-3819 bp - 182 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 45187905-45193350(-) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 TACCACACGACAAAACT
SmilChr03G000284 Chr03 NC_080389.1:3243752-3243768promoter 内 3793-3809 bp - 192 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 3241316-3243560(-) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 GCTTAAAAGACAAAAGA
SmilChr07G000067 Chr07 NC_080393.1:311376-311392promoter 内 3791-3807 bp + 194 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 309740-311182(-) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 TTTTTTGTCCCCTTCGT
SmilChr08G001786 Chr08 NC_080394.1:15054182-15054198promoter 内 3778-3794 bp - 207 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 15054405-15057988(+) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 CGTTTTGTCATTTTGGT
SmilChr03G000412 Chr03 NC_080389.1:4450659-4450675promoter 内 3695-3711 bp - 290 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 4450965-4453127(+) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 ACTTTTGTCATCTTCCA
SmilChr06G001170 Chr06 NC_080392.1:11919450-11919466promoter 内 3692-3708 bp + 293 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 11915987-11919157(-) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 CTTTTTGTCCTCTGCTT
SmilChr01G001395 Chr01 NC_080387.1:27439601-27439617promoter 内 3684-3700 bp - 301 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 27439228-27439300(-) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 AGATATAAGACAAAATA
SmilChr03G001391 Chr03 NC_080389.1:16501761-16501777promoter 内 3680-3696 bp + 305 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 16499300-16501456(-) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 ACTTTTGTCATCTTCCA
SmilChr03G001455 Chr03 NC_080389.1:17380365-17380381promoter 内 3680-3696 bp + 305 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 17377904-17380060(-) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 ACTTTTGTCATCTTCCA
SmilChr07G001109 Chr07 NC_080393.1:8181408-8181424promoter 内 3671-3687 bp + 314 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 8181738-8183995(+) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 AAGAAAATGACAAGAAA
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SmilChr05G003584 Chr05 NC_080391.1:47878122-47878138promoter 内 3592-3608 bp - 393 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 47874489-47877729(-) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 CTTCAAACGACAAAAGA
SmilChr01G003704 Chr01 NC_080387.1:55415411-55415427promoter 内 3576-3592 bp - 409 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 55410798-55415002(-) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 CAAATAATGACAAAACA
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SmilChr04G000655 Chr04 NC_080390.1:7428680-7428696promoter 内 3558-3574 bp - 427 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 7425185-7428253(-) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 CAAAAATAGACAAAAAA
SmilChr01G004806 Chr01 NC_080387.1:66261448-66261464promoter 内 3545-3561 bp - 440 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 66261904-66264810(+) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 TTTTTTGTCATTTTAAG
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SmilChr04G003163 Chr04 NC_080390.1:48259726-48259742promoter 内 3505-3521 bp + 480 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 48260222-48264857(+) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 AAAAAAGGGACAAAAAG
SmilChr03G001067 Chr03 NC_080389.1:12383599-12383615promoter 内 3481-3497 bp + 504 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 12384119-12390927(+) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 GCTTAAAAGACAAAAGA
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SmilChr07G003075 Chr07 NC_080393.1:32381583-32381599promoter 内 3453-3469 bp - 532 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 32382131-32382676(+) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 AATTTTGTCCTTTGTTG
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SmilChr07G003457 Chr07 NC_080393.1:38624662-38624678promoter 内 3379-3395 bp - 606 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 38623097-38624056(-) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 CTTGAAAAGACAAAAGA
SmilChr07G003459 Chr07 NC_080393.1:38630219-38630235promoter 内 3379-3395 bp - 606 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 38628654-38629613(-) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 CTTGAAAAGACAAAAGA
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SmilChr01G003705 Chr01 NC_080387.1:55415411-55415427promoter 内 3219-3235 bp - 766 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 55416193-55417162(+) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 TGTTTTGTCATTATTTG
SmilChr07G003866 Chr07 NC_080393.1:48127803-48127819promoter 内 3196-3212 bp + 789 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 48128608-48129267(+) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 ATAAAGAGGACAAAAAG
SmilChr08G003436 Chr08 NC_080394.1:36665462-36665478promoter 内 3182-3198 bp + 803 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 36660710-36664659(-) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 ATTGTTGTCGTCTATTG
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SmilChr07G002143 Chr07 NC_080393.1:19597057-19597073promoter 内 3130-3146 bp + 855 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 19597928-19599830(+) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 ACCAAATCGACAAAACA
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SmilChr08G000639 Chr08 NC_080394.1:4762072-4762088promoter 内 3034-3050 bp - 951 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 4754735-4761121(-) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 ACTAAAATGACAAAAAA