转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 110 / 149 下载 TSV

上一页 110 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G000906 Chr05 NC_080391.1:7176681-7176691promoter 内 3245-3255 bp - 746 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 7173206-7175935(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCAGCTGTAA
SmilChr03G000521 Chr03 NC_080389.1:5607088-5607098promoter 内 3159-3169 bp - 832 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 5607930-5608882(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATACAGCTGGG
SmilChr05G000430 Chr05 NC_080391.1:3225363-3225373promoter 内 3127-3137 bp + 864 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 3226237-3230665(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTTAGCTGTCA
SmilChr02G001663 Chr02 NC_080388.1:30852884-30852894promoter 内 3112-3122 bp - 879 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 30853773-30857355(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTAGA
SmilChr01G003734 Chr01 NC_080387.1:55632073-55632083promoter 内 3089-3099 bp + 902 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 55629769-55631171(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAAA
SmilChr01G001636 Chr01 NC_080387.1:30405090-30405100promoter 内 3086-3096 bp - 905 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 30406005-30409798(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTTAC
SmilChr04G003875 Chr04 NC_080390.1:54630232-54630242promoter 内 3062-3072 bp + 929 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 54626923-54629303(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGAT
SmilChr01G003759 Chr01 NC_080387.1:55978582-55978592promoter 内 2993-3003 bp - 998 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 55979590-55982896(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAAA
SmilChr07G002884 Chr07 NC_080393.1:29071410-29071420promoter 内 2976-2986 bp + 1015 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 29066972-29070395(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTTAC
SmilChr06G002482 Chr06 NC_080392.1:35672893-35672903promoter 内 2959-2969 bp + 1032 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 35670378-35671861(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTAGA
SmilChr01G000357 Chr01 NC_080387.1:7390854-7390864promoter 内 2942-2952 bp + 1049 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 7389110-7389805(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTAGA
SmilChr01G001116 Chr01 NC_080387.1:22802870-22802880promoter 内 2940-2950 bp + 1051 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 22800547-22801819(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTAGA
SmilChr04G002774 Chr04 NC_080390.1:43528240-43528250promoter 内 2940-2950 bp - 1051 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 43529301-43530784(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTAGA
SmilChr06G002978 Chr06 NC_080392.1:42605536-42605546promoter 内 2937-2947 bp - 1054 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 42606600-42607872(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTAGA
SmilChr02G002813 Chr02 NC_080388.1:48181411-48181421promoter 内 2934-2944 bp - 1057 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 48182478-48183750(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTAGA
SmilChr05G004182 Chr05 NC_080391.1:55727024-55727034promoter 内 2929-2939 bp - 1062 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 55728096-55730345(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGAT
SmilChr05G000146 Chr05 NC_080391.1:1187910-1187920promoter 内 2928-2938 bp - 1063 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 1188983-1190697(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAAA
SmilChr06G001018 Chr06 NC_080392.1:10079660-10079670promoter 内 2909-2919 bp + 1082 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 10077835-10078578(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAAA
SmilChr04G002319 Chr04 NC_080390.1:37489469-37489479promoter 内 2890-2900 bp + 1101 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 37485007-37488368(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTAGA
SmilChr04G002536 Chr04 NC_080390.1:40531379-40531389promoter 内 2881-2891 bp + 1110 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 40532499-40534077(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTTAGCTGTCA
SmilChr04G003611 Chr04 NC_080390.1:52598288-52598298promoter 内 2871-2881 bp + 1120 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 52599418-52601315(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTAAGCTGTCC
SmilChr04G000859 Chr04 NC_080390.1:10902576-10902586promoter 内 2835-2845 bp - 1156 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 10903742-10905247(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTCAT
SmilChr05G000969 Chr05 NC_080391.1:7827728-7827738promoter 内 2788-2798 bp - 1203 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 7824369-7826525(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCAGCTGTAA
SmilChr02G000509 Chr02 NC_080388.1:7009217-7009227promoter 内 2735-2745 bp - 1256 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 7010483-7028520(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTAGA
SmilChr03G003855 Chr03 NC_080389.1:57655205-57655215promoter 内 2707-2717 bp - 1284 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 57651471-57653921(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTTAGCTGTCA
SmilChr07G000242 Chr07 NC_080393.1:1565782-1565792promoter 内 2703-2713 bp - 1288 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 1567080-1569871(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAAA
SmilChr02G001517 Chr02 NC_080388.1:28280117-28280127promoter 内 2672-2682 bp - 1319 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 28277010-28278798(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTTAGCTGTCA
SmilChr03G002429 Chr03 NC_080389.1:38577502-38577512promoter 内 2587-2597 bp - 1404 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 38578916-38581857(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAAA
SmilChr02G001042 Chr02 NC_080388.1:18494542-18494552promoter 内 2566-2576 bp - 1425 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 18495977-18498415(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGAT
SmilChr06G001446 Chr06 NC_080392.1:15269844-15269854promoter 内 2555-2565 bp + 1436 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 15271290-15274894(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATGAGCTGTCG
SmilChr01G005477 Chr01 NC_080387.1:71767013-71767023promoter 内 2547-2557 bp - 1444 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 71759353-71765569(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTTAGCTGTCA
SmilChr04G003970 Chr04 NC_080390.1:55167836-55167846promoter 内 2509-2519 bp + 1482 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 55169328-55173066(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTTAGCTGTCA
SmilChr02G005571 Chr02 NC_080388.1:75596297-75596307promoter 内 2476-2486 bp - 1515 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 75597822-75602866(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAAA
SmilChr06G003083 Chr06 NC_080392.1:43704357-43704367promoter 内 2458-2468 bp + 1533 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 43702136-43702824(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTCAT
SmilChr07G000683 Chr07 NC_080393.1:4653520-4653530promoter 内 2422-2432 bp - 1569 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 4650202-4651951(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTTAGCTGTCA
SmilChr05G003960 Chr05 NC_080391.1:53330647-53330657promoter 内 2379-2389 bp + 1612 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 53332269-53333071(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCAGCTGTAA
SmilChr01G002122 Chr01 NC_080387.1:37226933-37226943promoter 内 2366-2376 bp + 1625 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 37222854-37225308(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTTAC
SmilChr03G003708 Chr03 NC_080389.1:56020065-56020075promoter 内 2349-2359 bp + 1642 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 56021717-56025599(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCAGCTGTAA
SmilChr02G004586 Chr02 NC_080388.1:68353851-68353861promoter 内 2336-2346 bp + 1655 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 68346493-68352196(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAAA
SmilChr02G001079 Chr02 NC_080388.1:19340959-19340969promoter 内 2328-2338 bp + 1663 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 19336612-19339296(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAAA
SmilChr04G001398 Chr04 NC_080390.1:22771670-22771680promoter 内 2312-2322 bp - 1679 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 22773359-22773987(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAAA
SmilChr07G003110 Chr07 NC_080393.1:32963229-32963239promoter 内 2312-2322 bp + 1679 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 32959175-32961550(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAAA
SmilChr04G001383 Chr04 NC_080390.1:22488909-22488919promoter 内 2252-2262 bp + 1739 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 22484790-22487170(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAAA
SmilChr05G000236 Chr05 NC_080391.1:1818188-1818198promoter 内 2232-2242 bp + 1759 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 1819957-1825488(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATGAGCTGTCG
SmilChr01G001136 Chr01 NC_080387.1:23159179-23159189promoter 内 2220-2230 bp - 1771 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 23153104-23157408(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGTAT
SmilChr07G003274 Chr07 NC_080393.1:34505967-34505977promoter 内 2191-2201 bp + 1800 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 34507777-34507862(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGTAT
SmilChr06G002759 Chr06 NC_080392.1:40174503-40174513promoter 内 2161-2171 bp - 1830 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 40176343-40179229(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTTAC
SmilChr05G004203 Chr05 NC_080391.1:55910223-55910233promoter 内 2156-2166 bp - 1835 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 55904834-55908388(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTTAGCTGTCA
SmilChr03G001827 Chr03 NC_080389.1:25025008-25025018promoter 内 2146-2156 bp - 1845 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 25020396-25023163(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTAAGCTGTCC
SmilChr04G000057 Chr04 NC_080390.1:499475-499485promoter 内 2107-2117 bp + 1884 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 501369-506209(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTTAGCTGTCA