转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004920; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00021741-RA_Salv SmilChr01G004920 MYB_related XP_057788125.1 MP00607 TTTAGGTTG

可能结合的靶基因

9718 个结合位点 6362 个候选靶基因 第 112 / 128 下载 TSV

上一页 112 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G001097 Chr02 NC_080388.1:19777324-19777332promoter 内 1392-1400 bp + 2601 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 19779933-19782733(+) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 TATAGGTTG
SmilChr01G002175 Chr01 NC_080387.1:37824804-37824812promoter 内 1385-1393 bp - 2608 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 37818396-37822196(-) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 TATAGGTTG
SmilChr02G000582 Chr02 NC_080388.1:8380076-8380084promoter 内 1376-1384 bp + 2617 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 8382701-8383882(+) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 TATAGGTTG
SmilChr01G000248 Chr01 NC_080387.1:4673322-4673330promoter 内 1364-1372 bp + 2629 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 4670000-4670693(-) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 CAACCTATA
SmilChr01G004401 Chr01 NC_080387.1:62130986-62130994promoter 内 1363-1371 bp - 2630 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 62133624-62135549(+) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 CAACCTATA
SmilChr01G001003 Chr01 NC_080387.1:21117603-21117611promoter 内 1302-1310 bp - 2691 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 21120302-21128904(+) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 CAACCTATA
SmilChr01G005143 Chr01 NC_080387.1:69220988-69220996promoter 内 1287-1295 bp - 2706 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 69223702-69225549(+) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 CAACCTATA
SmilChr01G000662 Chr01 NC_080387.1:14733903-14733911promoter 内 1261-1269 bp - 2732 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 14736643-14738495(+) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 CAACCTATA
SmilChr01G004302 Chr01 NC_080387.1:61193786-61193794promoter 内 1246-1254 bp + 2747 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 61196541-61197712(+) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 TATAGGTTG
SmilChr02G004506 Chr02 NC_080388.1:67605286-67605294promoter 内 1220-1228 bp + 2773 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 67601581-67602513(-) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 CAACCTATA
SmilChr01G001288 Chr01 NC_080387.1:25672144-25672152promoter 内 1171-1179 bp + 2822 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 25674974-25676465(+) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 TATAGGTTG
SmilChr02G002228 Chr02 NC_080388.1:39633828-39633836promoter 内 1168-1176 bp - 2825 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 39625323-39631003(-) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 TATAGGTTG
SmilChr01G003446 Chr01 NC_080387.1:53024360-53024368promoter 内 1072-1080 bp - 2921 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 53027289-53033056(+) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 CAACCTATA
SmilChr02G004148 Chr02 NC_080388.1:63811920-63811928promoter 内 1059-1067 bp - 2934 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 63804244-63808986(-) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 TATAGGTTG
SmilChr01G004482 Chr01 NC_080387.1:62946544-62946552promoter 内 1057-1065 bp - 2936 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 62949488-62953834(+) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 CAACCTATA
SmilChr01G000151 Chr01 NC_080387.1:2580994-2581002promoter 内 1018-1026 bp - 2975 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 2583977-2585591(+) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 CAACCTATA
SmilChr01G006072 Chr01 NC_080387.1:76161686-76161694promoter 内 1016-1024 bp - 2977 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 76157690-76158709(-) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 TATAGGTTG
SmilChr02G002073 Chr02 NC_080388.1:37322959-37322967promoter 内 1004-1012 bp - 2989 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 37325956-37330395(+) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 CAACCTATA
SmilChr02G004455 Chr02 NC_080388.1:66952429-66952437promoter 内 996-1004 bp + 2997 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 66940716-66949432(-) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 CAACCTATA
SmilChr03G000368 Chr03 NC_080389.1:4112396-4112404promoter 内 989-997 bp - 3004 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 4115408-4119854(+) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 CAACCTATA
SmilChr02G003730 Chr02 NC_080388.1:58937912-58937920promoter 内 979-987 bp + 3014 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 58929601-58934898(-) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 CAACCTATA
SmilChr02G000172 Chr02 NC_080388.1:2213830-2213838promoter 内 911-919 bp - 3082 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 2198951-2210748(-) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 TATAGGTTG
SmilChr02G005065 Chr02 NC_080388.1:72326325-72326333promoter 内 889-897 bp + 3104 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 72329437-72330275(+) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 TATAGGTTG
SmilChr02G003311 Chr02 NC_080388.1:54357318-54357326promoter 内 869-877 bp + 3124 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 54360450-54361312(+) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 TATAGGTTG
SmilChr03G000208 Chr03 NC_080389.1:2407182-2407190promoter 内 867-875 bp + 3126 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 2403126-2404056(-) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 CAACCTATA
SmilChr02G002914 Chr02 NC_080388.1:49446761-49446769promoter 内 858-866 bp + 3135 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 49449904-49450771(+) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 TATAGGTTG
SmilChr02G003755 Chr02 NC_080388.1:59208686-59208694promoter 内 822-830 bp + 3171 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 59205409-59205515(-) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 CAACCTATA
SmilChr02G002922 Chr02 NC_080388.1:49622389-49622397promoter 内 821-829 bp - 3172 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 49625569-49629392(+) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 CAACCTATA
SmilChr02G001071 Chr02 NC_080388.1:19080285-19080293promoter 内 820-828 bp - 3173 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 19076594-19077112(-) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 TATAGGTTG
SmilChr02G000514 Chr02 NC_080388.1:7105391-7105399promoter 内 794-802 bp - 3199 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 7108598-7108704(+) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 CAACCTATA
SmilChr02G004502 Chr02 NC_080388.1:67543644-67543652promoter 内 794-802 bp + 3199 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 67528523-67540445(-) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 CAACCTATA
SmilChr03G000047 Chr03 NC_080389.1:505356-505364promoter 内 794-802 bp - 3199 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 499352-502157(-) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 TATAGGTTG
SmilChr02G003387 Chr02 NC_080388.1:54983511-54983519promoter 内 790-798 bp + 3203 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 54980202-54980308(-) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 CAACCTATA
SmilChr02G002563 Chr02 NC_080388.1:44572729-44572737promoter 内 774-782 bp + 3219 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 44569404-44569510(-) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 CAACCTATA
SmilChr02G002565 Chr02 NC_080388.1:44627935-44627943promoter 内 767-775 bp + 3226 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 44624603-44624709(-) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 CAACCTATA
SmilChr01G002812 Chr01 NC_080387.1:46668460-46668468promoter 内 764-772 bp - 3229 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 46663315-46665231(-) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 TATAGGTTG
SmilChr02G000327 Chr02 NC_080388.1:4134962-4134970promoter 内 743-751 bp - 3250 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 4130655-4131712(-) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 TATAGGTTG
SmilChr01G004133 Chr01 NC_080387.1:59846325-59846333promoter 内 668-676 bp - 3325 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 59842130-59843000(-) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 TATAGGTTG
SmilChr01G001368 Chr01 NC_080387.1:27034135-27034143promoter 内 651-659 bp - 3342 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 27037485-27040166(+) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 CAACCTATA
SmilChr02G002498 Chr02 NC_080388.1:43420625-43420633promoter 内 649-657 bp - 3344 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 43416478-43417281(-) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 TATAGGTTG
SmilChr02G003428 Chr02 NC_080388.1:55514034-55514042promoter 内 632-640 bp + 3361 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 55508429-55510673(-) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 CAACCTATA
SmilChr01G000159 Chr01 NC_080387.1:2681345-2681353promoter 内 605-613 bp - 3388 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 2684741-2685373(+) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 CAACCTATA
SmilChr01G000910 Chr01 NC_080387.1:19169537-19169545promoter 内 586-594 bp + 3407 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 19172952-19173816(+) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 TATAGGTTG
SmilChr02G001640 Chr02 NC_080388.1:30460658-30460666promoter 内 585-593 bp - 3408 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 30464074-30464180(+) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 CAACCTATA
SmilChr02G003474 Chr02 NC_080388.1:56052034-56052042promoter 内 583-591 bp - 3410 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 56047805-56048624(-) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 TATAGGTTG
SmilChr02G002209 Chr02 NC_080388.1:39342266-39342274promoter 内 539-547 bp + 3454 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 39345728-39349214(+) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 TATAGGTTG
SmilChr01G001438 Chr01 NC_080387.1:28052840-28052848promoter 内 532-540 bp - 3461 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 28049219-28049379(-) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 TATAGGTTG
SmilChr01G004924 Chr01 NC_080387.1:67303242-67303250promoter 内 514-522 bp + 3479 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 67306729-67311568(+) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 TATAGGTTG
SmilChr02G001170 Chr02 NC_080388.1:21512296-21512304promoter 内 501-509 bp + 3492 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 21515796-21518855(+) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 TATAGGTTG
SmilChr02G001782 Chr02 NC_080388.1:32611270-32611278promoter 内 480-488 bp - 3513 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 32606308-32607757(-) SMil_00021741-RA_Salv MP00607 TATAGGTTG