转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004552; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00011094-RA_Salv SmilChr01G004552 bZIP XP_057786668.1 MP00409 AATGGACACGTGGCA

可能结合的靶基因

8429 个结合位点 6252 个候选靶基因 第 115 / 126 下载 TSV

上一页 115 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G002090 Chr05 NC_080391.1:21886801-21886815promoter 内 2187-2201 bp - 1800 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 21883501-21885001(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AATGCCAACGTGGCA
SmilChr07G003292 Chr07 NC_080393.1:34687930-34687944promoter 内 2164-2178 bp + 1823 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 34682889-34686107(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGCCACGTGGTGGTT
SmilChr08G002983 Chr08 NC_080394.1:29940305-29940319promoter 内 2144-2158 bp - 1843 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 29935055-29938462(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CACTTTCACGTGGCG
SmilChr04G001447 Chr04 NC_080390.1:23773242-23773256promoter 内 2130-2144 bp + 1857 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 23775113-23780217(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AATGCCAACGTGGCA
SmilChr06G002356 Chr06 NC_080392.1:34309837-34309851promoter 内 2031-2045 bp + 1956 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 34306879-34307881(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTTGGCATT
SmilChr03G002438 Chr03 NC_080389.1:38719088-38719102promoter 内 1980-1994 bp + 2007 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 38716641-38717081(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGCCACGTCATTGAC
SmilChr01G005823 Chr01 NC_080387.1:74237867-74237881promoter 内 1879-1893 bp + 2108 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 74231108-74235759(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TTCCACGTGTTGTCT
SmilChr02G004850 Chr02 NC_080388.1:70647399-70647413promoter 内 1764-1778 bp + 2223 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 70649636-70654261(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AATGCCAACGTGGCA
SmilChr08G002913 Chr08 NC_080394.1:29099058-29099072promoter 内 1733-1747 bp + 2254 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 29101326-29104559(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TCCCACCACGTGGCC
SmilChr05G000888 Chr05 NC_080391.1:7033902-7033916promoter 内 1696-1710 bp + 2291 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 7036207-7039360(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGCTCCTACGTGGCA
SmilChr01G005824 Chr01 NC_080387.1:74237867-74237881promoter 内 1661-1675 bp + 2326 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 74240207-74241430(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGACAACACGTGGAA
SmilChr07G004076 Chr07 NC_080393.1:52218851-52218865promoter 内 1566-1580 bp + 2421 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 52213855-52216430(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTTGGCATT
SmilChr01G004594 Chr01 NC_080387.1:63926627-63926641promoter 内 1466-1480 bp + 2521 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 63929162-63930851(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AATGCCAACGTGGCA
SmilChr02G004585 Chr02 NC_080388.1:68340834-68340848promoter 内 1073-1087 bp + 2914 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 68343762-68346106(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CACTTTCACGTGGCG
SmilChr07G002217 Chr07 NC_080393.1:20408151-20408165promoter 内 1054-1068 bp - 2933 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 20411098-20417709(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTTGGCATT
SmilChr04G001844 Chr04 NC_080390.1:29996068-29996082promoter 内 992-1006 bp + 2995 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 29999077-30005186(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AATGCCAACGTGGCA
SmilChr06G000734 Chr06 NC_080392.1:6783876-6783890promoter 内 906-920 bp + 3081 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 6779082-6780795(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGCCACGTCATTGAC
SmilChr04G000699 Chr04 NC_080390.1:8153400-8153414promoter 内 888-902 bp - 3099 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 8149885-8150301(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CACTTTCACGTGGCG
SmilChr01G001861 Chr01 NC_080387.1:33567115-33567129promoter 内 837-851 bp - 3150 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 33570279-33572198(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTTGGCATT
SmilChr08G001733 Chr08 NC_080394.1:14580597-14580611promoter 内 780-794 bp - 3207 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 14571580-14577390(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGCTCCTACGTGGCA
SmilChr06G002690 Chr06 NC_080392.1:38820744-38820758promoter 内 720-734 bp - 3267 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 38824025-38827362(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTTAGCTTT
SmilChr02G004897 Chr02 NC_080388.1:70989342-70989356promoter 内 708-722 bp + 3279 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 70984733-70986063(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTTGGCATT
SmilChr04G000152 Chr04 NC_080390.1:1331711-1331725promoter 内 698-712 bp + 3289 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 1327590-1328422(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTAGGATTA
SmilChr04G001891 Chr04 NC_080390.1:30877556-30877570promoter 内 619-633 bp - 3368 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 30880938-30891666(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTTGGCATT
SmilChr04G001883 Chr04 NC_080390.1:30778874-30778888promoter 内 564-578 bp - 3423 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 30782311-30793000(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTTGGCATT
SmilChr03G003877 Chr03 NC_080389.1:57877555-57877569promoter 内 540-554 bp + 3447 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 57881016-57883408(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGTCGCCACGTGGAG
SmilChr02G000289 Chr02 NC_080388.1:3681177-3681191promoter 内 495-509 bp + 3492 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 3676633-3677685(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTTGGCATT
SmilChr07G001097 Chr07 NC_080393.1:8084836-8084850promoter 内 486-500 bp + 3501 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 8078234-8081335(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTTGGCATT
SmilChr03G003171 Chr03 NC_080389.1:49079705-49079719promoter 内 461-475 bp - 3526 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 49083245-49091468(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTTGGCATT
SmilChr08G002315 Chr08 NC_080394.1:21822233-21822247promoter 内 404-418 bp + 3583 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 21825830-21827874(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GTCAATGACGTGGCT
SmilChr01G002796 Chr01 NC_080387.1:46452217-46452231promoter 内 376-390 bp - 3611 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 46455842-46458021(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTTGGCATT
SmilChr04G000330 Chr04 NC_080390.1:3043443-3043457promoter 内 310-324 bp + 3677 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 3036384-3039766(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTAGGATTA
SmilChr06G001576 Chr06 NC_080392.1:17226520-17226534promoter 内 276-290 bp + 3711 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 17221077-17222809(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTTGGCATT
SmilChr05G003103 Chr05 NC_080391.1:39450152-39450166promoter 内 246-260 bp - 3741 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 39453907-39457013(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGCCACGTGGTGGTT
SmilChr07G001980 Chr07 NC_080393.1:17426185-17426199promoter 内 228-242 bp + 3759 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 17415221-17422426(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTTGGCATT
SmilChr01G005787 Chr01 NC_080387.1:73949252-73949266promoter 内 225-239 bp - 3762 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 73953028-73956878(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTCGATTGG
SmilChr02G003413 Chr02 NC_080388.1:55308669-55308683promoter 内 225-239 bp - 3762 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 55292135-55304907(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AACCACCACGTGGCT
SmilChr04G001764 Chr04 NC_080390.1:28989584-28989598promoter 内 223-237 bp - 3764 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 28993362-28995853(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTAGGAGCC
SmilChr08G001748 Chr08 NC_080394.1:14706915-14706929promoter 内 199-213 bp - 3788 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 14696655-14703127(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GTCAATGACGTGGCT
SmilChr05G001311 Chr05 NC_080391.1:11298137-11298151promoter 内 183-197 bp - 3804 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 11301955-11304810(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTAGGAGCC
SmilChr03G003528 Chr03 NC_080389.1:53893837-53893851promoter 内 162-176 bp - 3825 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 53889038-53890012(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TAATCCTACGTGGCA
SmilChr02G004893 Chr02 NC_080388.1:70957682-70957696promoter 内 143-157 bp - 3844 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 70961540-70963494(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGCCACGTCAAACGT
SmilChr03G002693 Chr03 NC_080389.1:42894324-42894338promoter 内 134-148 bp + 3853 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 42898191-42899268(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AATGCCAACGTGGCA
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SmilChr07G002144 Chr07 NC_080393.1:19608266-19608280promoter 内 4-18 bp + 3983 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 19601605-19604283(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTTGGCATT
SmilChr04G003384 Chr04 NC_080390.1:50387111-50387125promoter 内 2744-2758 bp - 1243 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 3 50380709-50385868(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TTCTTACACGTGTCA
SmilChr08G001732 Chr08 NC_080394.1:14564406-14564420promoter 内 2160-2174 bp - 1827 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 2 14566247-14571085(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGCCACGTGGATTTA
SmilChr06G001107 Chr06 NC_080392.1:11180102-11180116promoter 内 1989-2003 bp - 1998 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 2 11173743-11178104(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TAAATCCACGTGGCC
SmilChr05G001970 Chr05 NC_080391.1:20328897-20328911promoter 内 1842-1856 bp - 2145 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 2 20331056-20333011(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGCCACGTGGATTTA