转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G000260; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00013647-RA_Salv SmilChr05G000260 bZIP XP_057763683.1 MP00040 TGCTGACGTGGC

可能结合的靶基因

9919 个结合位点 6920 个候选靶基因 第 116 / 139 下载 TSV

上一页 116 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G002682 Chr02 NC_080388.1:46462970-46462981promoter 内 1666-1677 bp - 2324 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 46465305-46469714(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCTCGTCAGCC
SmilChr04G002608 Chr04 NC_080390.1:41494917-41494928promoter 内 1609-1620 bp + 2381 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 41491702-41492536(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCTCGTCAGCC
SmilChr01G000815 Chr01 NC_080387.1:17601655-17601666promoter 内 1477-1488 bp + 2513 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 17598615-17599142(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCCGAA
SmilChr04G000532 Chr04 NC_080390.1:5886018-5886029promoter 内 1361-1372 bp + 2629 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 5880920-5883389(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCGCGTCAGCT
SmilChr02G000058 Chr02 NC_080388.1:747858-747869promoter 内 1317-1328 bp - 2673 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 750542-752749(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGCACGTCAACC
SmilChr04G003477 Chr04 NC_080390.1:51229350-51229361promoter 内 1305-1316 bp + 2685 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 51232046-51234859(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGCTGACGGGGA
SmilChr02G000320 Chr02 NC_080388.1:4005682-4005693promoter 内 1292-1303 bp + 2698 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 4008391-4009094(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGGTGACGTGCA
SmilChr04G003106 Chr04 NC_080390.1:47630237-47630248promoter 内 1239-1250 bp - 2751 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 47626648-47627486(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGCTGACGAGGA
SmilChr03G003356 Chr03 NC_080389.1:51883489-51883500promoter 内 1118-1129 bp + 2872 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 51886372-51889616(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGCTGACGCGGT
SmilChr03G004357 Chr03 NC_080389.1:61781504-61781515promoter 内 1023-1034 bp - 2967 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 61784482-61788282(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGCACGTCATCT
SmilChr04G001065 Chr04 NC_080390.1:15226588-15226599promoter 内 893-904 bp - 3097 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 15219369-15223491(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGTTGACGTGCA
SmilChr01G003018 Chr01 NC_080387.1:49210261-49210272promoter 内 852-863 bp + 3138 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 49203621-49207123(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGCACGTCATCG
SmilChr02G000164 Chr02 NC_080388.1:2136047-2136058promoter 内 769-780 bp + 3221 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 2130772-2132826(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGCACGTCAACC
SmilChr04G001596 Chr04 NC_080390.1:26582305-26582316promoter 内 719-730 bp - 3271 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 26585587-26587743(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCGCGTCAGCT
SmilChr02G000975 Chr02 NC_080388.1:17048616-17048627promoter 内 643-654 bp + 3347 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 17041698-17045269(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGCACGTCATCG
SmilChr02G003827 Chr02 NC_080388.1:59930578-59930589promoter 内 473-484 bp + 3517 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 59934106-59935911(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGCTGACGAGGG
SmilChr04G000664 Chr04 NC_080390.1:7506120-7506131promoter 内 431-442 bp - 3559 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 7500051-7502561(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGCTGACGAGGG
SmilChr01G003628 Chr01 NC_080387.1:54824150-54824161promoter 内 426-437 bp + 3564 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 54817452-54820586(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCTCGTCAGCG
SmilChr04G002928 Chr04 NC_080390.1:45541901-45541912promoter 内 369-380 bp - 3621 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 45545533-45546438(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCTCGTCAGCC
SmilChr01G003825 Chr01 NC_080387.1:56582145-56582156promoter 内 310-321 bp + 3680 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 56585836-56587390(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGTTGACGTGCA
SmilChr01G003645 Chr01 NC_080387.1:54941679-54941690promoter 内 268-279 bp + 3722 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 54934911-54937957(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCTCGTCAGCG
SmilChr04G002610 Chr04 NC_080390.1:41494917-41494928promoter 内 53-64 bp + 3937 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 41498865-41499871(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGCTGACGAGGA
SmilChr02G001296 Chr02 NC_080388.1:23974041-23974052promoter 内 3241-3252 bp - 749 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 2 23972360-23973292(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGCTGACGGGTC
SmilChr01G002443 Chr01 NC_080387.1:42009158-42009169promoter 内 3091-3102 bp - 899 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 2 42010068-42015034(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AACACGTCAGTT
SmilChr04G000843 Chr04 NC_080390.1:10656966-10656977promoter 内 2737-2748 bp + 1253 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 2 10658230-10661709(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGCTGACGGGTC
SmilChr01G002219 Chr01 NC_080387.1:38528182-38528193promoter 内 2354-2365 bp + 1636 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 2 38529829-38534249(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CTCTGACGTAGC
SmilChr01G002761 Chr01 NC_080387.1:46014624-46014635promoter 内 2354-2365 bp - 1636 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 2 46007200-46012988(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CTCTGACGTAGC
SmilChr02G002589 Chr02 NC_080388.1:45010720-45010731promoter 内 2354-2365 bp - 1636 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 2 45004944-45009084(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CTCTGACGTAGC
SmilChr05G000053 Chr05 NC_080391.1:250283-250294promoter 内 2092-2103 bp + 1898 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 2 252192-253007(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ATCTGACGTGTA
SmilChr02G000698 Chr02 NC_080388.1:11121353-11121364promoter 内 1825-1836 bp - 2165 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 2 11114974-11119188(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CTCTGACGTTGC
SmilChr04G003789 Chr04 NC_080390.1:54057392-54057403promoter 内 1719-1730 bp - 2271 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 2 54059674-54077830(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCTACGTCAGAG
SmilChr04G001930 Chr04 NC_080390.1:31409802-31409813promoter 内 1568-1579 bp + 2422 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 2 31404416-31407380(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCTACGTCAGAG
SmilChr03G002424 Chr03 NC_080389.1:38512647-38512658promoter 内 1472-1483 bp - 2518 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 2 38506408-38510129(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTGTGACGTGCC
SmilChr04G001855 Chr04 NC_080390.1:30191102-30191113promoter 内 851-862 bp + 3139 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 2 30186711-30187963(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGCTCC
SmilChr01G005384 Chr01 NC_080387.1:71123403-71123414promoter 内 3909-3920 bp - 81 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 71121235-71123322(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CACTGACGTAGC
SmilChr03G003774 Chr03 NC_080389.1:56913115-56913126promoter 内 3895-3906 bp + 95 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 56910855-56913020(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGCCCT
SmilChr04G001931 Chr04 NC_080390.1:31409802-31409813promoter 内 3834-3845 bp + 156 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 31409969-31411453(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CTCTGACGTAGC
SmilChr01G002857 Chr01 NC_080387.1:47157257-47157268promoter 内 3635-3646 bp - 355 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 47154333-47156902(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CACTGACGTTGC
SmilChr01G004433 Chr01 NC_080387.1:62424995-62425006promoter 内 3589-3600 bp - 401 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 62425407-62433090(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGCACC
SmilChr01G000324 Chr01 NC_080387.1:6408604-6408615promoter 内 3307-3318 bp + 683 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 6409298-6410059(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGCTGACGGGTC
SmilChr04G000796 Chr04 NC_080390.1:9836453-9836464promoter 内 3283-3294 bp - 707 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 9833809-9835746(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGCTGACGGGTC
SmilChr01G001038 Chr01 NC_080387.1:21606570-21606581promoter 内 3240-3251 bp + 750 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 21607331-21608758(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGCTGACGGGTC
SmilChr01G004174 Chr01 NC_080387.1:60209257-60209268promoter 内 2918-2929 bp - 1072 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 60210340-60214173(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TACACGTCAGAT
SmilChr02G002491 Chr02 NC_080388.1:43344052-43344063promoter 内 2813-2824 bp + 1177 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 43336395-43342875(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TACACGTCAGAT
SmilChr01G003567 Chr01 NC_080387.1:54251458-54251469promoter 内 2803-2814 bp - 1187 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 54249052-54250271(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ATCTGACGTGTA
SmilChr03G002876 Chr03 NC_080389.1:45446292-45446303promoter 内 2756-2767 bp + 1234 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 45447537-45449473(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CTCTGACGTAGC
SmilChr02G002846 Chr02 NC_080388.1:48621488-48621499promoter 内 2741-2752 bp + 1249 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 48622748-48628263(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ATCTGACGTGTA
SmilChr03G000760 Chr03 NC_080389.1:8687432-8687443promoter 内 2625-2636 bp - 1365 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 8688808-8713050(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AACACGTCAGAT
SmilChr01G005402 Chr01 NC_080387.1:71271919-71271930promoter 内 2175-2186 bp + 1815 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 71273745-71277413(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AACTGACGTGTA
SmilChr01G003568 Chr01 NC_080387.1:54251458-54251469promoter 内 2111-2122 bp - 1879 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 54253348-54255051(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TACACGTCAGAT