转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G001518; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00023584-RA_Salv SmilChr05G001518 WRKY XP_057765511.1 MP00455 AACGTTGACTATT

可能结合的靶基因

9792 个结合位点 6900 个候选靶基因 第 119 / 138 下载 TSV

上一页 119 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G005257 Chr01 NC_080387.1:70072794-70072806promoter 内 3629-3641 bp - 360 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 70073166-70073965(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CTTAGTCAAAATT
SmilChr01G005969 Chr01 NC_080387.1:75380553-75380565promoter 内 3583-3595 bp - 406 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 75380971-75383380(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTTAGTCAAACAT
SmilChr01G004411 Chr01 NC_080387.1:62214055-62214067promoter 内 3568-3580 bp - 421 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 62214488-62219697(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TAGAGTCAACTCA
SmilChr01G003412 Chr01 NC_080387.1:52779387-52779399promoter 内 3535-3547 bp + 454 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 52779853-52783945(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CAGTTTGACTAAG
SmilChr01G005083 Chr01 NC_080387.1:68709201-68709213promoter 内 3495-3507 bp + 494 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 68709707-68710950(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATTTTGACTAAT
SmilChr02G004130 Chr02 NC_080388.1:63560977-63560989promoter 内 3467-3479 bp + 522 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 63558436-63560455(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTTAGTCAAACAT
SmilChr02G005522 Chr02 NC_080388.1:75308955-75308967promoter 内 3437-3449 bp - 552 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 75307611-75308403(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CAAGTTGACTTGC
SmilChr02G002040 Chr02 NC_080388.1:36716427-36716439promoter 内 3394-3406 bp - 595 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 36717034-36718891(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CTTAGTCAAAATT
SmilChr01G001881 Chr01 NC_080387.1:33823493-33823505promoter 内 3385-3397 bp + 604 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 33824109-33826573(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GAATTTGACTATT
SmilChr01G005968 Chr01 NC_080387.1:75380553-75380565promoter 内 3384-3396 bp - 605 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 75378514-75379948(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATGTTTGACTAAA
SmilChr02G004717 Chr02 NC_080388.1:69438226-69438238promoter 内 3384-3396 bp + 605 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 69438843-69440768(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATTTTGACTATA
SmilChr01G001683 Chr01 NC_080387.1:31043147-31043159promoter 内 3253-3265 bp - 736 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 31038720-31042411(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CTTGTTGACTGAC
SmilChr02G003049 Chr02 NC_080388.1:51286661-51286673promoter 内 3222-3234 bp + 767 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 51287440-51289156(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TGCATTGACTATA
SmilChr01G001842 Chr01 NC_080387.1:33369946-33369958promoter 内 3187-3199 bp + 802 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 33362876-33369144(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCCAGTCAACTTG
SmilChr03G003256 Chr03 NC_080389.1:50452340-50452352promoter 内 3115-3127 bp - 874 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 50448036-50451466(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TGAGTTGACTCAT
SmilChr01G005112 Chr01 NC_080387.1:68901026-68901038promoter 内 3113-3125 bp - 876 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 68899026-68900150(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GAATTTGACTATT
SmilChr03G004152 Chr03 NC_080389.1:60329405-60329417promoter 内 3067-3079 bp + 922 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 60327817-60328483(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACTAGTCAAATCA
SmilChr02G003868 Chr02 NC_080388.1:60690097-60690109promoter 内 2966-2978 bp + 1023 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 60691132-60696390(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATTTTGACTAAT
SmilChr01G004494 Chr01 NC_080387.1:63063742-63063754promoter 内 2924-2936 bp + 1065 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 63064819-63070667(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATTTTGACTAAT
SmilChr03G004153 Chr03 NC_080389.1:60329405-60329417promoter 内 2891-2903 bp + 1098 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 60330515-60335182(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TGATTTGACTAGT
SmilChr03G000055 Chr03 NC_080389.1:531632-531644promoter 内 2879-2891 bp - 1110 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 529683-530522(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TGAGTTGACTCAT
SmilChr01G001108 Chr01 NC_080387.1:22706390-22706402promoter 内 2796-2808 bp - 1193 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 22699351-22705197(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TGCATTGACTAAG
SmilChr02G001352 Chr02 NC_080388.1:25292427-25292439promoter 内 2786-2798 bp - 1203 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 25288281-25291224(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATTTTGACTATA
SmilChr01G004754 Chr01 NC_080387.1:65742580-65742592promoter 内 2744-2756 bp - 1245 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 65743837-65744217(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TCTAGTCAAACTG
SmilChr02G005520 Chr02 NC_080388.1:75301946-75301958promoter 内 2666-2678 bp - 1323 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 75292744-75300623(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CAAGTTGACTTGC
SmilChr03G003298 Chr03 NC_080389.1:51096678-51096690promoter 内 2649-2661 bp + 1340 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 51098030-51098693(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTTGTTGACTCGA
SmilChr01G005430 Chr01 NC_080387.1:71470396-71470408promoter 内 2601-2613 bp - 1388 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 71464347-71469008(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TGAGTTGACTCAG
SmilChr02G005523 Chr02 NC_080388.1:75314682-75314694promoter 内 2585-2597 bp - 1404 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 75309256-75313278(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CAAGTTGACTTGC
SmilChr02G005264 Chr02 NC_080388.1:73740045-73740057promoter 内 2518-2530 bp - 1471 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 73734651-73738574(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATGTTTGACTAAA
SmilChr01G003011 Chr01 NC_080387.1:49142656-49142668promoter 内 2480-2492 bp - 1509 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 49144177-49145236(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CTTAGTCAAAATT
SmilChr02G005247 Chr02 NC_080388.1:73615269-73615281promoter 内 2477-2489 bp + 1512 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 73616793-73625585(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATTTTGACTAAT
SmilChr01G003961 Chr01 NC_080387.1:58001403-58001415promoter 内 2431-2443 bp + 1558 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 58002973-58005486(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCCATTGACTACT
SmilChr03G003087 Chr03 NC_080389.1:47915910-47915922promoter 内 2388-2400 bp - 1601 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 47914238-47914309(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATGTTTGACTAAA
SmilChr02G004131 Chr02 NC_080388.1:63568983-63568995promoter 内 2362-2374 bp - 1627 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 63564095-63567356(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATGTTTGACTAAA
SmilChr03G002519 Chr03 NC_080389.1:40153900-40153912promoter 内 2225-2237 bp - 1764 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 40137796-40152136(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATGTTTGACTAAA
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