转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G004607; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00002089-RA_Salv SmilChr02G004607 C2H2 XP_057791470.1 MP00608 AAAAACAGAGCA

可能结合的靶基因

9817 个结合位点 6398 个候选靶基因 第 12 / 128 下载 TSV

上一页 12 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G004302 Chr01 NC_080387.1:61195754-61195765promoter 内 3214-3225 bp + 776 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 61196541-61197712(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAAACAGAGCA
SmilChr01G001382 Chr01 NC_080387.1:27232272-27232283promoter 内 3208-3219 bp - 782 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 27230601-27231490(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAAACAGAGCA
SmilChr02G000327 Chr02 NC_080388.1:4132497-4132508promoter 内 3205-3216 bp - 785 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 4130655-4131712(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAAACAGAGCA
SmilChr03G000408 Chr03 NC_080389.1:4438163-4438174promoter 内 3137-3148 bp + 853 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 4436879-4437310(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTTTCA
SmilChr01G000525 Chr01 NC_080387.1:10704912-10704923promoter 内 3120-3131 bp - 870 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 10702889-10704042(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAGCT
SmilChr03G001448 Chr03 NC_080389.1:17272005-17272016promoter 内 3054-3065 bp - 936 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 17272952-17277546(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGCTCTGTTTTT
SmilChr03G000355 Chr03 NC_080389.1:3976310-3976321promoter 内 3035-3046 bp + 955 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 3977276-3978322(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAAACAGAGCA
SmilChr03G000381 Chr03 NC_080389.1:4264003-4264014promoter 内 3014-3025 bp - 976 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 4261829-4263027(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TAAAACAGAGCA
SmilChr01G006072 Chr01 NC_080387.1:76159688-76159699promoter 内 3011-3022 bp - 979 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 76157690-76158709(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAAACAGAGCA
SmilChr02G003212 Chr02 NC_080388.1:53305435-53305446promoter 内 3006-3017 bp + 984 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 53302853-53304451(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGCTCTGTTTCT
SmilChr03G001084 Chr03 NC_080389.1:12549224-12549235promoter 内 2985-2996 bp + 1005 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 12550240-12551313(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TAAAACAGAGCA
SmilChr02G001373 Chr02 NC_080388.1:25976576-25976587promoter 内 2942-2953 bp - 1048 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 25972695-25975528(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGAAACAGAGCT
SmilChr01G002409 Chr01 NC_080387.1:41461048-41461059promoter 内 2940-2951 bp + 1050 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 41462109-41463061(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAAACAGAGCA
SmilChr02G001047 Chr02 NC_080388.1:18536629-18536640promoter 内 2934-2945 bp + 1056 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 18535094-18535573(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGCTCTGTTTTT
SmilChr03G000043 Chr03 NC_080389.1:485523-485534promoter 内 2716-2727 bp - 1274 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 486808-487809(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGCTCTGTTTTT
SmilChr03G000991 Chr03 NC_080389.1:11265201-11265212promoter 内 2679-2690 bp - 1311 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 11266523-11270323(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GGCTCTGTTTTG
SmilChr01G003884 Chr01 NC_080387.1:57162809-57162820promoter 内 2599-2610 bp + 1391 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 57164211-57166340(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAGCT
SmilChr01G005266 Chr01 NC_080387.1:70116696-70116707promoter 内 2437-2448 bp + 1553 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 70118260-70118942(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGAAACAGAGCT
SmilChr01G003445 Chr01 NC_080387.1:53019991-53020002promoter 内 2287-2298 bp - 1703 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 53021705-53025410(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTTTTA
SmilChr03G000643 Chr03 NC_080389.1:7132613-7132624promoter 内 2243-2254 bp + 1747 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 7127426-7130866(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTTTCA
SmilChr02G005276 Chr02 NC_080388.1:73823295-73823306promoter 内 2217-2228 bp - 1773 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 73825079-73825676(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTTTCA
SmilChr01G004017 Chr01 NC_080387.1:58558549-58558560promoter 内 2204-2215 bp + 1786 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 58560346-58570392(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAGCT
SmilChr02G000942 Chr02 NC_080388.1:16442545-16442556promoter 内 2197-2208 bp + 1793 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 16444349-16445508(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAAACAGAGCA
SmilChr02G002568 Chr02 NC_080388.1:44682069-44682080promoter 内 2118-2129 bp - 1872 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 44676486-44680197(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGAAACAGAGCT
SmilChr01G000957 Chr01 NC_080387.1:20232106-20232117promoter 内 2117-2128 bp - 1873 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 20229260-20230233(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAGCT
SmilChr01G001664 Chr01 NC_080387.1:30722501-30722512promoter 内 2034-2045 bp + 1956 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 30719296-30720545(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTTTCA
SmilChr02G003869 Chr02 NC_080388.1:60700345-60700356promoter 内 2011-2022 bp - 1979 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 60702335-60705004(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGCTCTGTTTTT
SmilChr03G000651 Chr03 NC_080389.1:7238802-7238813promoter 内 2006-2017 bp - 1984 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 7240797-7244004(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GGCTCTGTTTTG
SmilChr03G000962 Chr03 NC_080389.1:10862132-10862143promoter 内 1974-1985 bp + 2016 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 10858831-10860116(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTTTCA
SmilChr01G005463 Chr01 NC_080387.1:71634907-71634918promoter 内 1871-1882 bp - 2119 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 71637037-71641223(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTTTCA
SmilChr03G001472 Chr03 NC_080389.1:17564146-17564157promoter 内 1835-1846 bp - 2155 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 17560909-17561991(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAAACAGAGCA
SmilChr01G005284 Chr01 NC_080387.1:70211397-70211408promoter 内 1786-1797 bp + 2204 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 70213612-70214342(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGAAACAGAGCT
SmilChr01G001589 Chr01 NC_080387.1:29921600-29921611promoter 内 1666-1677 bp + 2324 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 29915355-29919276(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTTTCA
SmilChr01G005427 Chr01 NC_080387.1:71452037-71452048promoter 内 1641-1652 bp - 2349 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 71448583-71449688(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGAAACAGAGCT
SmilChr03G000466 Chr03 NC_080389.1:5002553-5002564promoter 内 1600-1611 bp - 2390 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 4977151-5000163(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAAACAGAGCA
SmilChr02G005133 Chr02 NC_080388.1:72776422-72776433promoter 内 1490-1501 bp - 2500 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 72778933-72781542(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GGCTCTGTTTTG
SmilChr03G001494 Chr03 NC_080389.1:18228541-18228552promoter 内 1467-1478 bp - 2523 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 18231075-18233159(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTTTCA
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SmilChr02G001135 Chr02 NC_080388.1:20484050-20484061promoter 内 1277-1288 bp - 2713 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 20476332-20481337(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAAACAGAGCA
SmilChr02G002195 Chr02 NC_080388.1:39165639-39165650promoter 内 1102-1113 bp + 2888 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 39161798-39162751(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTTTTA
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SmilChr03G001406 Chr03 NC_080389.1:16659923-16659934promoter 内 924-935 bp + 3066 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 16663000-16664166(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TAAAACAGAGCA
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SmilChr01G005728 Chr01 NC_080387.1:73425266-73425277promoter 内 759-770 bp + 3231 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 73419687-73422035(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGCTCTGTTTCT
SmilChr01G000825 Chr01 NC_080387.1:17795307-17795318promoter 内 735-746 bp - 3255 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 17789722-17792052(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAGCT
SmilChr01G002391 Chr01 NC_080387.1:41172837-41172848promoter 内 668-679 bp - 3322 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 41176170-41179598(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTTTCA
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