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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。

预计算阈值必须与当前索引一致。非法、未支持或需四舍五入的输入会报错；页面与下载均不会自动切换阈值。

257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因，每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004199; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010571-RA_Salv SmilChr01G004199 bHLH XP_057782208.1 MP00074 AGAAGGTCACGTGG

可能结合的靶基因

9969 个结合位点 7396 个候选靶基因 第 120 / 148 下载 TSV

上一页 120 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G005736 Chr01 NC_080387.1:73488740-73488753promoter 内 3516-3529 bp + 472 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 73489225-73490124(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AATACTTCACGTGC
SmilChr01G006079 Chr01 NC_080387.1:76236407-76236420promoter 内 3516-3529 bp + 472 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 76236892-76237794(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AATACTTCACGTGC
SmilChr01G006138 Chr01 NC_080387.1:76890314-76890327promoter 内 3516-3529 bp + 472 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 76890799-76892272(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AATACTTCACGTGC
SmilChr01G006085 Chr01 NC_080387.1:76337809-76337822promoter 内 3515-3528 bp + 473 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 76338295-76339200(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AATACTTCACGTGC
SmilChr01G006108 Chr01 NC_080387.1:76624438-76624451promoter 内 3515-3528 bp + 473 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 76624924-76625847(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AATACTTCACGTGC
SmilChr01G006159 Chr01 NC_080387.1:77004638-77004651promoter 内 3515-3528 bp - 473 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 77003151-77004165(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AATACTTCACGTGC
SmilChr01G006101 Chr01 NC_080387.1:76518922-76518935promoter 内 3513-3526 bp + 475 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 76519410-76520333(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AATACTTCACGTGC
SmilChr05G003513 Chr05 NC_080391.1:46939689-46939702promoter 内 3471-3484 bp - 517 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 46940219-46950484(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTTCAACA
SmilChr04G003474 Chr04 NC_080390.1:51196977-51196990promoter 内 3441-3454 bp - 547 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 51192356-51196430(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGTTTCTCACGTGC
SmilChr06G003207 Chr06 NC_080392.1:44888456-44888469promoter 内 3405-3418 bp - 583 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 44889052-44892896(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGATATACA
SmilChr06G003216 Chr06 NC_080392.1:44937391-44937404promoter 内 3402-3415 bp - 586 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 44937990-44941818(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGATATACA
SmilChr07G001927 Chr07 NC_080393.1:16676917-16676930promoter 内 3356-3369 bp + 632 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 16677562-16681044(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TAGTTGTCACGTGT
SmilChr07G001689 Chr07 NC_080393.1:14307047-14307060promoter 内 3321-3334 bp - 667 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 14307727-14315705(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTAATTTG
SmilChr06G003267 Chr06 NC_080392.1:45301230-45301243promoter 内 3195-3208 bp - 793 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 45297471-45300437(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTACTATCACGTGG
SmilChr02G000592 Chr02 NC_080388.1:8481666-8481679promoter 内 3167-3180 bp + 821 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 8471205-8480845(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGATATAAT
SmilChr07G004268 Chr07 NC_080393.1:55101002-55101015promoter 内 3165-3178 bp - 823 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 55091424-55100179(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TTTGCATCACGTGC
SmilChr07G004249 Chr07 NC_080393.1:54923992-54924005promoter 内 3136-3149 bp + 852 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 54924857-54933589(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TTTGCATCACGTGC
SmilChr03G004175 Chr03 NC_080389.1:60489025-60489038promoter 内 3098-3111 bp + 890 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 60489928-60492841(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGAAATTCACGTGT
SmilChr03G004176 Chr03 NC_080389.1:60489025-60489038promoter 内 3092-3105 bp + 896 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 60489934-60498314(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGAAATTCACGTGT
SmilChr07G001364 Chr07 NC_080393.1:10553487-10553500promoter 内 3078-3091 bp + 910 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 10551172-10552577(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCAATAAT
SmilChr07G001458 Chr07 NC_080393.1:11423749-11423762promoter 内 3057-3070 bp - 931 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 11424693-11427448(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGATGCAAA
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SmilChr07G001372 Chr07 NC_080393.1:10641706-10641719promoter 内 2891-2904 bp + 1097 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 10639206-10640609(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCAATAAT
SmilChr08G001211 Chr08 NC_080394.1:9799512-9799525promoter 内 2847-2860 bp - 1141 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 9789896-9798371(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TAGGTATCACGTGC
SmilChr04G003865 Chr04 NC_080390.1:54571640-54571653promoter 内 2822-2835 bp - 1166 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 54565330-54570474(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATAAACTCACGTGT
SmilChr08G001484 Chr08 NC_080394.1:11954200-11954213promoter 内 2768-2781 bp + 1220 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 11955433-11959459(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTTTCATCACGTGG
SmilChr03G000096 Chr03 NC_080389.1:1065289-1065302promoter 内 2604-2617 bp - 1384 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 1066686-1072914(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGATGGTCA
SmilChr08G001416 Chr08 NC_080394.1:11342181-11342194promoter 内 2562-2575 bp + 1426 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 11335875-11340755(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGACAACTA
SmilChr01G006114 Chr01 NC_080387.1:76669724-76669737promoter 内 2555-2568 bp + 1433 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 76671170-76671983(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AATACTTCACGTGC
SmilChr04G001561 Chr04 NC_080390.1:25908738-25908751promoter 内 2439-2452 bp + 1549 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 25910300-25911847(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTAGAATCACGTGA
SmilChr02G002938 Chr02 NC_080388.1:49891349-49891362promoter 内 2432-2445 bp + 1556 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 49884668-49889793(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGATTTACC
SmilChr07G001930 Chr07 NC_080393.1:16697109-16697122promoter 内 2359-2372 bp + 1629 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 16692280-16695480(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCTCGACA
SmilChr03G001408 Chr03 NC_080389.1:16713937-16713950promoter 内 2323-2336 bp + 1665 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 16715615-16718826(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CTATGTTCACGTGG
SmilChr01G006137 Chr01 NC_080387.1:76890314-76890327promoter 内 2316-2329 bp + 1672 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 76884284-76888642(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGAAGTATT
SmilChr05G002037 Chr05 NC_080391.1:21197880-21197893promoter 内 2294-2307 bp + 1694 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 21199587-21199659(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CTACTCACACGTGG
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SmilChr04G004176 Chr04 NC_080390.1:56367771-56367784promoter 内 2087-2100 bp - 1901 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 56362912-56365870(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAGGTTTCACGTGA
SmilChr07G003530 Chr07 NC_080393.1:40573674-40573687promoter 内 1985-1998 bp - 2003 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 40575690-40576590(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGAAACACA
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SmilChr01G000488 Chr01 NC_080387.1:9954095-9954108promoter 内 1884-1897 bp - 2104 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 9950355-9951991(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GAACCTTCACGTGC
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SmilChr07G003745 Chr07 NC_080393.1:45672217-45672230promoter 内 1754-1767 bp - 2234 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 45674464-45679456(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGAATCACA
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SmilChr01G003155 Chr01 NC_080387.1:50336295-50336308promoter 内 1726-1739 bp - 2262 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 50338570-50344717(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGACAACTA
SmilChr03G003715 Chr03 NC_080389.1:56116287-56116300promoter 内 1713-1726 bp - 2275 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 56118575-56123142(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTTGTAAG
SmilChr01G004097 Chr01 NC_080387.1:59418856-59418869promoter 内 1628-1641 bp - 2360 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 59421229-59424877(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGATGCAAA
SmilChr07G001893 Chr07 NC_080393.1:16349617-16349630promoter 内 1624-1637 bp - 2364 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 16346138-16347253(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TTTTGCCCACGTGG