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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G005851; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00011948-RA_Salv SmilChr01G005851 MYB XP_057789306.1 MP00055 CAGATAAGGT

可能结合的靶基因

9685 个结合位点 6638 个候选靶基因 第 121 / 133 下载 TSV

上一页 121 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G005082 Chr01 NC_080387.1:68696369-68696378promoter 内 76-85 bp - 3916 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 68700294-68701229(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CACTTATCTA
SmilChr02G002080 Chr02 NC_080388.1:37384486-37384495promoter 内 39-48 bp - 3953 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 37388448-37388789(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 TCTTTATCTG
SmilChr02G000946 Chr02 NC_080388.1:16477700-16477709promoter 内 25-34 bp - 3967 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 16481676-16483898(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 TCTTTATCTG
SmilChr02G000143 Chr02 NC_080388.1:1918147-1918156promoter 内 23-32 bp + 3969 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 1922125-1924139(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAAGA
SmilChr02G005599 Chr02 NC_080388.1:75707142-75707151promoter 内 15-24 bp + 3977 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 75711128-75714339(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAGAA
SmilChr01G005695 Chr01 NC_080387.1:73234570-73234579promoter 内 8-17 bp - 3984 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 73223758-73230586(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAGAA
SmilChr01G002820 Chr01 NC_080387.1:46756377-46756386promoter 内 5-14 bp + 3987 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 46760373-46763928(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 TAGATAAGAG
SmilChr02G001884 Chr02 NC_080388.1:34163822-34163831promoter 内 3883-3892 bp - 109 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 34163940-34164729(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ATCTTATCTC
SmilChr01G002751 Chr01 NC_080387.1:45829351-45829360promoter 内 3733-3742 bp - 259 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 45827404-45829092(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GAGATAAGAT
SmilChr01G001427 Chr01 NC_080387.1:27918156-27918165promoter 内 3701-3710 bp + 291 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 27918456-27919332(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GAGATAAGAT
SmilChr02G000181 Chr02 NC_080388.1:2311541-2311550promoter 内 3449-3458 bp - 543 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 2303750-2310998(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GAGATAAGAT
SmilChr02G004752 Chr02 NC_080388.1:69719408-69719417promoter 内 3150-3159 bp - 842 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 69720259-69726423(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ATCTTATCTC
SmilChr03G000825 Chr03 NC_080389.1:9444284-9444293promoter 内 3118-3127 bp + 874 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 9439215-9443410(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CTCTTATCTC
SmilChr01G000307 Chr01 NC_080387.1:6000802-6000811promoter 内 2945-2954 bp + 1047 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 5996885-5999755(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AACTTATCTC
SmilChr01G003333 Chr01 NC_080387.1:52036405-52036414promoter 内 2909-2918 bp + 1083 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 52032767-52035322(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AACTTATCTC
SmilChr02G004587 Chr02 NC_080388.1:68351121-68351130promoter 内 2861-2870 bp + 1131 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 68352261-68355449(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GAGATAAGAT
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SmilChr02G005549 Chr02 NC_080388.1:75476491-75476500promoter 内 2470-2479 bp - 1522 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 75470795-75474969(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GAGATAAGAT
SmilChr01G002362 Chr01 NC_080387.1:40782311-40782320promoter 内 2437-2446 bp + 1555 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 40777094-40780756(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CTCTTATCTC
SmilChr02G001382 Chr02 NC_080388.1:26146999-26147008promoter 内 2124-2133 bp - 1868 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 26148876-26151562(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ATCTTATCTC
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SmilChr01G000310 Chr01 NC_080387.1:6011013-6011022promoter 内 1538-1547 bp + 2454 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 6013476-6058274(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GAGATAAGAT
SmilChr01G002496 Chr01 NC_080387.1:42764092-42764101promoter 内 1306-1315 bp + 2686 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 42756988-42761406(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ATCTTATCTC
SmilChr01G006149 Chr01 NC_080387.1:76957099-76957108promoter 内 1187-1196 bp + 2805 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 76959913-76962545(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AAGATAAGCG
SmilChr03G000826 Chr03 NC_080389.1:9444699-9444708promoter 内 1087-1096 bp + 2905 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 9447613-9448063(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GAGATAAGAG
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SmilChr03G000322 Chr03 NC_080389.1:3692511-3692520promoter 内 684-693 bp + 3308 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 3689097-3689203(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AACTTATCTC
SmilChr03G000323 Chr03 NC_080389.1:3701285-3701294promoter 内 683-692 bp + 3309 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 3697870-3697976(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AACTTATCTC
SmilChr02G004136 Chr02 NC_080388.1:63621395-63621404promoter 内 656-665 bp - 3336 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 63624740-63624846(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AACTTATCTC
SmilChr02G000705 Chr02 NC_080388.1:11342942-11342951promoter 内 647-656 bp + 3345 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 11339491-11339597(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AACTTATCTC
SmilChr02G004138 Chr02 NC_080388.1:63650152-63650161promoter 内 624-633 bp - 3368 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 63653529-63653635(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AACTTATCTC
SmilChr03G000578 Chr03 NC_080389.1:6416686-6416695promoter 内 447-456 bp + 3545 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 6412203-6413141(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AGCTTATCTT
SmilChr02G004842 Chr02 NC_080388.1:70543195-70543204promoter 内 358-367 bp + 3634 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 70546838-70550264(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AAGATAAGCT
SmilChr03G000324 Chr03 NC_080389.1:3701285-3701294promoter 内 303-312 bp + 3689 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 3704983-3705089(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GAGATAAGTT
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SmilChr03G000622 Chr03 NC_080389.1:6862312-6862321promoter 内 3976-3985 bp - 16 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 6861170-6862296(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GAGATAAGTT
SmilChr01G002363 Chr01 NC_080387.1:40782419-40782428promoter 内 3959-3968 bp + 33 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 40781386-40782386(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CTCTTATCTC
SmilChr01G004592 Chr01 NC_080387.1:63921371-63921380promoter 内 3937-3946 bp + 55 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 63921435-63922453(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GAGATAAGTT
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SmilChr03G001080 Chr03 NC_080389.1:12502261-12502270promoter 内 3919-3928 bp + 73 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 12498885-12502188(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CACTTATCTC
SmilChr03G001081 Chr03 NC_080389.1:12508291-12508300promoter 内 3919-3928 bp + 73 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 12504915-12508218(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CACTTATCTC
SmilChr02G003192 Chr02 NC_080388.1:53077262-53077271promoter 内 3887-3896 bp - 105 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 53075701-53077157(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GAGATAAGAG
SmilChr02G003289 Chr02 NC_080388.1:54167249-54167258promoter 内 3887-3896 bp + 105 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 54165330-54167144(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ATCTTATCTC
SmilChr01G000337 Chr01 NC_080387.1:6928576-6928585promoter 内 3879-3888 bp - 113 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 6928698-6929318(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ATCTTATCTC
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SmilChr01G004118 Chr01 NC_080387.1:59711016-59711025promoter 内 3870-3879 bp + 122 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 59711147-59712513(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GAGATAAGCA
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SmilChr01G002596 Chr01 NC_080387.1:44142476-44142485promoter 内 3849-3858 bp - 143 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 44142628-44144828(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CGCTTATCTT