转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G005012; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00013472-RA_Salv SmilChr02G005012 TALE XP_057792191.1 MP00670 AGTGACGGCA

可能结合的靶基因

9906 个结合位点 7758 个候选靶基因 第 121 / 156 下载 TSV

上一页 121 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G000855 Chr04 NC_080390.1:10819004-10819013promoter 内 3176-3185 bp - 816 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 10817802-10818188(-) SMil_00013472-RA_Salv MP00670 AGTGACGGAT
SmilChr03G000086 Chr03 NC_080389.1:991491-991500promoter 内 3172-3181 bp - 820 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 989522-990671(-) SMil_00013472-RA_Salv MP00670 GGTGACGGTG
SmilChr06G000406 Chr06 NC_080392.1:3320396-3320405promoter 内 3170-3179 bp + 822 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 3308612-3319574(-) SMil_00013472-RA_Salv MP00670 CACCGTCACC
SmilChr01G001894 Chr01 NC_080387.1:34056115-34056124promoter 内 3153-3162 bp + 839 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 34056963-34060942(+) SMil_00013472-RA_Salv MP00670 GGTGACGGTG
SmilChr02G001998 Chr02 NC_080388.1:36144821-36144830promoter 内 3152-3161 bp - 840 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 36143542-36143981(-) SMil_00013472-RA_Salv MP00670 GGTGACGGAG
SmilChr02G002037 Chr02 NC_080388.1:36665180-36665189promoter 内 3133-3142 bp - 859 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 36666048-36673497(+) SMil_00013472-RA_Salv MP00670 GTCCGTCACC
SmilChr01G005903 Chr01 NC_080387.1:74916746-74916755promoter 内 3112-3121 bp + 880 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 74913834-74915866(-) SMil_00013472-RA_Salv MP00670 ATCCGTCACT
SmilChr02G004064 Chr02 NC_080388.1:62942818-62942827promoter 内 3102-3111 bp + 890 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 62939108-62941928(-) SMil_00013472-RA_Salv MP00670 GTCCGTCACC
SmilChr01G004840 Chr01 NC_080387.1:66533833-66533842promoter 内 3099-3108 bp + 893 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 66534735-66537276(+) SMil_00013472-RA_Salv MP00670 GGTGACGGTC
SmilChr02G003343 Chr02 NC_080388.1:54660005-54660014promoter 内 3060-3069 bp + 932 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 54660946-54666348(+) SMil_00013472-RA_Salv MP00670 GGTGACGGAC
SmilChr06G001858 Chr06 NC_080392.1:22018953-22018962promoter 内 3058-3067 bp - 934 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 22019896-22025604(+) SMil_00013472-RA_Salv MP00670 GTCCGTCACC
SmilChr06G000333 Chr06 NC_080392.1:2491924-2491933promoter 内 3055-3064 bp + 937 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 2487023-2490987(-) SMil_00013472-RA_Salv MP00670 CACCGTCACC
SmilChr02G002804 Chr02 NC_080388.1:48113015-48113024promoter 内 3036-3045 bp - 956 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 48113980-48115436(+) SMil_00013472-RA_Salv MP00670 GTCCGTCACC
SmilChr03G001153 Chr03 NC_080389.1:13313245-13313254promoter 内 3023-3032 bp - 969 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 13308143-13312276(-) SMil_00013472-RA_Salv MP00670 AGTGACGGAT
SmilChr02G003994 Chr02 NC_080388.1:62278653-62278662promoter 内 3021-3030 bp + 971 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 62259906-62277682(-) SMil_00013472-RA_Salv MP00670 CACCGTCACC
SmilChr02G002602 Chr02 NC_080388.1:45154745-45154754promoter 内 3015-3024 bp - 977 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 45155731-45157723(+) SMil_00013472-RA_Salv MP00670 GACCGTCACC
SmilChr02G000543 Chr02 NC_080388.1:7497240-7497249promoter 内 2984-2993 bp + 1008 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 7493156-7496232(-) SMil_00013472-RA_Salv MP00670 CTCCGTCACC
SmilChr06G000912 Chr06 NC_080392.1:8635578-8635587promoter 内 2973-2982 bp - 1019 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 8633747-8634559(-) SMil_00013472-RA_Salv MP00670 GGTGACGGAC
SmilChr02G002025 Chr02 NC_080388.1:36477449-36477458promoter 内 2949-2958 bp + 1043 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 36467687-36476406(-) SMil_00013472-RA_Salv MP00670 GTCCGTCACC
SmilChr06G000761 Chr06 NC_080392.1:7049694-7049703promoter 内 2905-2914 bp - 1087 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 7050790-7058454(+) SMil_00013472-RA_Salv MP00670 AACCGTCACT
SmilChr03G002271 Chr03 NC_080389.1:35859544-35859553promoter 内 2875-2884 bp - 1117 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 35853702-35858427(-) SMil_00013472-RA_Salv MP00670 GGTGACGGAC
SmilChr06G001852 Chr06 NC_080392.1:21904672-21904681promoter 内 2858-2867 bp - 1134 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 21905815-21911713(+) SMil_00013472-RA_Salv MP00670 GTCCGTCACC
SmilChr05G003368 Chr05 NC_080391.1:44511423-44511432promoter 内 2857-2866 bp + 1135 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 44506103-44510288(-) SMil_00013472-RA_Salv MP00670 CTCCGTCACC
SmilChr01G005171 Chr01 NC_080387.1:69475406-69475415promoter 内 2830-2839 bp + 1162 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 69473519-69474244(-) SMil_00013472-RA_Salv MP00670 CTCCGTCACC
SmilChr05G002635 Chr05 NC_080391.1:29731160-29731169promoter 内 2822-2831 bp - 1170 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 29732339-29734243(+) SMil_00013472-RA_Salv MP00670 CTCCGTCACC
SmilChr02G005579 Chr02 NC_080388.1:75633012-75633021promoter 内 2812-2821 bp + 1180 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 75628944-75631832(-) SMil_00013472-RA_Salv MP00670 CTCCGTCACC
SmilChr05G000820 Chr05 NC_080391.1:6442367-6442376promoter 内 2810-2819 bp + 1182 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 6443558-6444805(+) SMil_00013472-RA_Salv MP00670 AGTGACGGAT
SmilChr01G005972 Chr01 NC_080387.1:75400003-75400012promoter 内 2805-2814 bp + 1187 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 75397096-75398816(-) SMil_00013472-RA_Salv MP00670 AACCGTCACT
SmilChr04G002833 Chr04 NC_080390.1:44440179-44440188promoter 内 2787-2796 bp + 1205 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 44441393-44446798(+) SMil_00013472-RA_Salv MP00670 GGTGACGGTG
SmilChr04G001595 Chr04 NC_080390.1:26577536-26577545promoter 内 2785-2794 bp + 1207 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 26578752-26579789(+) SMil_00013472-RA_Salv MP00670 AGTGACGGAT
SmilChr04G002730 Chr04 NC_080390.1:42927873-42927882promoter 内 2731-2740 bp + 1261 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 42929143-42938404(+) SMil_00013472-RA_Salv MP00670 GGTGACGGAG
SmilChr05G001844 Chr05 NC_080391.1:18483734-18483743promoter 内 2729-2738 bp - 1263 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 18480474-18482471(-) SMil_00013472-RA_Salv MP00670 AGTGACGGAT
SmilChr02G000664 Chr02 NC_080388.1:10208725-10208734promoter 内 2725-2734 bp - 1267 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 10205962-10207458(-) SMil_00013472-RA_Salv MP00670 AGTGACGGAT
SmilChr01G003050 Chr01 NC_080387.1:49466811-49466820promoter 内 2717-2726 bp + 1275 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 49460707-49465536(-) SMil_00013472-RA_Salv MP00670 GTCCGTCACC
SmilChr01G003421 Chr01 NC_080387.1:52846836-52846845promoter 内 2713-2722 bp - 1279 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 52848124-52849820(+) SMil_00013472-RA_Salv MP00670 CACCGTCACC
SmilChr02G004474 Chr02 NC_080388.1:67134615-67134624promoter 内 2706-2715 bp + 1286 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 67135910-67138804(+) SMil_00013472-RA_Salv MP00670 GGTGACGGAG
SmilChr05G002864 Chr05 NC_080391.1:34217298-34217307promoter 内 2702-2711 bp + 1290 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 34212102-34216008(-) SMil_00013472-RA_Salv MP00670 CACCGTCACC
SmilChr06G002407 Chr06 NC_080392.1:34824712-34824721promoter 内 2694-2703 bp + 1298 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 34822848-34823414(-) SMil_00013472-RA_Salv MP00670 ATCCGTCACT
SmilChr02G000254 Chr02 NC_080388.1:3271138-3271147promoter 内 2690-2699 bp - 1302 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 3267611-3269836(-) SMil_00013472-RA_Salv MP00670 AGTGACGGAT
SmilChr02G001148 Chr02 NC_080388.1:20882463-20882472promoter 内 2688-2697 bp + 1304 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 20878858-20881159(-) SMil_00013472-RA_Salv MP00670 CACCGTCACC
SmilChr03G001308 Chr03 NC_080389.1:15368057-15368066promoter 内 2665-2674 bp - 1327 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 15369393-15370731(+) SMil_00013472-RA_Salv MP00670 CTCCGTCACC
SmilChr05G000254 Chr05 NC_080391.1:1941670-1941679promoter 内 2655-2664 bp + 1337 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 1943016-1945589(+) SMil_00013472-RA_Salv MP00670 GGTGACGGTG
SmilChr05G001299 Chr05 NC_080391.1:11211818-11211827promoter 内 2648-2657 bp - 1344 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 11213171-11220589(+) SMil_00013472-RA_Salv MP00670 CACCGTCACC
SmilChr01G005489 Chr01 NC_080387.1:71831283-71831292promoter 内 2620-2629 bp - 1372 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 71825897-71829911(-) SMil_00013472-RA_Salv MP00670 GGTGACGGTG
SmilChr03G000618 Chr03 NC_080389.1:6817953-6817962promoter 内 2616-2625 bp - 1376 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 6814662-6816577(-) SMil_00013472-RA_Salv MP00670 AGTGACGGAT
SmilChr04G004050 Chr04 NC_080390.1:55688578-55688587promoter 内 2595-2604 bp + 1397 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 55687120-55687181(-) SMil_00013472-RA_Salv MP00670 CACCGTCACC
SmilChr03G001278 Chr03 NC_080389.1:14968242-14968251promoter 内 2584-2593 bp + 1408 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 14969659-14969730(+) SMil_00013472-RA_Salv MP00670 AGTGACGGAT
SmilChr06G001338 Chr06 NC_080392.1:13920393-13920402promoter 内 2575-2584 bp + 1417 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 13921819-13923194(+) SMil_00013472-RA_Salv MP00670 GGTGACGGAG
SmilChr03G004160 Chr03 NC_080389.1:60383803-60383812promoter 内 2574-2583 bp + 1418 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 60385230-60388493(+) SMil_00013472-RA_Salv MP00670 AGTGACGGAT
SmilChr04G004119 Chr04 NC_080390.1:56066767-56066776promoter 内 2559-2568 bp - 1433 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 56068209-56070531(+) SMil_00013472-RA_Salv MP00670 CTCCGTCACC