转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 123 / 143 下载 TSV

上一页 123 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G001540 Chr03 NC_080389.1:19310692-19310703promoter 内 1549-1560 bp + 2441 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 19307128-19308251(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTTGC
SmilChr06G000433 Chr06 NC_080392.1:3553491-3553502promoter 内 1433-1444 bp - 2557 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 3556059-3560733(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTACA
SmilChr02G003031 Chr02 NC_080388.1:51017775-51017786promoter 内 1366-1377 bp + 2624 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 51009806-51015151(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTAGCTGTCTT
SmilChr06G000431 Chr06 NC_080392.1:3553491-3553502promoter 内 1315-1326 bp - 2675 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 3548153-3550816(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGTACAGCTGAT
SmilChr05G002427 Chr05 NC_080391.1:26747335-26747346promoter 内 1246-1257 bp - 2744 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 26741180-26744591(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGAAAGCTGTA
SmilChr01G003199 Chr01 NC_080387.1:50756159-50756170promoter 内 1230-1241 bp - 2760 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 50758930-50765314(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTTGC
SmilChr01G003846 Chr01 NC_080387.1:56779668-56779679promoter 内 1174-1185 bp - 2816 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 56773403-56776852(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTCAT
SmilChr02G001208 Chr02 NC_080388.1:22252154-22252165promoter 内 1172-1183 bp + 2818 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 22245375-22249336(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTAGCTGTCTT
SmilChr08G001432 Chr08 NC_080394.1:11468300-11468311promoter 内 1064-1075 bp - 2926 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 11463012-11465374(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGAAAGCTGTA
SmilChr05G000002 Chr05 NC_080391.1:6306-6317promoter 内 989-1000 bp + 3001 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 3232-3305(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTATT
SmilChr06G002073 Chr06 NC_080392.1:27333843-27333854promoter 内 888-899 bp - 3102 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 27336956-27339774(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGCAGCTGTCGC
SmilChr05G004081 Chr05 NC_080391.1:54673581-54673592promoter 内 872-883 bp - 3118 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 54676710-54676781(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTAGCTGTCTT
SmilChr05G000001 Chr05 NC_080391.1:6306-6317promoter 内 795-806 bp + 3195 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 80-3111(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTATT
SmilChr01G001347 Chr01 NC_080387.1:26740181-26740192promoter 内 792-803 bp - 3198 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 26733442-26736983(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGTACAGCTGAT
SmilChr06G000441 Chr06 NC_080392.1:3603845-3603856promoter 内 784-795 bp - 3206 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 3607062-3609429(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTTGC
SmilChr01G003820 Chr01 NC_080387.1:56543362-56543373promoter 内 743-754 bp + 3247 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 56546620-56550205(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTCAT
SmilChr01G004936 Chr01 NC_080387.1:67464167-67464178promoter 内 693-704 bp + 3297 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 67459992-67460870(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTTAG
SmilChr06G000585 Chr06 NC_080392.1:5031819-5031830promoter 内 613-624 bp - 3377 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 5026361-5028442(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGTACAGCTGAT
SmilChr03G003295 Chr03 NC_080389.1:51074064-51074075promoter 内 594-605 bp - 3396 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 51077471-51078844(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTAGCTGTCTT
SmilChr08G003188 Chr08 NC_080394.1:32635343-32635354promoter 内 528-539 bp + 3462 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 32625505-32631881(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTTGC
SmilChr07G000077 Chr07 NC_080393.1:358052-358063promoter 内 520-531 bp + 3470 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 361533-362094(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTCAT
SmilChr06G000774 Chr06 NC_080392.1:7259713-7259724promoter 内 491-502 bp - 3499 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 7263223-7265863(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTTGC
SmilChr06G000773 Chr06 NC_080392.1:7259713-7259724promoter 内 423-434 bp - 3567 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 7251665-7256146(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCAACAGCTGTG
SmilChr07G000075 Chr07 NC_080393.1:358052-358063promoter 内 271-282 bp + 3719 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 352871-354333(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAGCTGTCTG
SmilChr01G000920 Chr01 NC_080387.1:19436057-19436068promoter 内 211-222 bp - 3779 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 19430555-19432278(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTAAT
SmilChr01G003880 Chr01 NC_080387.1:57136399-57136410promoter 内 172-183 bp + 3818 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 57127031-57132581(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTAGCTGTCTT
SmilChr04G001595 Chr04 NC_080390.1:26574865-26574876promoter 内 114-125 bp - 3876 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 26578752-26579789(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTTGC
SmilChr02G003032 Chr02 NC_080388.1:51017775-51017786promoter 内 92-103 bp + 3898 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 51021684-51024146(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTAAT
SmilChr08G000340 Chr08 NC_080394.1:2363116-2363127promoter 内 39-50 bp + 3951 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 2367078-2370386(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTAAT
SmilChr01G004866 Chr01 NC_080387.1:66782603-66782614promoter 内 5-16 bp - 3985 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 66786599-66790422(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTACT
SmilChr05G002730 Chr05 NC_080391.1:31448069-31448080promoter 内 2989-3000 bp - 1001 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 4 31449081-31453089(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTTAG
SmilChr02G001387 Chr02 NC_080388.1:26364647-26364658promoter 内 3861-3872 bp + 129 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 26364027-26364518(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTAGCTGTCCT
SmilChr01G002107 Chr01 NC_080387.1:37098821-37098832promoter 内 3577-3588 bp - 413 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 37089875-37098408(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTCGA
SmilChr07G004010 Chr07 NC_080393.1:51146708-51146719promoter 内 3445-3456 bp - 545 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 51131513-51146163(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCAACAGCTGTT
SmilChr01G004652 Chr01 NC_080387.1:64636971-64636982promoter 内 3430-3441 bp - 560 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 64637542-64637843(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTTAG
SmilChr02G001223 Chr02 NC_080388.1:22490502-22490513promoter 内 3260-3271 bp - 730 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 22480981-22489772(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCAACAGCTGTT
SmilChr02G001386 Chr02 NC_080388.1:26364647-26364658promoter 内 3160-3171 bp + 830 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 26358554-26363817(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTAGCTGTCCT
SmilChr05G000282 Chr05 NC_080391.1:2185887-2185898promoter 内 2947-2958 bp + 1043 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 2182256-2184844(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTTGC
SmilChr02G001388 Chr02 NC_080388.1:26364647-26364658promoter 内 2937-2948 bp + 1053 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 26365711-26367457(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGGACAGCTAAT
SmilChr03G000585 Chr03 NC_080389.1:6504456-6504467promoter 内 2094-2105 bp - 1896 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 6506363-6510208(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTTGC
SmilChr02G001005 Chr02 NC_080388.1:17738174-17738185promoter 内 1815-1826 bp - 2175 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 17735893-17735999(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCAACAGCTGTT
SmilChr05G003204 Chr05 NC_080391.1:41013330-41013341promoter 内 1791-1802 bp - 2199 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 41015540-41020617(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTTGC
SmilChr01G000759 Chr01 NC_080387.1:16681949-16681960promoter 内 1018-1029 bp + 2972 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 16660712-16678977(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTTGC
SmilChr07G001769 Chr07 NC_080393.1:14984981-14984992promoter 内 973-984 bp - 3017 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 14988009-14988350(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTTGC
SmilChr02G005068 Chr02 NC_080388.1:72348170-72348181promoter 内 817-828 bp - 3173 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 72342434-72344997(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTAACAGCTGTT
SmilChr04G000064 Chr04 NC_080390.1:573170-573181promoter 内 700-711 bp + 3290 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 576471-586022(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTAACAGCTGTT
SmilChr01G004082 Chr01 NC_080387.1:59231561-59231572promoter 内 685-696 bp - 3305 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 59227164-59228256(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTAACAGCTGTT
SmilChr03G000583 Chr03 NC_080389.1:6504456-6504467promoter 内 450-461 bp - 3540 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 6500139-6500916(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCAACAGCTGGT
SmilChr03G003512 Chr03 NC_080389.1:53727571-53727582promoter 内 3938-3949 bp - 52 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 53721573-53727519(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTAACAGCTGAG
SmilChr07G002250 Chr07 NC_080393.1:20668684-20668695promoter 内 3925-3936 bp - 65 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 20668760-20672236(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTTAA