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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。

预计算阈值必须与当前索引一致。非法、未支持或需四舍五入的输入会报错；页面与下载均不会自动切换阈值。

257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因，每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr03G003685; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00013928-RA_Salv SmilChr03G003685 ERF XP_057798538.1 MP00558 TTTTGTCGGCAAAGG

可能结合的靶基因

9762 个结合位点 8044 个候选靶基因 第 125 / 161 下载 TSV

上一页 125 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G000590 Chr04 NC_080390.1:6587667-6587681promoter 内 1361-1375 bp + 2626 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 6590307-6591658(+) SMil_00013928-RA_Salv MP00558 AGTGGTCGGCAGCGG
SmilChr05G000852 Chr05 NC_080391.1:6718951-6718965promoter 内 1357-1371 bp + 2630 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 6721595-6724390(+) SMil_00013928-RA_Salv MP00558 GTTTGTCGGTGATCC
SmilChr06G002065 Chr06 NC_080392.1:27185264-27185278promoter 内 1356-1370 bp + 2631 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 27178638-27182633(-) SMil_00013928-RA_Salv MP00558 AGATGGCCGACAGCT
SmilChr01G003608 Chr01 NC_080387.1:54640012-54640026promoter 内 1333-1347 bp + 2654 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 54633004-54637358(-) SMil_00013928-RA_Salv MP00558 ATTTTGCCGTCACCG
SmilChr01G001670 Chr01 NC_080387.1:30805852-30805866promoter 内 1315-1329 bp - 2672 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 30808538-30812016(+) SMil_00013928-RA_Salv MP00558 TGGGGGCCGACAAAT
SmilChr04G001540 Chr04 NC_080390.1:25372256-25372270promoter 内 1299-1313 bp + 2688 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 25364426-25369568(-) SMil_00013928-RA_Salv MP00558 AGATGGCCGACAGCT
SmilChr01G003419 Chr01 NC_080387.1:52828445-52828459promoter 内 1158-1172 bp + 2829 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 52831288-52834224(+) SMil_00013928-RA_Salv MP00558 TTTCGTCGGCATACT
SmilChr05G001671 Chr05 NC_080391.1:15843372-15843386promoter 内 1155-1169 bp + 2832 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 15846218-15848877(+) SMil_00013928-RA_Salv MP00558 TATTGTCGGCTCCCC
SmilChr08G002746 Chr08 NC_080394.1:27074197-27074211promoter 内 1146-1160 bp - 2841 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 27077052-27078122(+) SMil_00013928-RA_Salv MP00558 AGATGGCCGACAGCT
SmilChr03G000855 Chr03 NC_080389.1:9774041-9774055promoter 内 1036-1050 bp + 2951 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 9768373-9771090(-) SMil_00013928-RA_Salv MP00558 GTCCAGCCGACATGC
SmilChr01G003612 Chr01 NC_080387.1:54667667-54667681promoter 内 1030-1044 bp - 2957 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 54663828-54664710(-) SMil_00013928-RA_Salv MP00558 AATTGACGGCAAAAG
SmilChr05G001335 Chr05 NC_080391.1:11737593-11737607promoter 内 967-981 bp - 3020 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 11740627-11743929(+) SMil_00013928-RA_Salv MP00558 AGATGGCCGACAGCT
SmilChr07G003289 Chr07 NC_080393.1:34651524-34651538promoter 内 961-975 bp - 3026 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 34654564-34655346(+) SMil_00013928-RA_Salv MP00558 GTCGAGCCGACACAC
SmilChr05G002861 Chr05 NC_080391.1:34102684-34102698promoter 内 845-859 bp + 3142 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 34097042-34099542(-) SMil_00013928-RA_Salv MP00558 GCGCTGCCGACTGCT
SmilChr04G001146 Chr04 NC_080390.1:16884173-16884187promoter 内 824-838 bp - 3163 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 16887350-16894075(+) SMil_00013928-RA_Salv MP00558 GTCGAGCCGACACAC
SmilChr02G005289 Chr02 NC_080388.1:73900657-73900671promoter 内 818-832 bp + 3169 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 73895707-73897488(-) SMil_00013928-RA_Salv MP00558 TGGGCACCGACAATT
SmilChr03G004360 Chr03 NC_080389.1:61837799-61837813promoter 内 785-799 bp - 3202 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 61841015-61841767(+) SMil_00013928-RA_Salv MP00558 GCTCTGCCGACTCTC
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SmilChr02G001988 Chr02 NC_080388.1:35899039-35899053promoter 内 567-581 bp + 3420 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 35892180-35895619(-) SMil_00013928-RA_Salv MP00558 TGGGGGCCGACAAAT
SmilChr01G004514 Chr01 NC_080387.1:63267681-63267695promoter 内 566-580 bp + 3421 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 63262823-63264260(-) SMil_00013928-RA_Salv MP00558 ATTTTGCCGTCACCG
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SmilChr08G001578 Chr08 NC_080394.1:13005214-13005228promoter 内 448-462 bp + 3539 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 12999381-13001675(-) SMil_00013928-RA_Salv MP00558 GGCTAGCCGACATTA
SmilChr08G003015 Chr08 NC_080394.1:30273332-30273346promoter 内 444-458 bp - 3543 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 30276889-30277928(+) SMil_00013928-RA_Salv MP00558 AGATGGCCGACAGCT
SmilChr03G004092 Chr03 NC_080389.1:59810019-59810033promoter 内 426-440 bp - 3561 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 59803780-59806458(-) SMil_00013928-RA_Salv MP00558 TGTTGTCGGTGTCAT
SmilChr01G001961 Chr01 NC_080387.1:34880947-34880961promoter 内 341-355 bp - 3646 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 34884607-34891469(+) SMil_00013928-RA_Salv MP00558 TTGACACCGACAAGG
SmilChr01G002080 Chr01 NC_080387.1:36749910-36749924promoter 内 338-352 bp + 3649 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 36743335-36746261(-) SMil_00013928-RA_Salv MP00558 GGGGTGCCGACGGGC
SmilChr03G004368 Chr03 NC_080389.1:61889151-61889165promoter 内 312-326 bp - 3675 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 61892840-61893772(+) SMil_00013928-RA_Salv MP00558 GCTCTGCCGACTCTC
SmilChr03G004401 Chr03 NC_080389.1:62197396-62197410promoter 内 305-319 bp - 3682 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 62201092-62202024(+) SMil_00013928-RA_Salv MP00558 GCTCTGCCGACTCTC
SmilChr01G003080 Chr01 NC_080387.1:49640531-49640545promoter 内 296-310 bp + 3691 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 49644236-49647282(+) SMil_00013928-RA_Salv MP00558 CCTTGTCGGCTTCAA
SmilChr07G001262 Chr07 NC_080393.1:9713059-9713073promoter 内 278-292 bp + 3709 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 9707670-9709350(-) SMil_00013928-RA_Salv MP00558 GATATGCCGACAGGT
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SmilChr08G002560 Chr08 NC_080394.1:24903363-24903377promoter 内 180-194 bp + 3807 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 24907184-24911211(+) SMil_00013928-RA_Salv MP00558 TCTCGTCGGCACTGT
SmilChr05G000478 Chr05 NC_080391.1:3707874-3707888promoter 内 124-138 bp + 3863 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 3698093-3704011(-) SMil_00013928-RA_Salv MP00558 CAAATGCCGACGGAA
SmilChr04G003294 Chr04 NC_080390.1:49655857-49655871promoter 内 32-46 bp - 3955 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 49659826-49661796(+) SMil_00013928-RA_Salv MP00558 CCACTGCCGACTATA
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SmilChr02G002146 Chr02 NC_080388.1:38606606-38606620promoter 内 2622-2636 bp - 1365 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 38595015-38605241(-) SMil_00013928-RA_Salv MP00558 AGTTGTCGGTTAAAG
SmilChr08G003398 Chr08 NC_080394.1:35833032-35833046promoter 内 2556-2570 bp - 1431 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 35830252-35831601(-) SMil_00013928-RA_Salv MP00558 TATTGTCGGTGTCCA
SmilChr03G001481 Chr03 NC_080389.1:17865586-17865600promoter 内 1122-1136 bp + 2865 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 17859817-17862721(-) SMil_00013928-RA_Salv MP00558 CTGCTGCCGACTGTT
SmilChr08G001744 Chr08 NC_080394.1:14667290-14667304promoter 内 1045-1059 bp - 2942 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 14670246-14678571(+) SMil_00013928-RA_Salv MP00558 AGTTTGCCGTCACCG
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SmilChr07G001139 Chr07 NC_080393.1:8550461-8550475promoter 内 3855-3869 bp - 132 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 8550607-8552180(+) SMil_00013928-RA_Salv MP00558 CACAGGCCGACAAAT
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SmilChr03G002609 Chr03 NC_080389.1:41500448-41500462promoter 内 3733-3747 bp - 254 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 41500089-41500194(-) SMil_00013928-RA_Salv MP00558 TTTTGTCGGCCTCAT
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SmilChr05G000432 Chr05 NC_080391.1:3254136-3254150promoter 内 3564-3578 bp + 423 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 3252292-3253713(-) SMil_00013928-RA_Salv MP00558 TTGCTGTCGACAAAG
SmilChr08G000621 Chr08 NC_080394.1:4649081-4649095promoter 内 3542-3556 bp - 445 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 4647802-4648636(-) SMil_00013928-RA_Salv MP00558 CGACGTCGGCATAAT
SmilChr05G003405 Chr05 NC_080391.1:45143715-45143729promoter 内 3530-3544 bp + 457 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 45141729-45143258(-) SMil_00013928-RA_Salv MP00558 ATAATGCCGACGCCA
SmilChr02G004384 Chr02 NC_080388.1:66184831-66184845promoter 内 3509-3523 bp - 478 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 66185323-66190015(+) SMil_00013928-RA_Salv MP00558 CACTCGTCGACAAAG