转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 129 / 143 下载 TSV

上一页 129 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G002859 Chr02 NC_080388.1:48780670-48780681promoter 内 510-521 bp - 3480 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 48772585-48777190(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTCTT
SmilChr03G001961 Chr03 NC_080389.1:28106148-28106159promoter 内 450-461 bp + 3540 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 28109699-28110847(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTCTT
SmilChr01G003039 Chr01 NC_080387.1:49386649-49386660promoter 内 364-375 bp - 3626 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 49382181-49383023(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTATC
SmilChr03G003523 Chr03 NC_080389.1:53847453-53847464promoter 内 360-371 bp - 3630 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 53840875-53843823(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CATACAGCTGAA
SmilChr02G002709 Chr02 NC_080388.1:46960954-46960965promoter 内 357-368 bp + 3633 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 46957238-46957321(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAACTGTCAA
SmilChr06G001163 Chr06 NC_080392.1:11810521-11810532promoter 内 335-346 bp - 3655 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 11814187-11815193(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGAGCTGTCAA
SmilChr04G003441 Chr04 NC_080390.1:50942107-50942118promoter 内 295-306 bp - 3695 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 50935472-50938412(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTATC
SmilChr05G000037 Chr05 NC_080391.1:162748-162759promoter 内 267-278 bp + 3723 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 166482-170355(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATAACAGCTGAT
SmilChr07G002872 Chr07 NC_080393.1:28934833-28934844promoter 内 211-222 bp + 3779 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 28938623-28939120(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATAACAGCTGAT
SmilChr05G000033 Chr05 NC_080391.1:162748-162759promoter 内 208-219 bp + 3782 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 156197-158966(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTTAT
SmilChr01G000951 Chr01 NC_080387.1:20147439-20147450promoter 内 152-163 bp - 3838 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 20141339-20143601(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTCTT
SmilChr02G000577 Chr02 NC_080388.1:8291701-8291712promoter 内 15-26 bp + 3975 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 8284708-8287726(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGAGCTGTCAA
SmilChr05G003707 Chr05 NC_080391.1:50151720-50151731promoter 内 1968-1979 bp - 2022 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 3 50141306-50149698(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCACCAGCTGTT
SmilChr07G001737 Chr07 NC_080393.1:14757623-14757634promoter 内 2424-2435 bp - 1566 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 2 14752717-14756057(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCACCAGCTGTT
SmilChr02G004604 Chr02 NC_080388.1:68554482-68554493promoter 内 805-816 bp - 3185 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 2 68546587-68551297(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCACCAGCTGTT
SmilChr03G002654 Chr03 NC_080389.1:42201996-42202007promoter 内 3931-3942 bp - 59 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 42190409-42201937(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTGCC
SmilChr05G002784 Chr05 NC_080391.1:32546594-32546605promoter 内 3895-3906 bp - 95 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 32546700-32546806(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGCAGCTGTCTT
SmilChr03G001532 Chr03 NC_080389.1:19125559-19125570promoter 内 3668-3679 bp - 322 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 19123567-19125237(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGGTCTA
SmilChr07G001081 Chr07 NC_080393.1:7929173-7929184promoter 内 3427-3438 bp + 563 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 7927123-7928610(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTTGC
SmilChr01G001086 Chr01 NC_080387.1:22305115-22305126promoter 内 3356-3367 bp - 634 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 22305760-22308579(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTACG
SmilChr01G001424 Chr01 NC_080387.1:27873052-27873063promoter 内 2793-2804 bp - 1197 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 27874260-27874855(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGTGG
SmilChr06G002857 Chr06 NC_080392.1:41353308-41353319promoter 内 2636-2647 bp - 1354 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 41354673-41359753(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTACG
SmilChr01G001653 Chr01 NC_080387.1:30585364-30585375promoter 内 1915-1926 bp + 2075 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 30587450-30600951(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTCCC
SmilChr02G001786 Chr02 NC_080388.1:32633804-32633815promoter 内 1897-1908 bp - 2093 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 32635908-32639947(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTACG
SmilChr01G004884 Chr01 NC_080387.1:66907730-66907741promoter 内 1895-1906 bp - 2095 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 66909836-66914661(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGCAGCTGTCCA
SmilChr03G002223 Chr03 NC_080389.1:35048447-35048458promoter 内 1891-1902 bp + 2099 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 35042421-35046348(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGAGCTGTCAT
SmilChr07G004526 Chr07 NC_080393.1:57907431-57907442promoter 内 1865-1876 bp + 2125 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 57909567-57910969(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTGCC
SmilChr07G004524 Chr07 NC_080393.1:57907431-57907442promoter 内 1829-1840 bp + 2161 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 57902188-57905270(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGCAGCTGTCTT
SmilChr01G003618 Chr01 NC_080387.1:54712487-54712498promoter 内 1740-1751 bp + 2250 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 54714748-54718095(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAACCAGCTGTG
SmilChr02G002988 Chr02 NC_080388.1:50549268-50549279promoter 内 1704-1715 bp - 2286 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 50544261-50546982(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAACCAGCTGTG
SmilChr04G002579 Chr04 NC_080390.1:41154961-41154972promoter 内 1517-1528 bp + 2473 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 41157445-41162504(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTGCC
SmilChr02G002421 Chr02 NC_080388.1:42180452-42180463promoter 内 1461-1472 bp - 2529 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 42182992-42187865(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGTGG
SmilChr05G002151 Chr05 NC_080391.1:22732065-22732076promoter 内 1448-1459 bp + 2542 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 22734618-22737271(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAACCAGCTGTG
SmilChr03G004385 Chr03 NC_080389.1:62058695-62058706promoter 内 1444-1455 bp - 2546 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 62061252-62064809(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGTGG
SmilChr06G000332 Chr06 NC_080392.1:2479396-2479407promoter 内 1366-1377 bp - 2624 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 2482031-2484034(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGCAGCTGTCCA
SmilChr05G002974 Chr05 NC_080391.1:36209225-36209236promoter 内 1348-1359 bp + 2642 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 36202948-36206583(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGTTC
SmilChr05G000152 Chr05 NC_080391.1:1232448-1232459promoter 内 1164-1175 bp + 2826 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 1228255-1229622(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGTTC
SmilChr03G004060 Chr03 NC_080389.1:59544761-59544772promoter 内 796-807 bp - 3194 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 59547966-59550566(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTTGC
SmilChr04G000680 Chr04 NC_080390.1:7844810-7844821promoter 内 753-764 bp - 3237 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 7848058-7850724(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGTTC
SmilChr06G000331 Chr06 NC_080392.1:2479396-2479407promoter 内 697-708 bp - 3293 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 2471310-2476103(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTGCC
SmilChr01G001559 Chr01 NC_080387.1:29619029-29619040promoter 内 523-534 bp - 3467 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 29622507-29624733(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGTTC
SmilChr05G002905 Chr05 NC_080391.1:34900006-34900017promoter 内 221-232 bp + 3769 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 34890879-34896237(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGTGG
SmilChr05G003507 Chr05 NC_080391.1:46829281-46829292promoter 内 60-71 bp + 3930 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 46833222-46833686(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAACCAGCTGTG
SmilChr05G003511 Chr05 NC_080391.1:46890827-46890838promoter 内 60-71 bp + 3930 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 46894768-46895232(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAACCAGCTGTG
SmilChr07G003507 Chr07 NC_080393.1:39955635-39955646promoter 内 30-41 bp - 3960 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 39951211-39951675(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAACCAGCTGTG
SmilChr08G002117 Chr08 NC_080394.1:19038440-19038451promoter 内 30-41 bp + 3960 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 19042411-19042875(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAACCAGCTGTG
SmilChr01G003595 Chr01 NC_080387.1:54513990-54514001promoter 内 15-26 bp + 3975 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 54509322-54510015(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGTTC
SmilChr01G003615 Chr01 NC_080387.1:54685115-54685126promoter 内 3951-3962 bp - 39 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 2 54682165-54685076(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAACCAGCTGTT
SmilChr03G002483 Chr03 NC_080389.1:39467572-39467583promoter 内 3841-3852 bp + 149 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 2 39466613-39467423(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGTTC
SmilChr08G000404 Chr08 NC_080394.1:2839058-2839069promoter 内 3019-3030 bp + 971 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 2 2835984-2838087(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGTTC