转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G001518; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00023584-RA_Salv SmilChr05G001518 WRKY XP_057765511.1 MP00455 AACGTTGACTATT

可能结合的靶基因

9792 个结合位点 6900 个候选靶基因 第 13 / 138 下载 TSV

上一页 13 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G001068 Chr02 NC_080388.1:18996902-18996914promoter 内 1407-1419 bp - 2582 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 3 18992446-18994320(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GTCGTTGACTTTA
SmilChr02G000779 Chr02 NC_080388.1:12768099-12768111promoter 内 1166-1178 bp - 2823 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 3 12764242-12765276(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GTCGTTGACTGAT
SmilChr01G000633 Chr01 NC_080387.1:14219945-14219957promoter 内 513-525 bp - 3476 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 3 14213891-14216469(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TACGTTGACTTTG
SmilChr03G001146 Chr03 NC_080389.1:13215259-13215271promoter 内 174-186 bp + 3815 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 3 13208625-13211444(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TCAAGTCAACGTT
SmilChr03G001667 Chr03 NC_080389.1:21679758-21679770promoter 内 3414-3426 bp - 575 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 21680345-21684580(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CTCAGTCAACGAC
SmilChr03G001145 Chr03 NC_080389.1:13202416-13202428promoter 内 2889-2901 bp + 1100 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 13203528-13208130(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AACGTTGACTTGA
SmilChr02G002038 Chr02 NC_080388.1:36683430-36683442promoter 内 2759-2771 bp - 1230 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 36679066-36682200(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AACGTTGACTTGA
SmilChr01G002867 Chr01 NC_080387.1:47281497-47281509promoter 内 2742-2754 bp - 1247 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 47278591-47280250(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AACGTTGACTTGA
SmilChr03G002609 Chr03 NC_080389.1:41502711-41502723promoter 内 1472-1484 bp + 2517 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 41500089-41500194(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CAAGGTCAACGAG
SmilChr01G002082 Chr01 NC_080387.1:36762613-36762625promoter 内 3631-3643 bp + 358 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 36761057-36762255(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GAAAGTCAACGGA
SmilChr01G005444 Chr01 NC_080387.1:71536892-71536904promoter 内 3449-3461 bp - 540 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 71530944-71536352(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GTCGTTGACCGAA
SmilChr02G000199 Chr02 NC_080388.1:2558362-2558374promoter 内 3212-3224 bp + 777 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 2553398-2557585(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACGGGTCAACGAC
SmilChr03G002962 Chr03 NC_080389.1:46387118-46387130promoter 内 2879-2891 bp + 1110 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 46385171-46386008(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CAGGGTCAACGAC
SmilChr01G002275 Chr01 NC_080387.1:39521000-39521012promoter 内 2660-2672 bp + 1329 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 39522341-39524619(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GTCGTTGACTAAT
SmilChr02G001103 Chr02 NC_080388.1:19847407-19847419promoter 内 2510-2522 bp + 1479 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 19848898-19852362(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACCGTTGACTCTG
SmilChr01G004949 Chr01 NC_080387.1:67576203-67576215promoter 内 2276-2288 bp - 1713 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 67577928-67581118(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATTAGTCAACGAC
SmilChr03G002821 Chr03 NC_080389.1:44705234-44705246promoter 内 2208-2220 bp + 1781 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 44707027-44709635(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TACGTTGACCTAT
SmilChr01G002743 Chr01 NC_080387.1:45730324-45730336promoter 内 1861-1873 bp - 2128 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 45732464-45733904(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTTGGTCAACGTT
SmilChr02G001445 Chr02 NC_080388.1:27128231-27128243promoter 内 1611-1623 bp + 2378 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 27124147-27125853(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CCAGGTCAACGAG
SmilChr02G001982 Chr02 NC_080388.1:35771612-35771624promoter 内 1507-1519 bp - 2482 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 35764995-35769130(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACCGTTGACTAAC
SmilChr02G000124 Chr02 NC_080388.1:1692418-1692430promoter 内 1081-1093 bp + 2908 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 1695338-1700632(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TGCGTTGACCACT
SmilChr03G002963 Chr03 NC_080389.1:46387118-46387130promoter 内 992-1004 bp + 2997 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 46390127-46392572(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GTCGTTGACCCTG
SmilChr02G000878 Chr02 NC_080388.1:15119662-15119674promoter 内 375-387 bp + 3614 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 15104295-15116048(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AAGAGTCAACGCT
SmilChr02G001761 Chr02 NC_080388.1:32368042-32368054promoter 内 262-274 bp - 3727 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 32363557-32364315(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TACGTTGACCAAT
SmilChr03G002439 Chr03 NC_080389.1:38736991-38737003promoter 内 1951-1963 bp + 2038 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 11 38739041-38739967(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AGCGTTGACTTCG
SmilChr03G002440 Chr03 NC_080389.1:38736991-38737003promoter 内 727-739 bp + 3262 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 10 38740265-38741618(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AGCGTTGACTTCG
SmilChr03G002323 Chr03 NC_080389.1:36577780-36577792promoter 内 2347-2359 bp - 1642 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 6 36579434-36582596(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CGAAGTCAACGCT
SmilChr02G001204 Chr02 NC_080388.1:22201393-22201405promoter 内 2209-2221 bp - 1780 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 4 22198792-22199613(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AGCGTTGACTTCG
SmilChr01G001561 Chr01 NC_080387.1:29625323-29625335promoter 内 2315-2327 bp + 1674 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 3 29627009-29628114(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TACGTTGACCATC
SmilChr02G001299 Chr02 NC_080388.1:24050785-24050797promoter 内 2687-2699 bp - 1302 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 24052099-24068327(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GAGGGTCAACGCT
SmilChr02G005043 Chr02 NC_080388.1:72151836-72151848promoter 内 2576-2588 bp - 1413 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 72146367-72150423(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CTCGTTGACCTTT
SmilChr01G000669 Chr01 NC_080387.1:14826890-14826902promoter 内 1520-1532 bp + 2469 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 14829371-14831561(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TCCGTTGACCTCT
SmilChr02G004127 Chr02 NC_080388.1:63523939-63523951promoter 内 1388-1400 bp + 2601 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 63520369-63521338(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AAAGGTCAACGAG
SmilChr01G000468 Chr01 NC_080387.1:9593673-9593685promoter 内 1203-1215 bp + 2786 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 9583561-9590887(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TGAGGTCAACGCT
SmilChr02G005090 Chr02 NC_080388.1:72490295-72490307promoter 内 888-900 bp - 3101 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 72493408-72500890(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCAAGTCAACGAC
SmilChr03G000425 Chr03 NC_080389.1:4626733-4626745promoter 内 717-729 bp + 3272 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 4630017-4632066(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AGCGTTGACTACT
SmilChr02G005044 Chr02 NC_080388.1:72151836-72151848promoter 内 3669-3681 bp - 320 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 72152168-72164421(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AAAGGTCAACGAG
SmilChr02G002212 Chr02 NC_080388.1:39369901-39369913promoter 内 3628-3640 bp + 361 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 39370274-39370975(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AGCGTTGACTGCG
SmilChr01G004427 Chr01 NC_080387.1:62377487-62377499promoter 内 3562-3574 bp - 427 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 62372553-62377060(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AACGTTGACTAAG
SmilChr01G004823 Chr01 NC_080387.1:66404938-66404950promoter 内 2889-2901 bp + 1100 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 66406050-66412791(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACCGTTGACCACA
SmilChr02G001646 Chr02 NC_080388.1:30542636-30542648promoter 内 2757-2769 bp + 1232 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 30531452-30541404(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AAAGGTCAACGAG
SmilChr02G001532 Chr02 NC_080388.1:28575138-28575150promoter 内 1997-2009 bp + 1992 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 28571974-28573146(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTTGGTCAACGCG
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SmilChr03G003257 Chr03 NC_080389.1:50463551-50463563promoter 内 1426-1438 bp - 2563 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 50466126-50470681(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TGTGGTCAACGGT
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SmilChr02G000421 Chr02 NC_080388.1:5402525-5402537promoter 内 1030-1042 bp - 2959 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 5395162-5399566(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GTCGTTGACTATC
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SmilChr02G001363 Chr02 NC_080388.1:25617204-25617216promoter 内 777-789 bp - 3212 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 25607442-25613992(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CTCGTTGACCTTT
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