转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001829; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004434-RA_Salv SmilChr06G001829 MYB XP_057766988.1 MP00510 TTTACCTACCTTT

可能结合的靶基因

9799 个结合位点 7526 个候选靶基因 第 13 / 151 下载 TSV

上一页 13 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G000343 Chr01 NC_080387.1:7001018-7001030promoter 内 275-287 bp - 3714 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 7004744-7008154(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTGGTAGGTGAA
SmilChr04G000545 Chr04 NC_080390.1:6056894-6056906promoter 内 270-282 bp + 3719 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 6060625-6065993(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTCACCTACCACA
SmilChr05G001451 Chr05 NC_080391.1:13261216-13261228promoter 内 260-272 bp + 3729 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 13252643-13257487(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGTGGTAGGTAAA
SmilChr03G000556 Chr03 NC_080389.1:6011233-6011245promoter 内 252-264 bp + 3737 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 6014982-6020144(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTCACCTACCACA
SmilChr05G001402 Chr05 NC_080391.1:12616229-12616241promoter 内 250-262 bp - 3739 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 12608100-12612490(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTCACCTACCACA
SmilChr01G006091 Chr01 NC_080387.1:76393369-76393381promoter 内 244-256 bp - 3745 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 76397126-76481394(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTGGTAGGTGAA
SmilChr01G005566 Chr01 NC_080387.1:72460938-72460950promoter 内 242-254 bp + 3747 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 72451656-72457191(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTGGTAGGTGAA
SmilChr01G002424 Chr01 NC_080387.1:41741772-41741784promoter 内 238-250 bp + 3751 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 41745535-41746849(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTCACCTACCACA
SmilChr04G002169 Chr04 NC_080390.1:35040683-35040695promoter 内 227-239 bp - 3762 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 35044457-35049301(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATGGTAGGTGAA
SmilChr02G005050 Chr02 NC_080388.1:72223756-72223768promoter 内 198-210 bp - 3791 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 72227559-72227661(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTGGTAGGTGAA
SmilChr01G004484 Chr01 NC_080387.1:62961721-62961733promoter 内 175-187 bp - 3814 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 62965547-62971988(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTGGTAGGTGAA
SmilChr05G001891 Chr05 NC_080391.1:19228140-19228152promoter 内 158-170 bp + 3831 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 19219687-19224309(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTGGTAGGTGAA
SmilChr03G003023 Chr03 NC_080389.1:47145511-47145523promoter 内 133-145 bp - 3856 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 47138749-47141655(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTCACCTACCACA
SmilChr05G000806 Chr05 NC_080391.1:6301651-6301663promoter 内 115-127 bp - 3874 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 6296794-6297777(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCCACCTACCTCA
SmilChr05G000383 Chr05 NC_080391.1:2894073-2894085promoter 内 104-116 bp + 3885 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 2886909-2890188(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTGGTAGGTGAA
SmilChr01G003986 Chr01 NC_080387.1:58303585-58303597promoter 内 88-100 bp + 3901 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 58299614-58299684(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTGGTAGGTGAA
SmilChr02G005051 Chr02 NC_080388.1:72223756-72223768promoter 内 56-68 bp - 3933 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 72227701-72227787(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTGGTAGGTGAA
SmilChr03G000336 Chr03 NC_080389.1:3811883-3811895promoter 内 45-57 bp + 3944 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 3815839-3818373(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTCACCTACCACA
SmilChr04G002688 Chr04 NC_080390.1:42302055-42302067promoter 内 45-57 bp - 3944 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 42306011-42310324(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTGGTAGGTGAA
SmilChr04G003130 Chr04 NC_080390.1:47906554-47906566promoter 内 11-23 bp - 3978 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 47902505-47902576(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTCACCTACCACA
SmilChr03G003460 Chr03 NC_080389.1:52978452-52978464promoter 内 3342-3354 bp - 647 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 6 52979111-52984837(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTGGGTAGGTGAA
SmilChr01G001754 Chr01 NC_080387.1:32265111-32265123promoter 内 3755-3767 bp - 234 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 4 32265357-32270789(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGAGGTAGGTGGC
SmilChr03G004318 Chr03 NC_080389.1:61543800-61543812promoter 内 1354-1366 bp - 2635 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 4 61531805-61541165(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTCACCTACCCAC
SmilChr01G000721 Chr01 NC_080387.1:16141766-16141778promoter 内 3793-3805 bp - 196 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 2 16135175-16141570(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTCACCTACCCAC
SmilChr03G004674 Chr03 NC_080389.1:64176481-64176493promoter 内 3588-3600 bp + 401 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 2 64176894-64183309(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCCACCTACCCAC
SmilChr01G001913 Chr01 NC_080387.1:34271796-34271808promoter 内 3013-3025 bp + 976 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 2 34267156-34270820(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTGGGTAGGTGAA
SmilChr02G000458 Chr02 NC_080388.1:6122257-6122269promoter 内 2993-3005 bp - 996 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 2 6118977-6121261(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCCACCTACCTCT
SmilChr01G001869 Chr01 NC_080387.1:33682845-33682857promoter 内 2635-2647 bp + 1354 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 2 33680262-33681491(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTGGGTAGGTGAA
SmilChr01G003381 Chr01 NC_080387.1:52509216-52509228promoter 内 1435-1447 bp - 2554 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 2 52505069-52506662(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCCACCTACCTCT
SmilChr03G002447 Chr03 NC_080389.1:38864524-38864536promoter 内 598-610 bp + 3391 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 2 38858640-38861133(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAGGTAGGTGGC
SmilChr03G002877 Chr03 NC_080389.1:45449462-45449474promoter 内 3875-3887 bp + 114 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 45449588-45451248(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCCACCTACCCAC
SmilChr02G001246 Chr02 NC_080388.1:22900688-22900700promoter 内 3710-3722 bp + 279 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 22897350-22900409(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTGGTAGGTAAG
SmilChr03G004673 Chr03 NC_080389.1:64176481-64176493promoter 内 3668-3680 bp + 321 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 64175484-64176160(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTGGGTAGGTGGA
SmilChr05G000094 Chr05 NC_080391.1:541843-541855promoter 内 3466-3478 bp - 523 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 542378-548997(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTGGTAGGTAAG
SmilChr04G002627 Chr04 NC_080390.1:41692663-41692675promoter 内 3170-3182 bp + 819 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 41689656-41691844(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAGGTAGGTGGC
SmilChr04G001576 Chr04 NC_080390.1:26184471-26184483promoter 内 2950-2962 bp - 1039 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 26181239-26183432(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCCACCTACCTCT
SmilChr04G002425 Chr04 NC_080390.1:38877816-38877828promoter 内 2702-2714 bp - 1287 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 38879115-38881302(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTGGGTAGGTGAA
SmilChr04G002671 Chr04 NC_080390.1:42121303-42121315promoter 内 2482-2494 bp + 1507 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 42117659-42119796(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAGGTAGGTGGC
SmilChr04G002423 Chr04 NC_080390.1:38870108-38870120promoter 内 2391-2403 bp + 1598 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 38871718-38873046(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTCACCTACCCAC
SmilChr02G002417 Chr02 NC_080388.1:42172400-42172412promoter 内 2284-2296 bp - 1705 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 42158821-42170695(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTCACCTACCCAC
SmilChr03G002814 Chr03 NC_080389.1:44603117-44603129promoter 内 1915-1927 bp + 2074 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 44605203-44609089(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCCACCTACCTCT
SmilChr01G003274 Chr01 NC_080387.1:51460843-51460855promoter 内 1772-1784 bp - 2217 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 51453792-51458626(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCCACCTACCTTT
SmilChr03G000659 Chr03 NC_080389.1:7359387-7359399promoter 内 1529-1541 bp + 2460 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 7354519-7356927(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGAGGTAGGTGGC
SmilChr02G004834 Chr02 NC_080388.1:70456807-70456819promoter 内 1382-1394 bp - 2607 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 70459426-70471260(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAGGTAGGTGAC
SmilChr04G000561 Chr04 NC_080390.1:6269475-6269487promoter 内 1137-1149 bp + 2852 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 6264319-6266623(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAGGTAGGTGAC
SmilChr01G003382 Chr01 NC_080387.1:52509216-52509228promoter 内 976-988 bp - 3013 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 52512241-52516320(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGAGGTAGGTGGC
SmilChr02G001091 Chr02 NC_080388.1:19669630-19669642promoter 内 809-821 bp + 3180 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 19672822-19676555(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTCACCTACCCTC
SmilChr03G004323 Chr03 NC_080389.1:61595943-61595955promoter 内 749-761 bp - 3240 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 61599195-61606312(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTGGGTAGGTGGA
SmilChr03G004571 Chr03 NC_080389.1:63615133-63615145promoter 内 699-711 bp + 3290 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 63618435-63621305(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACCACA
SmilChr05G000461 Chr05 NC_080391.1:3494044-3494056promoter 内 316-328 bp - 3673 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 3486025-3490371(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACCTCA