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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。

预计算阈值必须与当前索引一致。非法、未支持或需四舍五入的输入会报错；页面与下载均不会自动切换阈值。

257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID 家族 基序 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因，每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G004408; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族蛋白基序共识序列
SMil_00011278-RA_Salv SmilChr08G004408 MYB XP_057780613.1 MP00114 AAGTTGGTAGGTGAG

可能结合的靶基因

9897 个结合位点 8151 个候选靶基因 第 130 / 164 下载 TSV

上一页 130 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF 基序 匹配序列
SmilChr04G002451 Chr04 NC_080390.1:39226744-39226758promoter 内 122-136 bp + 3865 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 39230623-39236288(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TGATGAGTAGGTGAC
SmilChr04G003323 Chr04 NC_080390.1:49967923-49967937promoter 内 108-122 bp - 3879 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 49971816-49973336(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GGCACCTACTCCCTC
SmilChr04G003094 Chr04 NC_080390.1:47563784-47563798promoter 内 96-110 bp + 3891 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 47567689-47567760(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AATTGGGTAGGTAAT
SmilChr07G002769 Chr07 NC_080393.1:27553753-27553767promoter 内 91-105 bp + 3896 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 27557663-27560015(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GCTTTGGTAGGTATC
SmilChr03G003543 Chr03 NC_080389.1:54076526-54076540promoter 内 58-72 bp + 3929 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 54071383-54072597(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GTCACCTACTAGACT
SmilChr02G005043 Chr02 NC_080388.1:72154384-72154398promoter 内 26-40 bp - 3961 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 72146367-72150423(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TAGTAGGTAGGTCAA
SmilChr05G002212 Chr05 NC_080391.1:23577200-23577214promoter 内 9-23 bp - 3978 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 23581192-23589440(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTTAACTACCAAATT
SmilChr04G002437 Chr04 NC_080390.1:39041904-39041918promoter 内 2231-2245 bp + 1756 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 3 39035854-39040148(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ACAACCTACCAAGCA
SmilChr05G001049 Chr05 NC_080391.1:8692905-8692919promoter 内 3966-3980 bp + 21 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 2 8691529-8692884(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GCAACCTACCCCTGC
SmilChr05G000979 Chr05 NC_080391.1:7902032-7902046promoter 内 3232-3246 bp + 755 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 2 7902801-7905770(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GGTTGGGTAGGTTTA
SmilChr05G000914 Chr05 NC_080391.1:7248279-7248293promoter 内 3136-3150 bp + 851 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 2 7249144-7252026(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GGTTGGGTAGGTTTA
SmilChr07G000044 Chr07 NC_080393.1:184479-184493promoter 内 2925-2939 bp + 1062 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 2 185555-190296(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCAGTGGTAGGTGTT
SmilChr01G000271 Chr01 NC_080387.1:5365355-5365369promoter 内 2763-2777 bp + 1224 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 2 5363352-5364131(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ACCACCTACTAATTG
SmilChr07G004446 Chr07 NC_080393.1:57086923-57086937promoter 内 2076-2090 bp - 1911 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 2 57088848-57089396(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTTAACTACCAAAAT
SmilChr04G000484 Chr04 NC_080390.1:5226172-5226186promoter 内 1134-1148 bp - 2853 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 2 5229039-5240075(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GGTACCTACCATACA
SmilChr05G000978 Chr05 NC_080391.1:7902032-7902046promoter 内 766-780 bp + 3221 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 2 7898252-7898811(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TAAACCTACCCAACC
SmilChr02G005534 Chr02 NC_080388.1:75397933-75397947promoter 内 520-534 bp - 3467 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 2 75392178-75394466(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GGGTTGGTAGTTAGT
SmilChr05G004254 Chr05 NC_080391.1:56324656-56324670promoter 内 470-484 bp + 3517 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 2 56328187-56331674(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TGGAAATTAGGTGAG
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SmilChr01G002623 Chr01 NC_080387.1:44500388-44500402promoter 内 156-170 bp - 3831 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 2 44504233-44507820(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTAACCTACCCTTTA
SmilChr07G001901 Chr07 NC_080393.1:16425470-16425484promoter 内 3970-3984 bp + 17 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 16425501-16427477(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATATTAGTAGGTGAT
SmilChr02G000936 Chr02 NC_080388.1:16340304-16340318promoter 内 3966-3980 bp + 21 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 16337052-16340283(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATCACCTAACACATC
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SmilChr01G000532 Chr01 NC_080387.1:10848406-10848420promoter 内 3954-3968 bp + 33 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 10845553-10848373(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TACACCTACTCCTAC
SmilChr03G000815 Chr03 NC_080389.1:9324249-9324263promoter 内 3944-3958 bp + 43 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 9321230-9324206(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TACACCTACTCCTAC
SmilChr03G000816 Chr03 NC_080389.1:9331788-9331802promoter 内 3944-3958 bp + 43 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 9328780-9331745(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TACACCTACTCCTAC
SmilChr03G000817 Chr03 NC_080389.1:9339327-9339341promoter 内 3944-3958 bp + 43 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 9336319-9339284(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TACACCTACTCCTAC
SmilChr08G002605 Chr08 NC_080394.1:25422054-25422068promoter 内 3944-3958 bp - 43 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 25422111-25425051(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TACACCTACTCCTAC
SmilChr05G001366 Chr05 NC_080391.1:12137005-12137019promoter 内 3885-3899 bp + 102 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 12137121-12139180(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CATTTGGTAGGTTAC
SmilChr03G001281 Chr03 NC_080389.1:14989414-14989428promoter 内 3714-3728 bp - 273 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 14986288-14989141(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTTTTGGTAGGTTGT
SmilChr01G000580 Chr01 NC_080387.1:12149953-12149967promoter 内 3654-3668 bp + 333 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 12150300-12153417(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GTAGGAGTAGGTGTA
SmilChr02G001396 Chr02 NC_080388.1:26488940-26488954promoter 内 3494-3508 bp - 493 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 26489447-26491321(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTACCTACCACTCC
SmilChr02G000626 Chr02 NC_080388.1:9354190-9354204promoter 内 3450-3464 bp - 537 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 9350353-9353653(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATTCGGGTAGGTTGA
SmilChr02G002899 Chr02 NC_080388.1:49259142-49259156promoter 内 3446-3460 bp + 541 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 49259697-49261085(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GATAAAGTAGGTGTA
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SmilChr04G000662 Chr04 NC_080390.1:7484408-7484422promoter 内 3446-3460 bp - 541 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 7481036-7483867(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GATAAAGTAGGTGTA
SmilChr08G002406 Chr08 NC_080394.1:22862410-22862424promoter 内 3434-3448 bp - 553 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 22857697-22861857(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TATAAGGTAGGTTTG
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SmilChr01G000949 Chr01 NC_080387.1:20116353-20116367promoter 内 3280-3294 bp + 707 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 20107984-20115646(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CTCACCTAATAATAC
SmilChr07G004363 Chr07 NC_080393.1:56177052-56177066promoter 内 3259-3273 bp + 728 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 56177794-56181590(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GATACAGTAGGTGAG
SmilChr03G001648 Chr03 NC_080389.1:21417424-21417438promoter 内 3248-3262 bp - 739 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 21413235-21416685(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GCCCTGGTAGGTTGA
SmilChr02G001869 Chr02 NC_080388.1:33982439-33982453promoter 内 3218-3232 bp - 769 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 33979922-33981670(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GATAAAGTAGGTGTA
SmilChr07G001062 Chr07 NC_080393.1:7824439-7824453promoter 内 3214-3228 bp - 773 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 7825226-7828255(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATCACCTACTTAACT
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SmilChr04G002525 Chr04 NC_080390.1:40283810-40283824promoter 内 3160-3174 bp + 827 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 40284651-40287196(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GATAAAGTAGGTGTA
SmilChr04G000663 Chr04 NC_080390.1:7493894-7493908promoter 内 3158-3172 bp - 829 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 7490554-7493065(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GATAAAGTAGGTGTA