转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 132 / 143 下载 TSV

上一页 132 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G002965 Chr04 NC_080390.1:46022851-46022862promoter 内 1625-1636 bp + 2365 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 46016086-46020486(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGTTT
SmilChr02G001514 Chr02 NC_080388.1:28246919-28246930promoter 内 1108-1119 bp - 2882 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 28240391-28244037(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGACCAGCTGTG
SmilChr02G003080 Chr02 NC_080388.1:51728834-51728845promoter 内 1058-1069 bp + 2932 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 51724071-51725902(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTAACTGTCAA
SmilChr01G003279 Chr01 NC_080387.1:51493879-51493890promoter 内 960-971 bp + 3030 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 51489904-51490849(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGAGCTGTCAA
SmilChr04G001308 Chr04 NC_080390.1:20868630-20868641promoter 内 930-941 bp - 3060 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 20871701-20872882(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTAACTGTCAA
SmilChr03G001025 Chr03 NC_080389.1:11914929-11914940promoter 内 876-887 bp + 3114 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 11910604-11911815(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTTGT
SmilChr07G003160 Chr07 NC_080393.1:33516497-33516508promoter 内 876-887 bp - 3114 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 33519622-33525960(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGAGCTGTCAA
SmilChr03G002552 Chr03 NC_080389.1:40712797-40712808promoter 内 813-824 bp + 3177 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 40704100-40709620(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGAGCTGTCAA
SmilChr05G003791 Chr05 NC_080391.1:51253070-51253081promoter 内 799-810 bp + 3191 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 51256272-51259748(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTAGA
SmilChr07G000822 Chr07 NC_080393.1:5800195-5800206promoter 内 671-682 bp + 3319 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 5795254-5796876(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTAACTGTCAA
SmilChr02G001555 Chr02 NC_080388.1:28854398-28854409promoter 内 617-628 bp - 3373 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 28857782-28868220(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGTTT
SmilChr05G002843 Chr05 NC_080391.1:33857889-33857900promoter 内 565-576 bp - 3425 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 33861325-33870252(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGAGCTGTCAA
SmilChr02G000764 Chr02 NC_080388.1:12449616-12449627promoter 内 543-554 bp - 3447 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 12444913-12446169(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTAGA
SmilChr04G002748 Chr04 NC_080390.1:43154724-43154735promoter 内 542-553 bp - 3448 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 43149008-43151276(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACAACAGCTGAC
SmilChr04G002967 Chr04 NC_080390.1:46022851-46022862promoter 内 489-500 bp + 3501 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 46026363-46027266(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAACCAGCTGTG
SmilChr01G003034 Chr01 NC_080387.1:49363247-49363258promoter 内 463-474 bp + 3527 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 49366785-49371200(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGACCAGCTGTT
SmilChr05G004076 Chr05 NC_080391.1:54639469-54639480promoter 内 344-355 bp + 3646 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 54643126-54646127(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTGCG
SmilChr07G000087 Chr07 NC_080393.1:464142-464153promoter 内 290-301 bp - 3700 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 453118-460442(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCCA
SmilChr05G002995 Chr05 NC_080391.1:36837518-36837529promoter 内 281-292 bp - 3709 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 36828939-36833809(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGACCAGCTGTT
SmilChr02G001996 Chr02 NC_080388.1:36071216-36071227promoter 内 276-287 bp + 3714 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 36054525-36067502(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGAGCTGTCAA
SmilChr03G003968 Chr03 NC_080389.1:58721148-58721159promoter 内 198-209 bp - 3792 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 58724951-58735781(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTGCCA
SmilChr05G003220 Chr05 NC_080391.1:41313876-41313887promoter 内 167-178 bp - 3823 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 41317710-41319903(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGTTT
SmilChr05G001233 Chr05 NC_080391.1:10439559-10439570promoter 内 143-154 bp - 3847 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 10443417-10461552(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGTCC
SmilChr02G000798 Chr02 NC_080388.1:13261684-13261695promoter 内 121-132 bp - 3869 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 13265564-13268160(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGACCTGTCAA
SmilChr07G001432 Chr07 NC_080393.1:11123187-11123198promoter 内 3660-3671 bp + 330 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 2 11123528-11130830(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTCCA
SmilChr07G001170 Chr07 NC_080393.1:8807374-8807385promoter 内 2952-2963 bp + 1038 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 2 8803935-8806336(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGTCA
SmilChr04G002433 Chr04 NC_080390.1:38985213-38985224promoter 内 2092-2103 bp - 1898 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 2 38977216-38983315(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CGTACAGCTGAT
SmilChr01G005110 Chr01 NC_080387.1:68889717-68889728promoter 内 1620-1631 bp + 2370 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 2 68892098-68897551(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAACCAGCTGTT
SmilChr05G002617 Chr05 NC_080391.1:29428887-29428898promoter 内 1177-1188 bp + 2813 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 2 29431711-29434335(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAACCAGCTGTT
SmilChr03G002298 Chr03 NC_080389.1:36199369-36199380promoter 内 633-644 bp + 3357 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 2 36193158-36196012(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGTTT
SmilChr04G000118 Chr04 NC_080390.1:1017179-1017190promoter 内 389-400 bp - 3601 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 2 1020791-1025315(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGTTT
SmilChr02G003401 Chr02 NC_080388.1:55153719-55153730promoter 内 3977-3988 bp + 13 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 55147313-55153706(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATAACTGTCAA
SmilChr03G001593 Chr03 NC_080389.1:20191057-20191068promoter 内 3933-3944 bp + 57 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 20191125-20194405(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTAACAGCTGAA
SmilChr01G002752 Chr01 NC_080387.1:45840771-45840782promoter 内 3750-3761 bp - 240 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 45841022-45846134(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATAACTGTCAA
SmilChr08G001498 Chr08 NC_080394.1:12145470-12145481promoter 内 3747-3758 bp + 243 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 12145724-12147857(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGGCAAGCTGTA
SmilChr07G001820 Chr07 NC_080393.1:15681081-15681092promoter 内 3741-3752 bp + 249 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 15677502-15680832(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATAACTGTCAA
SmilChr04G001376 Chr04 NC_080390.1:22367313-22367324promoter 内 3701-3712 bp + 289 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 22365800-22367024(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGAACTGTCAA
SmilChr02G001689 Chr02 NC_080388.1:31138304-31138315promoter 内 3700-3711 bp - 290 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 31133228-31138014(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTATA
SmilChr01G000151 Chr01 NC_080387.1:2583665-2583676promoter 内 3689-3700 bp - 301 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 2583977-2585591(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACCTGTCAA
SmilChr01G004508 Chr01 NC_080387.1:63176091-63176102promoter 内 3648-3659 bp - 342 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 63172594-63175749(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTCAC
SmilChr08G002536 Chr08 NC_080394.1:24610905-24610916promoter 内 3613-3624 bp + 377 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 24611293-24616342(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTGCG
SmilChr06G000485 Chr06 NC_080392.1:3977238-3977249promoter 内 3610-3621 bp + 380 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 3977629-3982480(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTGCG
SmilChr06G001375 Chr06 NC_080392.1:14420469-14420480promoter 内 3473-3484 bp + 517 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 14420997-14421891(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTGCA
SmilChr04G003620 Chr04 NC_080390.1:52690746-52690757promoter 内 3289-3300 bp - 701 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 52691458-52695462(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATAACTGTCAA
SmilChr03G004066 Chr03 NC_080389.1:59620729-59620740promoter 内 3269-3280 bp + 721 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 59612079-59620008(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGAACTGTCAA
SmilChr01G004900 Chr01 NC_080387.1:67071307-67071318promoter 内 3230-3241 bp - 760 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 67072078-67072761(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACCTGTCAA
SmilChr05G004225 Chr05 NC_080391.1:56090251-56090262promoter 内 3208-3219 bp + 782 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 56088883-56089469(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACCTGTCAA
SmilChr04G002891 Chr04 NC_080390.1:45130248-45130259promoter 内 2926-2937 bp + 1064 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 45128099-45129184(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGCAGCTGTCTA
SmilChr04G002892 Chr04 NC_080390.1:45140100-45140111promoter 内 2926-2937 bp + 1064 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 45137951-45139036(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGCAGCTGTCTA
SmilChr01G003109 Chr01 NC_080387.1:49904723-49904734promoter 内 2878-2889 bp + 1112 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 49905846-49911205(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTGCA