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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因，每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G001518; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00023584-RA_Salv SmilChr05G001518 WRKY XP_057765511.1 MP00455 AACGTTGACTATT

可能结合的靶基因

9792 个结合位点 6900 个候选靶基因 第 135 / 138 下载 TSV

上一页 135 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G005189 Chr02 NC_080388.1:73199048-73199060promoter 内 1180-1192 bp + 2809 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 73189492-73196239(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTGAGTCAACAAA
SmilChr03G001372 Chr03 NC_080389.1:16110797-16110809promoter 内 1180-1192 bp + 2809 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 16113618-16115531(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TCCATTGACTAAA
SmilChr02G000623 Chr02 NC_080388.1:9220527-9220539promoter 内 1143-1155 bp + 2846 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 9216415-9217681(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATTAGTCAAATGA
SmilChr03G000769 Chr03 NC_080389.1:8801914-8801926promoter 内 1134-1146 bp + 2855 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 8795546-8799059(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TATAGTCAAATGA
SmilChr03G000207 Chr03 NC_080389.1:2371258-2371270promoter 内 1120-1132 bp + 2869 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 2374139-2375699(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TCATTTGACTATA
SmilChr01G002092 Chr01 NC_080387.1:36936405-36936417promoter 内 1061-1073 bp + 2928 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 36939345-36943434(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATAGTTGACTTCA
SmilChr02G001920 Chr02 NC_080388.1:34606972-34606984promoter 内 1060-1072 bp + 2929 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 34609913-34611689(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TCATTTGACTAAT
SmilChr02G003778 Chr02 NC_080388.1:59474282-59474294promoter 内 1039-1051 bp - 2950 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 59468707-59471332(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATCATTGACTATC
SmilChr01G003881 Chr01 NC_080387.1:57133421-57133433promoter 内 1023-1035 bp + 2966 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 57136399-57143925(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AAGTTTGACTACC
SmilChr02G001012 Chr02 NC_080388.1:17880234-17880246promoter 内 1016-1028 bp + 2973 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 17873514-17877261(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CATAGTCAAGGAT
SmilChr03G001371 Chr03 NC_080389.1:16110797-16110809promoter 内 1014-1026 bp + 2975 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 16096314-16107822(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTTAGTCAATGGA
SmilChr03G000280 Chr03 NC_080389.1:3182555-3182567promoter 内 1012-1024 bp - 2977 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 3185544-3186798(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TATAGTCAAATGA
SmilChr01G005668 Chr01 NC_080387.1:72980879-72980891promoter 内 981-993 bp - 3008 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 72973582-72977871(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACTTTTGACTACA
SmilChr01G003491 Chr01 NC_080387.1:53463276-53463288promoter 内 880-892 bp - 3109 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 53457578-53460167(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTGTTTGACTAAC
SmilChr02G000585 Chr02 NC_080388.1:8418641-8418653promoter 内 865-877 bp - 3124 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 8421777-8425584(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CATAGTCAAGGAT
SmilChr03G000779 Chr03 NC_080389.1:8883574-8883586promoter 内 796-808 bp + 3193 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 8876744-8880381(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TATAGTCAAATGA
SmilChr03G004526 Chr03 NC_080389.1:63313218-63313230promoter 内 712-724 bp - 3277 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 63307850-63309941(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GGCATTGACTACC
SmilChr02G003028 Chr02 NC_080388.1:50991993-50992005promoter 内 701-713 bp + 3288 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 50995293-50996129(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTGGTTGACTCCA
SmilChr02G001794 Chr02 NC_080388.1:32721057-32721069promoter 内 683-695 bp - 3306 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 32714814-32717751(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TCATTTGACTAAG
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SmilChr02G005192 Chr02 NC_080388.1:73199048-73199060promoter 内 481-493 bp + 3508 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 73202568-73203346(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTTGTTGACTCAA
SmilChr03G003754 Chr03 NC_080389.1:56658323-56658335promoter 内 399-411 bp - 3590 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 56652733-56654733(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TCATTTGACTAAT
SmilChr03G003982 Chr03 NC_080389.1:58823721-58823733promoter 内 320-332 bp - 3669 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 58827402-58829961(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TGCAGTCAACAAG
SmilChr03G000321 Chr03 NC_080389.1:3662167-3662179promoter 内 293-305 bp + 3696 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 3655196-3658471(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TATAGTCAAATGA
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SmilChr03G000080 Chr03 NC_080389.1:965304-965316promoter 内 42-54 bp + 3947 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 960402-961357(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TATAGTCAAATGA
SmilChr02G001517 Chr02 NC_080388.1:28278986-28278998promoter 内 3801-3813 bp + 188 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 28277010-28278798(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TATAGTCAAAAAA
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SmilChr03G004086 Chr03 NC_080389.1:59771342-59771354promoter 内 3357-3369 bp - 632 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 59765665-59770710(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTTTTTGACTATA
SmilChr02G000820 Chr02 NC_080388.1:13810148-13810160promoter 内 3191-3203 bp + 798 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 13795514-13809350(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TATAGTCAAAAAA
SmilChr01G005761 Chr01 NC_080387.1:73713139-73713151promoter 内 3014-3026 bp - 975 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 73714126-73716841(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TGGAGTCAACATT
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SmilChr03G004132 Chr03 NC_080389.1:60160344-60160356promoter 内 2977-2989 bp + 1012 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 60155499-60159332(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTTAGTCAAATGT
SmilChr02G005302 Chr02 NC_080388.1:73966291-73966303promoter 内 2867-2879 bp - 1122 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 73967425-73968899(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GTTAGTCAAAATT
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SmilChr02G004384 Chr02 NC_080388.1:66183920-66183932promoter 内 2598-2610 bp + 1391 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 66185323-66190015(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GTTTTTGACTACT
SmilChr03G003796 Chr03 NC_080389.1:57046995-57047007promoter 内 2434-2446 bp - 1555 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 57044669-57045440(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GTAGTTGACTCAA
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SmilChr01G004660 Chr01 NC_080387.1:64702235-64702247promoter 内 2011-2023 bp - 1978 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 64704225-64708380(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TATAGTCAAAAAA
SmilChr03G004229 Chr03 NC_080389.1:60827717-60827729promoter 内 1741-1753 bp - 2248 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 60829977-60832185(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GTTAGTCAAACTG