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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因，每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G004009; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00018864-RA_Salv SmilChr05G004009 MYB XP_057810662.1 MP00216 AAAAAAGTTAGGTAG

可能结合的靶基因

9832 个结合位点 7342 个候选靶基因 第 135 / 147 下载 TSV

上一页 135 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G005233 Chr01 NC_080387.1:69908509-69908523promoter 内 210-224 bp + 3777 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 69912300-69919203(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 CAGAAAGTTAGGAAA
SmilChr03G001359 Chr03 NC_080389.1:15962528-15962542promoter 内 184-198 bp + 3803 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 15956471-15958725(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 CTACCTAAGACTCCA
SmilChr02G001030 Chr02 NC_080388.1:18222702-18222716promoter 内 170-184 bp - 3817 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 18226533-18226997(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 CTACCTAAACCTCGA
SmilChr01G005532 Chr01 NC_080387.1:72165001-72165015promoter 内 157-171 bp - 3830 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 72168845-72171381(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 AAACCTAACCTAAAA
SmilChr02G005005 Chr02 NC_080388.1:71855653-71855667promoter 内 150-164 bp + 3837 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 71842290-71851816(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TGACCTACCTTTTTT
SmilChr01G004107 Chr01 NC_080387.1:59592670-59592684promoter 内 114-128 bp + 3873 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 59584356-59588797(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TACCCTAACTATTTT
SmilChr01G001905 Chr01 NC_080387.1:34141779-34141793promoter 内 90-104 bp - 3897 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 34145690-34147238(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TGACCTAACGTCGTT
SmilChr01G004203 Chr01 NC_080387.1:60487518-60487532promoter 内 86-100 bp - 3901 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 60491433-60494035(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 CTACCTAATCAAACA
SmilChr03G001061 Chr03 NC_080389.1:12301675-12301689promoter 内 64-78 bp - 3923 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 12305612-12307042(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TTACCTAATCTCCAA
SmilChr02G000471 Chr02 NC_080388.1:6385668-6385682promoter 内 63-77 bp - 3924 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 6376046-6381744(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 ACGAATTTTAGGTAT
SmilChr03G001931 Chr03 NC_080389.1:27139280-27139294promoter 内 58-72 bp - 3929 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 27131868-27135351(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 ACAAGAGTTAGGAAT
SmilChr01G002335 Chr01 NC_080387.1:40509429-40509443promoter 内 45-59 bp + 3942 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 40504640-40505487(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 ATACCTAATAAATCT
SmilChr03G002335 Chr03 NC_080389.1:36834515-36834529promoter 内 3639-3653 bp - 348 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 2 36833359-36834167(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 ATCCGAGTTAGGGAG
SmilChr03G001014 Chr03 NC_080389.1:11669629-11669643promoter 内 3499-3513 bp - 488 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 2 11668818-11669141(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 GAACAAGTTAGGGTT
SmilChr03G004188 Chr03 NC_080389.1:60564394-60564408promoter 内 2847-2861 bp + 1140 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 2 60565548-60569059(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TATTGTGTTAGGTGA
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SmilChr01G001387 Chr01 NC_080387.1:27278770-27278784promoter 内 2396-2410 bp + 1591 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 2 27272328-27277179(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 ACACCTAACAAATAA
SmilChr04G001017 Chr04 NC_080390.1:14170446-14170460promoter 内 2286-2300 bp + 1701 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 2 14172161-14173707(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TTTATTGTTAGGTCC
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SmilChr02G001540 Chr02 NC_080388.1:28661472-28661486promoter 内 1560-1574 bp + 2427 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 2 28663913-28666472(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 CTACCAATTAGGTAT
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SmilChr01G000405 Chr01 NC_080387.1:8242977-8242991promoter 内 1130-1144 bp + 2857 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 2 8237862-8240120(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TTACCTAACCGAATA
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SmilChr03G002405 Chr03 NC_080389.1:38164992-38165006promoter 内 3973-3987 bp - 14 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 38165020-38168150(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 CTACCTAAAATTCCA
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SmilChr01G002608 Chr01 NC_080387.1:44270264-44270278promoter 内 3934-3948 bp - 53 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 44269414-44270211(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 AGGCGGCTTAGGTAT
SmilChr02G003962 Chr02 NC_080388.1:61784004-61784018promoter 内 3916-3930 bp - 71 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 61784089-61785619(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TTACCTAATCCTCAA
SmilChr02G000949 Chr02 NC_080388.1:16501687-16501701promoter 内 3888-3902 bp + 99 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 16501800-16512624(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TATTATGTTAGGTTT
SmilChr02G005091 Chr02 NC_080388.1:72500975-72500989promoter 内 3873-3887 bp + 114 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 72501103-72503096(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TATTGTGTTAGGTGA
SmilChr01G003038 Chr01 NC_080387.1:49376306-49376320promoter 内 3857-3871 bp + 130 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 49376450-49380940(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 GATTCAATTAGGTAT
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SmilChr02G005458 Chr02 NC_080388.1:74897501-74897515promoter 内 3738-3752 bp + 249 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 74897764-74901278(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 CCAATTCTTAGGTAT
SmilChr01G000374 Chr01 NC_080387.1:7710245-7710259promoter 内 3636-3650 bp + 351 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 7710610-7713571(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TTGCCGGTTAGGTCG
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SmilChr01G001212 Chr01 NC_080387.1:24346118-24346132promoter 内 3608-3622 bp - 379 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 24346511-24350237(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 CTACCTAAATGTATG
SmilChr01G004771 Chr01 NC_080387.1:65889020-65889034promoter 内 3586-3600 bp - 401 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 65882451-65888619(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 GACGACGTTAGGTTA
SmilChr01G003687 Chr01 NC_080387.1:55264390-55264404promoter 内 3572-3586 bp + 415 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 55264819-55264902(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 ATAAATTTTAGGTAA
SmilChr03G001998 Chr03 NC_080389.1:29673495-29673509promoter 内 3505-3519 bp + 482 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 29673991-29677766(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 CCAGTAGTTAGGAAG
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SmilChr02G001708 Chr02 NC_080388.1:31430335-31430349promoter 内 3494-3508 bp - 493 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 31428694-31429842(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 AAAACAGTTAGGAAG
SmilChr02G001745 Chr02 NC_080388.1:32038117-32038131promoter 内 3483-3497 bp - 504 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 32038635-32039596(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 CAACCTAACAGTACA
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SmilChr03G002454 Chr03 NC_080389.1:38899944-38899958promoter 内 3439-3453 bp - 548 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 38897591-38899396(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TTCGAACTTAGGTAA
SmilChr03G000756 Chr03 NC_080389.1:8643896-8643910promoter 内 3431-3445 bp - 556 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 8641850-8643340(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 CAAAATTTTAGGTAC
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SmilChr03G000757 Chr03 NC_080389.1:8643896-8643910promoter 内 3231-3245 bp - 756 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 8644666-8646235(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 GTACCTAAAATTTTG
SmilChr01G005298 Chr01 NC_080387.1:70279162-70279176promoter 内 3229-3243 bp + 758 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 70279934-70281517(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 ATTAGTATTAGGTAA