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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。

预计算阈值必须与当前索引一致。非法、未支持或需四舍五入的输入会报错；页面与下载均不会自动切换阈值。

257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因，每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G005217; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00006334-RA_Salv SmilChr02G005217 G2-like XP_057792502.1 MP00022 GAGAATCTGT

可能结合的靶基因

9720 个结合位点 6959 个候选靶基因 第 138 / 140 下载 TSV

上一页 138 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G001108 Chr01 NC_080387.1:22708394-22708403promoter 内 795-804 bp + 3197 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 22699351-22705197(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 ACAGATTGTC
SmilChr01G004960 Chr01 NC_080387.1:67696867-67696876promoter 内 667-676 bp - 3325 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 67692933-67693542(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GACAATCTGT
SmilChr02G005269 Chr02 NC_080388.1:73780117-73780126promoter 内 661-670 bp + 3331 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 73772664-73776786(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GCAGATTCGT
SmilChr01G002828 Chr01 NC_080387.1:46879880-46879889promoter 内 621-630 bp - 3371 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 46873713-46876509(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 ACGAATCTGC
SmilChr01G000793 Chr01 NC_080387.1:17225766-17225775promoter 内 579-588 bp - 3413 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 17214513-17222353(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GACAATCTGT
SmilChr01G003085 Chr01 NC_080387.1:49686296-49686305promoter 内 569-578 bp - 3423 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 49689728-49693147(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 ACAGATTCCG
SmilChr02G003518 Chr02 NC_080388.1:56357896-56357905promoter 内 559-568 bp + 3433 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 56361338-56364843(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 ACGAATCTGC
SmilChr01G002259 Chr01 NC_080387.1:39386630-39386639promoter 内 549-558 bp + 3443 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 39380525-39383187(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 ACAGATTCCG
SmilChr02G004785 Chr02 NC_080388.1:70015139-70015148promoter 内 535-544 bp + 3457 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 70018605-70021442(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GACAATCTGT
SmilChr01G002154 Chr01 NC_080387.1:37530433-37530442promoter 内 506-515 bp - 3486 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 37533928-37536795(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GCAGATTCGT
SmilChr02G004319 Chr02 NC_080388.1:65504480-65504489promoter 内 477-486 bp - 3515 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 65508004-65510566(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 ACAGATTGTC
SmilChr03G001383 Chr03 NC_080389.1:16350514-16350523promoter 内 436-445 bp + 3556 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 16354079-16356884(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CGGAATCTGT
SmilChr04G001037 Chr04 NC_080390.1:14717211-14717220promoter 内 384-393 bp - 3608 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 14720828-14723953(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 ACAGATTGTC
SmilChr03G004305 Chr03 NC_080389.1:61409104-61409113promoter 内 351-360 bp + 3641 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 61405392-61405463(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 ACAGATTGTC
SmilChr03G000845 Chr03 NC_080389.1:9653144-9653153promoter 内 316-325 bp + 3676 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 9637415-9649468(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 ACAGATTGTC
SmilChr03G002930 Chr03 NC_080389.1:46060574-46060583promoter 内 272-281 bp - 3720 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 46053309-46056854(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GACAATCTGT
SmilChr03G002247 Chr03 NC_080389.1:35402721-35402730promoter 内 234-243 bp + 3758 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 35406488-35415709(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CGGAATCTGT
SmilChr01G000679 Chr01 NC_080387.1:14995298-14995307promoter 内 194-203 bp + 3798 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 14999105-15003423(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GACAATCTGT
SmilChr03G002090 Chr03 NC_080389.1:32190493-32190502promoter 内 188-197 bp + 3804 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 32184231-32186689(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 ACAGATTGTC
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SmilChr03G004334 Chr03 NC_080389.1:61680069-61680078promoter 内 164-173 bp - 3828 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 61683906-61687502(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GCAGATTCGT
SmilChr01G000854 Chr01 NC_080387.1:18412053-18412062promoter 内 138-147 bp + 3854 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 18415916-18419064(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CGGAATCTGT
SmilChr02G003193 Chr02 NC_080388.1:53078389-53078398promoter 内 130-139 bp + 3862 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 53082260-53083416(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CGGAATCTGT
SmilChr03G001381 Chr03 NC_080389.1:16329864-16329873promoter 内 120-129 bp + 3872 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 16333745-16336551(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CGGAATCTGT
SmilChr01G003022 Chr01 NC_080387.1:49269235-49269244promoter 内 81-90 bp - 3911 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 49273155-49275950(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 ACAGATTCCG
SmilChr02G003609 Chr02 NC_080388.1:57350671-57350680promoter 内 28-37 bp - 3964 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 57340981-57346707(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GACAATCTGT
SmilChr01G002784 Chr01 NC_080387.1:46312523-46312532promoter 内 443-452 bp + 3549 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 2 46316081-46319103(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTCC
SmilChr03G000148 Chr03 NC_080389.1:1621891-1621900promoter 内 3955-3964 bp + 37 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 1621937-1625847(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTCC
SmilChr03G004660 Chr03 NC_080389.1:64087913-64087922promoter 内 3947-3956 bp + 45 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 64087967-64091188(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTCC
SmilChr01G000537 Chr01 NC_080387.1:11057516-11057525promoter 内 3741-3750 bp + 251 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 11056474-11057265(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GGAGATTCTC
SmilChr01G000315 Chr01 NC_080387.1:6071741-6071750promoter 内 3740-3749 bp + 252 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 6069699-6071489(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GGAGATTCTC
SmilChr02G001562 Chr02 NC_080388.1:28892769-28892778promoter 内 3737-3746 bp - 255 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 28893033-28895362(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GGAGATTCTC
SmilChr02G001917 Chr02 NC_080388.1:34507278-34507287promoter 内 3736-3745 bp - 256 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 34507543-34508333(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GGAGATTCTC
SmilChr02G001875 Chr02 NC_080388.1:34043165-34043174promoter 内 3675-3684 bp + 317 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 34042124-34042848(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GGAGATTCTC
SmilChr03G002883 Chr03 NC_080389.1:45512143-45512152promoter 内 3673-3682 bp + 319 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 45511281-45511824(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GGAGATTCTC
SmilChr02G000544 Chr02 NC_080388.1:7499880-7499889promoter 内 3555-3564 bp - 437 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 7500326-7500844(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GGAGATTCTC
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SmilChr02G002352 Chr02 NC_080388.1:41312290-41312299promoter 内 3289-3298 bp - 703 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 41309914-41311587(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTCC
SmilChr03G000495 Chr03 NC_080389.1:5310101-5310110promoter 内 3187-3196 bp - 805 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 5308165-5309296(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTCC
SmilChr03G000952 Chr03 NC_080389.1:10774239-10774248promoter 内 3148-3157 bp + 844 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 10775092-10776276(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTCC
SmilChr03G001251 Chr03 NC_080389.1:14422806-14422815promoter 内 3102-3111 bp - 890 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 14416837-14421916(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTCC
SmilChr03G001137 Chr03 NC_080389.1:13094778-13094787promoter 内 3022-3031 bp - 970 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 13095757-13096290(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GGAGATTCTC
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SmilChr01G003432 Chr01 NC_080387.1:52954473-52954482promoter 内 2951-2960 bp - 1041 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 52952881-52953432(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTCC
SmilChr01G003785 Chr01 NC_080387.1:56227335-56227344promoter 内 2911-2920 bp + 1081 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 56224761-56226254(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GGAGATTCTC
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SmilChr02G003027 Chr02 NC_080388.1:50975398-50975407promoter 内 2774-2783 bp + 1218 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 50976625-50979219(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTCC