转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 14 / 143 下载 TSV

上一页 14 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G001636 Chr03 NC_080389.1:21081308-21081319promoter 内 2969-2980 bp - 1021 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 21078468-21080287(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGAA
SmilChr01G002816 Chr01 NC_080387.1:46722496-46722507promoter 内 2942-2953 bp + 1048 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 46723555-46729059(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGAA
SmilChr03G004393 Chr03 NC_080389.1:62106822-62106833promoter 内 2854-2865 bp + 1136 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 62107969-62119002(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGAA
SmilChr06G001062 Chr06 NC_080392.1:10496301-10496312promoter 内 2751-2762 bp + 1239 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 10492552-10495062(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCAT
SmilChr05G004015 Chr05 NC_080391.1:54114286-54114297promoter 内 2555-2566 bp + 1435 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 54111903-54112851(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCAT
SmilChr02G000431 Chr02 NC_080388.1:5584638-5584649promoter 内 2493-2504 bp - 1497 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 5582653-5583141(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGAA
SmilChr07G004571 Chr07 NC_080393.1:58496416-58496427promoter 内 2111-2122 bp - 1879 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 58498306-58501017(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCAT
SmilChr02G001818 Chr02 NC_080388.1:33061769-33061780promoter 内 2042-2053 bp + 1948 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 33058999-33059821(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCAT
SmilChr06G001063 Chr06 NC_080392.1:10496301-10496312promoter 内 1825-1836 bp + 2165 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 10498477-10498548(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGAA
SmilChr03G004100 Chr03 NC_080389.1:59884065-59884076promoter 内 1596-1607 bp - 2394 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 59886470-59902314(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTCGT
SmilChr08G001034 Chr08 NC_080394.1:7870235-7870246promoter 内 1385-1396 bp - 2605 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 7872851-7874617(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTCGA
SmilChr04G002383 Chr04 NC_080390.1:38374587-38374598promoter 内 1204-1215 bp - 2786 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 38369075-38371801(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGAA
SmilChr05G002147 Chr05 NC_080391.1:22651493-22651504promoter 内 1165-1176 bp - 2825 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 22654329-22655116(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCAT
SmilChr07G003099 Chr07 NC_080393.1:32824757-32824768promoter 内 935-946 bp + 3055 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 32819326-32821702(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCAT
SmilChr01G000798 Chr01 NC_080387.1:17242870-17242881promoter 内 826-837 bp - 3164 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 17237048-17239706(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGAA
SmilChr07G002853 Chr07 NC_080393.1:28682646-28682657promoter 内 569-580 bp - 3421 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 28678854-28679225(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGAA
SmilChr05G001575 Chr05 NC_080391.1:14403835-14403846promoter 内 491-502 bp - 3499 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 14407345-14408772(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCAT
SmilChr08G000995 Chr08 NC_080394.1:7459755-7459766promoter 内 109-120 bp - 3881 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 7463647-7465546(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTCGA
SmilChr01G003037 Chr01 NC_080387.1:49378160-49378171promoter 内 2131-2142 bp - 1859 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 4 49375882-49376301(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTGTT
SmilChr05G002249 Chr05 NC_080391.1:24165043-24165054promoter 内 2719-2730 bp - 1271 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 3 24166325-24170221(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTCGA
SmilChr02G002399 Chr02 NC_080388.1:41877789-41877800promoter 内 2618-2629 bp + 1372 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 3 41879172-41880548(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTGTT
SmilChr02G004914 Chr02 NC_080388.1:71124357-71124368promoter 内 2051-2062 bp + 1939 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 3 71126307-71126386(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGCCAGCTGTA
SmilChr02G004915 Chr02 NC_080388.1:71124357-71124368promoter 内 1071-1082 bp + 2919 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 3 71127287-71131478(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGCCAGCTGTA
SmilChr05G000953 Chr05 NC_080391.1:7699001-7699012promoter 内 139-150 bp - 3851 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 3 7693114-7695150(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTGAT
SmilChr06G001461 Chr06 NC_080392.1:15478838-15478849promoter 内 3949-3960 bp + 41 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 2 15478890-15487051(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTGTT
SmilChr05G000954 Chr05 NC_080391.1:7699001-7699012promoter 内 2834-2845 bp - 1156 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 2 7697773-7697845(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTGAT
SmilChr05G000891 Chr05 NC_080391.1:7059394-7059405promoter 内 2816-2827 bp - 1174 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 2 7058148-7058220(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTGAT
SmilChr07G000714 Chr07 NC_080393.1:4967608-4967619promoter 内 2621-2632 bp + 1369 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 2 4968988-4972128(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGCCAGCTGTA
SmilChr02G003395 Chr02 NC_080388.1:55073879-55073890promoter 内 2142-2153 bp + 1848 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 2 55063768-55072031(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGCGG
SmilChr02G002485 Chr02 NC_080388.1:43247151-43247162promoter 内 913-924 bp + 3077 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 2 43241794-43244074(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGCGG
SmilChr03G001718 Chr03 NC_080389.1:23048385-23048396promoter 内 3949-3960 bp + 41 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 23048437-23049338(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTGAT
SmilChr07G000306 Chr07 NC_080393.1:2013767-2013778promoter 内 3945-3956 bp - 45 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 2013823-2016134(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTCAA
SmilChr03G001675 Chr03 NC_080389.1:21982454-21982465promoter 内 3881-3892 bp + 109 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 21982574-21983407(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTGAT
SmilChr02G005172 Chr02 NC_080388.1:73026875-73026886promoter 内 3033-3044 bp + 957 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 73027843-73038259(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTGAT
SmilChr04G001610 Chr04 NC_080390.1:26777671-26777682promoter 内 2681-2692 bp + 1309 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 26776290-26776362(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTCGT
SmilChr02G005587 Chr02 NC_080388.1:75673772-75673783promoter 内 2600-2611 bp - 1390 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 75668157-75672382(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGAG
SmilChr05G000338 Chr05 NC_080391.1:2515211-2515222promoter 内 2072-2083 bp - 1918 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 2517140-2530900(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTCAC
SmilChr08G002852 Chr08 NC_080394.1:28367532-28367543promoter 内 2068-2079 bp - 1922 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 28360536-28365610(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGAG
SmilChr05G000337 Chr05 NC_080391.1:2515211-2515222promoter 内 1465-1476 bp - 2525 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 2509793-2512686(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTGAT
SmilChr04G002619 Chr04 NC_080390.1:41598310-41598321promoter 内 1382-1393 bp + 2608 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 41600929-41605099(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGAG
SmilChr04G003464 Chr04 NC_080390.1:51120782-51120793promoter 内 1382-1393 bp - 2608 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 51123401-51126909(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTCAC
SmilChr04G002661 Chr04 NC_080390.1:42014829-42014840promoter 内 1355-1366 bp + 2635 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 42017475-42021643(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGAG
SmilChr06G000183 Chr06 NC_080392.1:1268029-1268040promoter 内 1298-1309 bp + 2692 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 1270732-1272241(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGAG
SmilChr01G005759 Chr01 NC_080387.1:73700908-73700919promoter 内 1073-1084 bp + 2917 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 73682109-73697991(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTCGA
SmilChr03G004727 Chr03 NC_080389.1:64449529-64449540promoter 内 966-977 bp - 3024 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 64452564-64458642(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTCAA
SmilChr04G001608 Chr04 NC_080390.1:26777671-26777682promoter 内 915-926 bp + 3075 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 26771724-26774596(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTCGT
SmilChr06G000050 Chr06 NC_080392.1:414107-414118promoter 内 291-302 bp - 3699 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 408241-410408(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGAG
SmilChr01G004047 Chr01 NC_080387.1:58898501-58898512promoter 内 159-170 bp - 3831 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 58902343-58908090(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTCGT
SmilChr02G002051 Chr02 NC_080388.1:36927096-36927107promoter 内 3150-3161 bp + 840 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 4 36927947-36929065(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGACAGCTGTT
SmilChr02G003233 Chr02 NC_080388.1:53603294-53603305promoter 内 2621-2632 bp - 1369 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 4 53600462-53601925(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGAG