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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。

预计算阈值必须与当前索引一致。非法、未支持或需四舍五入的输入会报错；页面与下载均不会自动切换阈值。

257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID 家族 基序 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 SmilChr04G003117.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 SmilChr04G003114.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 SmilChr01G005298.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 SmilChr03G003924.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 SmilChr01G005344.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 SmilChr08G004408.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 SmilChr04G001094.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 SmilChr07G003597.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 SmilChr02G005433.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 SmilChr04G004136.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 SmilChr01G003955.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 SmilChr03G003685.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 SmilChr07G002937.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 SmilChr02G003833.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 SmilChr07G002803.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 SmilChr05G002364.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 SmilChr08G003267.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 SmilChr02G005012.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 SmilChr07G001978.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 SmilChr05G000741.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 SmilChr01G004579.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 SmilChr05G000593.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 SmilChr03G004518.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 SmilChr06G001829.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 SmilChr05G000830.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 SmilChr08G002543.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 SmilChr01G002743.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 SmilChr04G002704.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 SmilChr05G001395.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 SmilChr04G002953.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 SmilChr01G004199.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 SmilChr05G004009.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 SmilChr03G001606.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 SmilChr02G004600.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 SmilChr03G004179.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 SmilChr04G003805.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 SmilChr03G003761.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 SmilChr01G001885.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 SmilChr05G004392.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 SmilChr04G002757.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 SmilChr01G003404.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 SmilChr03G002335.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 SmilChr07G002075.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 SmilChr04G000162.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 SmilChr04G000040.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 SmilChr08G001896.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 SmilChr02G005217.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 SmilChr05G000260.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 SmilChr01G002885.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 SmilChr05G001518.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 SmilChr03G002503.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 SmilChr03G001252.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 SmilChr06G001365.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 SmilChr03G003439.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 SmilChr06G001111.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 SmilChr02G000949.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 SmilChr01G000025.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 SmilChr01G004313.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 SmilChr02G005502.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 SmilChr03G004274.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 SmilChr02G003688.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 SmilChr04G003367.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 SmilChr04G000157.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 SmilChr07G002147.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 SmilChr05G002277.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 SmilChr07G004480.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 SmilChr02G004447.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 SmilChr04G000070.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 SmilChr01G002039.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 SmilChr01G005851.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 SmilChr02G005238.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 SmilChr06G002048.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 SmilChr07G000836.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 SmilChr04G003119.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 SmilChr01G004114.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 SmilChr08G004246.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 SmilChr05G001980.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 SmilChr04G000094.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 SmilChr02G002534.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 SmilChr05G001269.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 SmilChr07G003441.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 SmilChr02G001791.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 SmilChr05G003285.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 SmilChr05G000619.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 SmilChr04G003745.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 SmilChr02G004607.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 SmilChr02G003399.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 SmilChr01G004920.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 SmilChr06G001059.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 SmilChr01G004552.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 SmilChr01G006187.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 SmilChr01G001516.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 SmilChr04G003955.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 SmilChr01G004708.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 SmilChr05G001961.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 SmilChr08G000478.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 SmilChr01G000943.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 SmilChr05G004106.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 SmilChr04G003973.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 SmilChr03G002207.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因，每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003833; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族蛋白基序共识序列
SMil_00013392-RA_Salv SmilChr02G003833 MYB SmilChr02G003833.1 MP00476 TAACCGTAATA

可能结合的靶基因

9904 个结合位点 7981 个候选靶基因 第 147 / 160 下载 TSV

上一页 147 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF 基序 匹配序列
SmilChr03G004370 Chr03 NC_080389.1:61905493-61905503promoter 内 3169-3179 bp - 822 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 61906325-61910753(+) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 TTGTACGGTTT
SmilChr01G004026 Chr01 NC_080387.1:58670867-58670877promoter 内 3163-3173 bp - 828 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 58667914-58670039(-) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 AAACCGTACTA
SmilChr03G004398 Chr03 NC_080389.1:62173886-62173896promoter 内 3152-3162 bp - 839 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 62174735-62179268(+) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 TTGTACGGTTT
SmilChr03G004042 Chr03 NC_080389.1:59422998-59423008promoter 内 3137-3147 bp + 854 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 59419441-59422144(-) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 TTGTACGGTTT
SmilChr05G000179 Chr05 NC_080391.1:1412468-1412478promoter 内 3122-3132 bp + 869 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 1413347-1417718(+) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 AAACCGTACAA
SmilChr05G000178 Chr05 NC_080391.1:1402163-1402173promoter 内 3106-3116 bp + 885 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 1403058-1406475(+) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 AAACCGTACAA
SmilChr03G004403 Chr03 NC_080389.1:62212411-62212421promoter 内 3077-3087 bp - 914 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 62213335-62217661(+) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 TTGTACGGTTT
SmilChr01G005206 Chr01 NC_080387.1:69720754-69720764promoter 内 2989-2999 bp - 1002 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 69721766-69722389(+) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 TTGTACGGTTT
SmilChr02G002251 Chr02 NC_080388.1:39935233-39935243promoter 内 2962-2972 bp + 1029 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 39936272-39942429(+) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 AAACCGTACAA
SmilChr03G004592 Chr03 NC_080389.1:63752662-63752672promoter 内 2736-2746 bp - 1255 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 63748546-63751407(-) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 AAACCGTACAA
SmilChr03G004385 Chr03 NC_080389.1:62059977-62059987promoter 内 2726-2736 bp - 1265 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 62061252-62064809(+) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 TTGTACGGTTT
SmilChr02G003976 Chr02 NC_080388.1:62021951-62021961promoter 内 2549-2559 bp + 1442 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 62023403-62027692(+) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 AAACCGTACAA
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