转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。

预计算阈值必须与当前索引一致。非法、未支持或需四舍五入的输入会报错;页面与下载均不会自动切换阈值。

257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因,每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G001094; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00021820-RA_Salv SmilChr04G001094 WRKY XP_057804404.1 MP00408 AGCGTTGACTTTT

可能结合的靶基因

9902 个结合位点 8149 个候选靶基因 第 163 / 163 下载 TSV

上一页 163 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G001438 Chr03 NC_080389.1:17069233-17069245promoter 内 2442-2454 bp + 1547 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 17070792-17073998(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AGAGTTGACTAAC
SmilChr01G002651 Chr01 NC_080387.1:44829517-44829529promoter 内 2389-2401 bp + 1600 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 44831129-44832049(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GCAGTTGACTAAA
SmilChr07G003733 Chr07 NC_080393.1:45382945-45382957promoter 内 2242-2254 bp + 1747 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 45384704-45387551(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CCAGTTGACTAGG
SmilChr02G002441 Chr02 NC_080388.1:42654026-42654038promoter 内 2232-2244 bp - 1757 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 42655795-42658456(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GTTAGTCAACTCT
SmilChr04G003596 Chr04 NC_080390.1:52393616-52393628promoter 内 2208-2220 bp - 1781 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 52395409-52397097(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CTTAGTCAACTGA
SmilChr07G001283 Chr07 NC_080393.1:9856768-9856780promoter 内 2184-2196 bp - 1805 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 9858585-9859214(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GGAAGTCAACAAT
SmilChr05G003061 Chr05 NC_080391.1:38450301-38450313promoter 内 2102-2114 bp + 1887 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 38452200-38454968(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GCCTTTGACTTTG
SmilChr07G003027 Chr07 NC_080393.1:31302510-31302522promoter 内 2086-2098 bp + 1903 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 31304425-31307019(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TCAGTTGACTAAG
SmilChr07G003034 Chr07 NC_080393.1:31372184-31372196promoter 内 2086-2098 bp + 1903 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 31374099-31375480(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TCAGTTGACTAAG
SmilChr08G000137 Chr08 NC_080394.1:857504-857516promoter 内 2025-2037 bp + 1964 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 859480-866768(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CTTGTTGACTTGG
SmilChr04G000834 Chr04 NC_080390.1:10474911-10474923promoter 内 1983-1995 bp - 2006 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 10476929-10478260(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GACAGTCAACACC
SmilChr01G002650 Chr01 NC_080387.1:44829517-44829529promoter 内 1875-1887 bp + 2114 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 44825256-44827403(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TTTAGTCAACTGC
SmilChr03G003462 Chr03 NC_080389.1:53030590-53030602promoter 内 1844-1856 bp - 2145 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 53032747-53036264(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AATAGTCAACAAA
SmilChr06G000295 Chr06 NC_080392.1:2087378-2087390promoter 内 1784-1796 bp + 2205 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 2082229-2085173(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TCAAGTCAACAGA
SmilChr02G004836 Chr02 NC_080388.1:70474693-70474705promoter 内 1773-1785 bp + 2216 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 70476921-70489757(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CTTGTTGACTTGG
SmilChr03G001465 Chr03 NC_080389.1:17521946-17521958promoter 内 1744-1756 bp - 2245 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 17524203-17528286(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TTAAGTCAACCTG
SmilChr01G000894 Chr01 NC_080387.1:18983593-18983605promoter 内 1728-1740 bp - 2261 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 18980595-18981332(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AGAGTTGACTAAC
SmilChr05G003115 Chr05 NC_080391.1:39694931-39694943promoter 内 1704-1716 bp - 2285 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 39689886-39692646(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GCCTTTGACTTTG
SmilChr04G001743 Chr04 NC_080390.1:28716506-28716518promoter 内 1672-1684 bp + 2317 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 28710995-28714189(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AATAGTCAACAAA
SmilChr06G002595 Chr06 NC_080392.1:37161006-37161018promoter 内 1662-1674 bp - 2327 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 37163345-37165926(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CTACGTCAACGGA
SmilChr05G003545 Chr05 NC_080391.1:47313327-47313339promoter 内 1655-1667 bp + 2334 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 47315673-47319918(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ATTGTTGACTTCC
SmilChr07G000851 Chr07 NC_080393.1:6066930-6066942promoter 内 1477-1489 bp + 2512 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 6069454-6071474(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CTTGTTGACTTGG
SmilChr07G002072 Chr07 NC_080393.1:18847426-18847438promoter 内 1466-1478 bp - 2523 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 18849961-18853067(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AATAGTCAACAAA
SmilChr05G003544 Chr05 NC_080391.1:47308704-47308716promoter 内 1387-1399 bp + 2602 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 47304473-47306102(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GGAAGTCAACAAT
SmilChr05G000042 Chr05 NC_080391.1:200177-200189promoter 内 1370-1382 bp - 2619 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 202808-205012(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TTAAGTCAACAAC
SmilChr02G003107 Chr02 NC_080388.1:52044265-52044277promoter 内 1303-1315 bp + 2686 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 52039649-52041579(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CAATGTCAACGAT
SmilChr01G000737 Chr01 NC_080387.1:16343418-16343430promoter 内 1222-1234 bp + 2767 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 16337692-16340651(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GGAAGTCAACAAT
SmilChr02G003092 Chr02 NC_080388.1:51788741-51788753promoter 内 1204-1216 bp - 2785 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 51783059-51785956(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AACGTTGACTGCA
SmilChr05G000186 Chr05 NC_080391.1:1500515-1500527promoter 内 1180-1192 bp + 2809 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 1493467-1497706(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TTTAGTCAACTGC
SmilChr07G002062 Chr07 NC_080393.1:18758096-18758108promoter 内 1036-1048 bp + 2953 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 18761061-18764332(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GACATTGACTTCG
SmilChr08G000136 Chr08 NC_080394.1:857504-857516promoter 内 974-986 bp + 3015 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 851926-854489(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CCAAGTCAACAAG
SmilChr01G003975 Chr01 NC_080387.1:58187429-58187441promoter 内 954-966 bp + 3035 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 58181847-58184394(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GACAGTCAACACC
SmilChr01G002251 Chr01 NC_080387.1:39128906-39128918promoter 内 789-801 bp - 3200 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 39132118-39133736(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GTTAGTCAACTCT
SmilChr05G003495 Chr05 NC_080391.1:46481754-46481766promoter 内 760-772 bp - 3229 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 46484995-46487473(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CTACGTCAACGGA
SmilChr01G001167 Chr01 NC_080387.1:23701579-23701591promoter 内 683-695 bp + 3306 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 23704897-23715789(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TTTGTTGACTTAG
SmilChr07G000352 Chr07 NC_080393.1:2419612-2419624promoter 内 660-672 bp - 3329 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 2411595-2416283(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CTTGTTGACTTGG
SmilChr04G003152 Chr04 NC_080390.1:48122560-48122572promoter 内 558-570 bp + 3431 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 48126003-48134453(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GACGTTGACCAAA
SmilChr04G003061 Chr04 NC_080390.1:47184655-47184667promoter 内 535-547 bp - 3454 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 47178145-47181201(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GACGTTGACCAAA
SmilChr04G001770 Chr04 NC_080390.1:29099117-29099129promoter 内 465-477 bp + 3524 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 29093891-29095593(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GTTAGTCAACTCT
SmilChr03G004739 Chr03 NC_080389.1:64524123-64524135promoter 内 463-475 bp - 3526 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 64527661-64529468(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TTTGGTCAACGTC
SmilChr05G003852 Chr05 NC_080391.1:52005588-52005600promoter 内 435-447 bp - 3554 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 52009154-52010566(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CTACGTCAACGGA
SmilChr04G001061 Chr04 NC_080390.1:15180279-15180291promoter 内 389-401 bp - 3600 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 15183891-15184523(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TTTAGTCAACTGC
SmilChr08G002607 Chr08 NC_080394.1:25449725-25449737promoter 内 306-318 bp - 3683 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 25435501-25446042(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TTTGTTGACTATT
SmilChr02G005458 Chr02 NC_080388.1:74894047-74894059promoter 内 284-296 bp - 3705 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 74897764-74901278(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TGCAGTCAACGTT
SmilChr02G005322 Chr02 NC_080388.1:74105148-74105160promoter 内 92-104 bp + 3897 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 74109057-74110040(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TTTGTTGACTATT
SmilChr02G000144 Chr02 NC_080388.1:1931340-1931352promoter 内 42-54 bp + 3947 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 1935299-1938061(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ATTGTTGACTCTT
SmilChr01G000632 Chr01 NC_080387.1:14213169-14213181promoter 内 39-51 bp + 3950 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 14206604-14209219(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AATAGTCAACAAA
SmilChr01G001472 Chr01 NC_080387.1:28494226-28494238promoter 内 20-32 bp - 3969 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 28487620-28490257(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GACATTGACTTCG
SmilChr06G002607 Chr06 NC_080392.1:37480387-37480399promoter 内 15-27 bp - 3974 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 37484373-37485901(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AATAGTCAACAAA