转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 17 / 136 下载 TSV

上一页 17 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G003353 Chr01 NC_080387.1:52279939-52279949promoter 内 859-869 bp - 3132 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 52283081-52286271(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGCC
SmilChr05G000558 Chr05 NC_080391.1:4196374-4196384promoter 内 794-804 bp + 3197 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 4199581-4204860(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACTCAGCGGG
SmilChr02G000653 Chr02 NC_080388.1:9882479-9882489promoter 内 768-778 bp - 3223 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 9875624-9879256(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCTCAGCGCT
SmilChr02G002189 Chr02 NC_080388.1:39080141-39080151promoter 内 754-764 bp + 3237 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 39083388-39087574(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCGGT
SmilChr05G000859 Chr05 NC_080391.1:6790979-6790989promoter 内 751-761 bp + 3240 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 6794229-6794827(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCGGT
SmilChr01G004900 Chr01 NC_080387.1:67068796-67068806promoter 内 719-729 bp + 3272 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 67072078-67072761(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCGGT
SmilChr03G000609 Chr03 NC_080389.1:6726274-6726284promoter 内 691-701 bp - 3300 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 6729584-6730950(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCGCTGAGTC
SmilChr01G005360 Chr01 NC_080387.1:70827072-70827082promoter 内 682-692 bp + 3309 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 70830391-70831054(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCGGT
SmilChr06G000087 Chr06 NC_080392.1:630898-630908promoter 内 632-642 bp - 3359 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 624053-627539(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACTCAGCGGG
SmilChr03G002373 Chr03 NC_080389.1:37356583-37356593promoter 内 518-528 bp - 3473 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 37360066-37361268(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCGCTGAGTC
SmilChr01G004960 Chr01 NC_080387.1:67697048-67697058promoter 内 485-495 bp - 3506 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 67692933-67693542(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCGTC
SmilChr03G000304 Chr03 NC_080389.1:3474684-3474694promoter 内 480-490 bp - 3511 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 3466537-3471173(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACTCAGCGGG
SmilChr01G003185 Chr01 NC_080387.1:50604699-50604709promoter 内 428-438 bp - 3563 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 50608272-50610918(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGCC
SmilChr02G002187 Chr02 NC_080388.1:39080141-39080151promoter 内 371-381 bp + 3620 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 39074556-39076521(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGCC
SmilChr06G000748 Chr06 NC_080392.1:6953702-6953712promoter 内 331-341 bp + 3660 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 6957372-6960352(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACTCAGCGGG
SmilChr03G001692 Chr03 NC_080389.1:22440439-22440449promoter 内 325-335 bp - 3666 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 22432963-22436773(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACTCAGCGGG
SmilChr05G000959 Chr05 NC_080391.1:7742034-7742044promoter 内 295-305 bp - 3696 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 7735670-7738338(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACTCAGCGGG
SmilChr07G000123 Chr07 NC_080393.1:710572-710582promoter 内 294-304 bp - 3697 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 704005-706875(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACTCAGCGGG
SmilChr01G003183 Chr01 NC_080387.1:50604699-50604709promoter 内 202-212 bp - 3789 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 50600254-50600910(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCGGT
SmilChr01G004899 Chr01 NC_080387.1:67068796-67068806promoter 内 166-176 bp + 3825 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 67057716-67064971(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGCC
SmilChr03G004428 Chr03 NC_080389.1:62427615-62427625promoter 内 157-167 bp + 3834 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 62420524-62423781(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGGC
SmilChr04G003306 Chr04 NC_080390.1:49794666-49794676promoter 内 61-71 bp + 3930 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 49789894-49790736(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGCC
SmilChr03G002382 Chr03 NC_080389.1:37602593-37602603promoter 内 3021-3031 bp + 970 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 16 37603573-37604031(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGCT
SmilChr06G002024 Chr06 NC_080392.1:26186545-26186555promoter 内 975-985 bp - 3016 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 10 26181855-26183529(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGCT
SmilChr06G001694 Chr06 NC_080392.1:19358470-19358480promoter 内 2470-2480 bp - 1521 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 9 19360001-19363806(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGCT
SmilChr08G000892 Chr08 NC_080394.1:6617634-6617644promoter 内 1396-1406 bp + 2595 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 9 6620239-6620726(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGCT
SmilChr08G003521 Chr08 NC_080394.1:37826414-37826424promoter 内 1622-1632 bp + 2369 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 5 37823940-37824045(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGCT
SmilChr01G000562 Chr01 NC_080387.1:11669846-11669856promoter 内 1247-1257 bp - 2744 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 5 11666755-11667102(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGCT
SmilChr04G001665 Chr04 NC_080390.1:27620873-27620883promoter 内 447-457 bp - 3544 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 5 27613201-27617329(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGCT
SmilChr06G002293 Chr06 NC_080392.1:33038381-33038391promoter 内 1911-1921 bp - 2080 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 4 33040471-33040577(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGCT
SmilChr08G002748 Chr08 NC_080394.1:27122522-27122532promoter 内 1033-1043 bp + 2958 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 4 27125490-27127014(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGCT
SmilChr07G003470 Chr07 NC_080393.1:38830988-38830998promoter 内 2802-2812 bp - 1189 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 38829228-38829799(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCTCAGCGCA
SmilChr02G001904 Chr02 NC_080388.1:34350817-34350827promoter 内 2774-2784 bp - 1217 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 34345375-34349600(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGCT
SmilChr02G003129 Chr02 NC_080388.1:52321431-52321441promoter 内 2576-2586 bp + 1415 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 52318231-52320016(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACGCTGAGGC
SmilChr01G000532 Chr01 NC_080387.1:10850335-10850345promoter 内 2029-2039 bp + 1962 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 10845553-10848373(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGCT
SmilChr03G001958 Chr03 NC_080389.1:27995575-27995585promoter 内 1650-1660 bp + 2341 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 27992014-27993234(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGCT
SmilChr02G001905 Chr02 NC_080388.1:34350817-34350827promoter 内 670-680 bp - 3321 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 34345531-34347496(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGCT
SmilChr03G002593 Chr03 NC_080389.1:41235284-41235294promoter 内 3748-3758 bp - 243 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 41233848-41235041(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCTCAGCGCA
SmilChr05G003589 Chr05 NC_080391.1:47973911-47973921promoter 内 3444-3454 bp - 547 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 47968911-47973364(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCTCAGCGCA
SmilChr03G002324 Chr03 NC_080389.1:36591549-36591559promoter 内 3054-3064 bp + 937 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 36587799-36590612(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGCT
SmilChr03G002377 Chr03 NC_080389.1:37525984-37525994promoter 内 1895-1905 bp - 2096 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 37520655-37523888(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCTCAGCGTG
SmilChr05G003564 Chr05 NC_080391.1:47592519-47592529promoter 内 1169-1179 bp + 2822 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 47595351-47596151(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCTCAGCGTG
SmilChr06G000389 Chr06 NC_080392.1:3089624-3089634promoter 内 884-894 bp - 3107 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 3081264-3086517(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGCT
SmilChr06G000390 Chr06 NC_080392.1:3089624-3089634promoter 内 806-816 bp - 3185 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 3092819-3095256(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGCT
SmilChr05G003565 Chr05 NC_080391.1:47592519-47592529promoter 内 702-712 bp + 3289 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 47595818-47596880(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCTCAGCGTG
SmilChr03G001961 Chr03 NC_080389.1:28106209-28106219promoter 内 511-521 bp + 3480 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 28109699-28110847(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGCT
SmilChr05G000704 Chr05 NC_080391.1:5293531-5293541promoter 内 497-507 bp + 3494 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 5297035-5321242(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCTCAGCGTG
SmilChr01G001603 Chr01 NC_080387.1:30195163-30195173promoter 内 2915-2925 bp + 1076 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 30196249-30197151(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCTCAGCGCA
SmilChr02G000232 Chr02 NC_080388.1:2999921-2999931promoter 内 2053-2063 bp + 1938 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 2992261-2997983(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACGCTGAGGC
SmilChr07G004612 Chr07 NC_080393.1:58929281-58929291promoter 内 1971-1981 bp + 2020 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 58931311-58935241(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGCT