转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G005217; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00006334-RA_Salv SmilChr02G005217 G2-like XP_057792502.1 MP00022 GAGAATCTGT

可能结合的靶基因

9720 个结合位点 6959 个候选靶基因 第 17 / 140 下载 TSV

上一页 17 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G000846 Chr03 NC_080389.1:9649230-9649239promoter 内 1132-1141 bp - 2860 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 9652099-9653931(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CCAGATTCTT
SmilChr01G000746 Chr01 NC_080387.1:16507144-16507153promoter 内 1102-1111 bp - 2890 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 16510043-16513220(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CCAGATTCTT
SmilChr02G005160 Chr02 NC_080388.1:72944026-72944035promoter 内 1075-1084 bp - 2917 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 72946952-72949072(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CCAGATTCTT
SmilChr02G005207 Chr02 NC_080388.1:73302142-73302151promoter 内 824-833 bp - 3168 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 73305319-73307739(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CCAGATTCTT
SmilChr02G005214 Chr02 NC_080388.1:73340359-73340368promoter 内 788-797 bp - 3204 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 73343572-73345894(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CCAGATTCTT
SmilChr01G001446 Chr01 NC_080387.1:28155971-28155980promoter 内 778-787 bp - 3214 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 28159194-28169998(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CCAGATTCTT
SmilChr02G005206 Chr02 NC_080388.1:73297330-73297339promoter 内 764-773 bp - 3228 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 73300567-73302950(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CCAGATTCTT
SmilChr01G000372 Chr01 NC_080387.1:7682840-7682849promoter 内 676-685 bp - 3316 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 7674973-7679524(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 AAGAATCTGG
SmilChr01G000373 Chr01 NC_080387.1:7682840-7682849promoter 内 614-623 bp - 3378 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 7686227-7698295(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CCAGATTCTT
SmilChr03G001088 Chr03 NC_080389.1:12577611-12577620promoter 内 531-540 bp - 3461 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 12581081-12582292(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CCAGATTCTT
SmilChr01G004495 Chr01 NC_080387.1:63076089-63076098promoter 内 518-527 bp - 3474 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 63069932-63072615(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 AAGAATCTGG
SmilChr03G001657 Chr03 NC_080389.1:21526013-21526022promoter 内 502-511 bp - 3490 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 21529512-21531719(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CCAGATTCTT
SmilChr01G000731 Chr01 NC_080387.1:16271557-16271566promoter 内 491-500 bp - 3501 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 16265866-16268056(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 AAGAATCTGG
SmilChr02G004834 Chr02 NC_080388.1:70455891-70455900promoter 内 466-475 bp + 3526 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 70459426-70471260(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 AAGAATCTGG
SmilChr02G000469 Chr02 NC_080388.1:6347120-6347129promoter 内 409-418 bp + 3583 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 6341401-6343537(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CCAGATTCTT
SmilChr02G003745 Chr02 NC_080388.1:59105160-59105169promoter 内 310-319 bp - 3682 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 59100565-59101478(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 AAGAATCTGG
SmilChr01G005142 Chr01 NC_080387.1:69212890-69212899promoter 内 238-247 bp - 3754 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 69199702-69209136(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 AAGAATCTGG
SmilChr01G003365 Chr01 NC_080387.1:52400944-52400953promoter 内 189-198 bp + 3803 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 52389794-52397141(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CCAGATTCTT
SmilChr02G001811 Chr02 NC_080388.1:32934548-32934557promoter 内 167-176 bp + 3825 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 32925959-32930723(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CCAGATTCTT
SmilChr02G005204 Chr02 NC_080388.1:73297330-73297339promoter 内 112-121 bp - 3880 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 73290936-73293450(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 AAGAATCTGG
SmilChr03G002728 Chr03 NC_080389.1:43342500-43342509promoter 内 3789-3798 bp + 203 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 18 43342712-43343830(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTGT
SmilChr03G003340 Chr03 NC_080389.1:51695181-51695190promoter 内 3630-3639 bp + 362 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 5 51690180-51694819(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 ACAGATTCTG
SmilChr01G005857 Chr01 NC_080387.1:74508916-74508925promoter 内 1800-1809 bp + 2192 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 4 74497938-74506724(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 ACAGATTCTG
SmilChr02G003124 Chr02 NC_080388.1:52246497-52246506promoter 内 187-196 bp - 3805 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 4 52241325-52242692(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTGT
SmilChr02G003747 Chr02 NC_080388.1:59127542-59127551promoter 内 3942-3951 bp + 50 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 3 59127601-59130370(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTGT
SmilChr02G001810 Chr02 NC_080388.1:32921070-32921079promoter 内 3875-3884 bp + 117 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 3 32919823-32920953(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 ACAGATTCTG
SmilChr01G004585 Chr01 NC_080387.1:63880678-63880687promoter 内 3604-3613 bp + 388 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 3 63881075-63883595(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTGT
SmilChr03G002827 Chr03 NC_080389.1:44759667-44759676promoter 内 3261-3270 bp + 731 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 3 44751241-44758936(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 ACAGATTCTG
SmilChr01G002564 Chr01 NC_080387.1:43765314-43765323promoter 内 3017-3026 bp - 975 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 3 43760740-43764339(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTGT
SmilChr01G000398 Chr01 NC_080387.1:8165541-8165550promoter 内 2716-2725 bp - 1276 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 3 8166826-8167535(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 ACAGATTCTG
SmilChr02G004547 Chr02 NC_080388.1:68018249-68018258promoter 内 2536-2545 bp + 1456 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 3 68019714-68020863(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTGT
SmilChr02G003213 Chr02 NC_080388.1:53324853-53324862promoter 内 2286-2295 bp + 1706 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 3 53322654-53323147(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 ACAGATTCTG
SmilChr01G000296 Chr01 NC_080387.1:5828691-5828700promoter 内 1837-1846 bp - 2155 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 3 5830855-5833154(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 ACAGATTCTG
SmilChr02G000379 Chr02 NC_080388.1:4772161-4772170promoter 内 1546-1555 bp + 2446 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 3 4766030-4769715(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 ACAGATTCTG
SmilChr01G000295 Chr01 NC_080387.1:5828691-5828700promoter 内 1213-1222 bp - 2779 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 3 5823879-5825912(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTGT
SmilChr03G004022 Chr03 NC_080389.1:59189410-59189419promoter 内 950-959 bp + 3042 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 3 59192461-59197626(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTGT
SmilChr02G002441 Chr02 NC_080388.1:42652628-42652637promoter 内 834-843 bp - 3158 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 3 42655795-42658456(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 ACAGATTCTG
SmilChr01G001263 Chr01 NC_080387.1:25320222-25320231promoter 内 535-544 bp - 3457 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 3 25323688-25327501(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 ACAGATTCTG
SmilChr04G000308 Chr04 NC_080390.1:2848929-2848938promoter 内 287-296 bp - 3705 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 3 2852643-2853942(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 ACAGATTCTG
SmilChr01G001172 Chr01 NC_080387.1:23776212-23776221promoter 内 3987-3996 bp + 5 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 23776226-23778155(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTGT
SmilChr01G004562 Chr01 NC_080387.1:63701780-63701789promoter 内 3893-3902 bp - 99 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 63701888-63703925(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 ACAGATTCTG
SmilChr01G001992 Chr01 NC_080387.1:35323555-35323564promoter 内 3782-3791 bp + 210 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 35321960-35323345(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 ACAGATTCTG
SmilChr04G001042 Chr04 NC_080390.1:14841243-14841252promoter 内 3725-3734 bp - 267 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 14841519-14842618(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 ACAGATTCTG
SmilChr02G000871 Chr02 NC_080388.1:15001346-15001355promoter 内 3544-3553 bp - 448 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 15001803-15003549(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 ACAGATTCTG
SmilChr01G003513 Chr01 NC_080387.1:53739557-53739566promoter 内 3113-3122 bp + 879 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 53740445-53740518(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTGT
SmilChr03G000355 Chr03 NC_080389.1:3976168-3976177promoter 内 2893-2902 bp + 1099 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 3977276-3978322(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTGT
SmilChr03G004332 Chr03 NC_080389.1:61674235-61674244promoter 内 2846-2855 bp + 1146 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 61675390-61676676(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTGT
SmilChr01G005188 Chr01 NC_080387.1:69588005-69588014promoter 内 2804-2813 bp - 1188 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 69589202-69590147(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 ACAGATTCTG
SmilChr01G002409 Chr01 NC_080387.1:41460906-41460915promoter 内 2798-2807 bp + 1194 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 41462109-41463061(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTGT
SmilChr01G003074 Chr01 NC_080387.1:49578475-49578484promoter 内 2636-2645 bp - 1356 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 49579840-49584264(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 ACAGATTCTG