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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G004408; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00011278-RA_Salv SmilChr08G004408 MYB XP_057780613.1 MP00114 AAGTTGGTAGGTGAG

可能结合的靶基因

9897 个结合位点 8151 个候选靶基因 第 17 / 164 下载 TSV

上一页 17 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G001038 Chr01 NC_080387.1:21604430-21604444promoter 内 1100-1114 bp + 2887 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 21607331-21608758(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AAGTAGGTAGGTAGG
SmilChr07G000363 Chr07 NC_080393.1:2493870-2493884promoter 内 531-545 bp + 3456 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 2483848-2490414(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CTCACCTACCTAAAT
SmilChr05G000504 Chr05 NC_080391.1:3917423-3917437promoter 内 97-111 bp - 3890 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 3921327-3926190(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CTCACCTACCAAATG
SmilChr04G000199 Chr04 NC_080390.1:1783618-1783632promoter 内 3736-3750 bp - 251 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 1783883-1785322(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCACACA
SmilChr03G004673 Chr03 NC_080389.1:64176481-64176495promoter 内 3666-3680 bp - 321 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 64175484-64176160(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTGTGGGTAGGTGGA
SmilChr05G000403 Chr05 NC_080391.1:3040889-3040903promoter 内 3598-3612 bp + 389 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 3039895-3040500(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCACACA
SmilChr01G004171 Chr01 NC_080387.1:60195801-60195815promoter 内 3524-3538 bp - 463 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 60196278-60197701(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCACACA
SmilChr01G004428 Chr01 NC_080387.1:62385020-62385034promoter 内 3515-3529 bp + 472 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 62382121-62384548(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCACACA
SmilChr02G004029 Chr02 NC_080388.1:62576937-62576951promoter 内 3091-3105 bp + 896 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 62571706-62576041(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TCCACCTACCTACTG
SmilChr04G003841 Chr04 NC_080390.1:54440507-54440521promoter 内 2944-2958 bp - 1043 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 54441564-54444762(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCACACA
SmilChr04G003792 Chr04 NC_080390.1:54092979-54092993promoter 内 2908-2922 bp - 1079 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 54089831-54091900(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GGGGGGGTAGGTGTG
SmilChr01G005820 Chr01 NC_080387.1:74205197-74205211promoter 内 2827-2841 bp + 1160 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 74206371-74206963(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GGGGGGGTAGGTGTG
SmilChr04G000882 Chr04 NC_080390.1:11230754-11230768promoter 内 2711-2725 bp - 1276 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 11228638-11229478(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GATTTGGTAGGTGAA
SmilChr08G001155 Chr08 NC_080394.1:9159731-9159745promoter 内 2144-2158 bp + 1843 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 9155628-9157888(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CTCACCTACCCCATT
SmilChr05G000885 Chr05 NC_080391.1:7003893-7003907promoter 内 2087-2101 bp - 1900 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 7005807-7007797(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CTCACCTACCCCATT
SmilChr03G003356 Chr03 NC_080389.1:51884362-51884376promoter 内 1991-2005 bp - 1996 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 51886372-51889616(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCACACA
SmilChr04G002040 Chr04 NC_080390.1:33118027-33118041promoter 内 1946-1960 bp + 2041 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 33113750-33115986(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CTCACCTACCATTAT
SmilChr05G002393 Chr05 NC_080391.1:26423152-26423166promoter 内 1782-1796 bp - 2205 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 26425371-26428150(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCTACCTACCCACCC
SmilChr05G000946 Chr05 NC_080391.1:7646202-7646216promoter 内 1752-1766 bp - 2235 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 7648451-7650064(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CTCACCTACCCCATT
SmilChr04G000868 Chr04 NC_080390.1:10945348-10945362promoter 内 1542-1556 bp - 2445 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 10947807-10957469(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCCCCCA
SmilChr05G004213 Chr05 NC_080391.1:56022182-56022196promoter 内 1192-1206 bp + 2795 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 56024991-56025683(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGATTGGTAGGTGAA
SmilChr05G003865 Chr05 NC_080391.1:52252167-52252181promoter 内 923-937 bp - 3064 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 52255245-52259472(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCAAATC
SmilChr05G000442 Chr05 NC_080391.1:3349871-3349885promoter 内 825-839 bp + 3162 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 3353047-3359104(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TGTGTGGTAGGTGAA
SmilChr04G002191 Chr04 NC_080390.1:35428890-35428904promoter 内 804-818 bp - 3183 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 35420632-35425707(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GATTTGGTAGGTGAA
SmilChr07G004358 Chr07 NC_080393.1:56132807-56132821promoter 内 723-737 bp - 3264 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 56136085-56138029(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TCCACCTACCATATT
SmilChr01G004429 Chr01 NC_080387.1:62385020-62385034promoter 内 681-695 bp + 3306 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 62388340-62389416(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TGTGTGGTAGGTGAA
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SmilChr07G001010 Chr07 NC_080393.1:7349705-7349719promoter 内 265-279 bp - 3722 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 7342620-7345983(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TGTGTGGTAGGTGAA
SmilChr05G004126 Chr05 NC_080391.1:55181996-55182010promoter 内 226-240 bp + 3761 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 55173329-55178235(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CTCACCTACCCATCC
SmilChr06G000959 Chr06 NC_080392.1:9250962-9250976promoter 内 52-66 bp - 3935 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 9245258-9247027(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GAGGAGGTAGGTGGC
SmilChr01G000403 Chr01 NC_080387.1:8232578-8232592promoter 内 2774-2788 bp - 1213 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 4 8228936-8231365(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GACGAGGTAGGTGAG
SmilChr01G000674 Chr01 NC_080387.1:14949993-14950007promoter 内 2747-2761 bp - 1240 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 4 14946348-14948753(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GACGAGGTAGGTGAG
SmilChr06G002700 Chr06 NC_080392.1:38947965-38947979promoter 内 2738-2752 bp + 1249 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 4 38949228-38951752(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GACGAGGTAGGTGAG
SmilChr02G004214 Chr02 NC_080388.1:64388992-64389006promoter 内 2327-2341 bp - 1660 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 64384833-64387332(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATTGTGGTAGGTGAA
SmilChr06G002424 Chr06 NC_080392.1:34982758-34982772promoter 内 2207-2221 bp - 1780 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 34984552-34989775(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TCCACCTACCTACAG
SmilChr04G000087 Chr04 NC_080390.1:785597-785611promoter 内 1833-1847 bp - 2154 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 778210-783443(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGCGTGGTAGGTGAA
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SmilChr02G002571 Chr02 NC_080388.1:44725854-44725868promoter 内 3843-3857 bp - 144 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 44725036-44725710(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AAAGAGGTAGGTGGA
SmilChr08G001171 Chr08 NC_080394.1:9371787-9371801promoter 内 3655-3669 bp + 332 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 9367538-9371455(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCAAATT
SmilChr02G000151 Chr02 NC_080388.1:1991746-1991760promoter 内 3196-3210 bp - 791 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 1992551-1995058(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GCCACCTACCTCCTT
SmilChr04G002170 Chr04 NC_080390.1:35049819-35049833promoter 内 3091-3105 bp - 896 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 35050729-35051337(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCCACCTACTACCAT
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SmilChr08G002552 Chr08 NC_080394.1:24819775-24819789promoter 内 3015-3029 bp + 972 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 24817449-24818803(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCAAATT
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SmilChr04G002762 Chr04 NC_080390.1:43371266-43371280promoter 内 2547-2561 bp - 1440 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 43368473-43369826(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATTGTGGTAGGTGAA
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SmilChr05G002548 Chr05 NC_080391.1:28520631-28520645promoter 内 2312-2326 bp + 1675 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 28522320-28523873(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATTGTGGTAGGTGAA
SmilChr03G001889 Chr03 NC_080389.1:26350745-26350759promoter 内 2156-2170 bp + 1831 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 26352590-26353492(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GAGTTGGTGGGTGGG