转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 19 / 143 下载 TSV

上一页 19 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G003194 Chr01 NC_080387.1:50690603-50690614promoter 内 1716-1727 bp - 2274 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 50687862-50688329(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTGGG
SmilChr02G004121 Chr02 NC_080388.1:63481165-63481176promoter 内 1716-1727 bp + 2274 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 63483450-63491767(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCGA
SmilChr01G000949 Chr01 NC_080387.1:20118179-20118190promoter 内 1457-1468 bp - 2533 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 20107984-20115646(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTCTA
SmilChr01G004565 Chr01 NC_080387.1:63725776-63725787promoter 内 1063-1074 bp - 2927 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 63722107-63722849(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGGCCAGCTGTG
SmilChr05G001361 Chr05 NC_080391.1:12104775-12104786promoter 内 1049-1060 bp - 2941 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 12107727-12108395(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCAG
SmilChr03G000439 Chr03 NC_080389.1:4736452-4736463promoter 内 790-801 bp + 3200 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 4731406-4733252(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGCCA
SmilChr01G000250 Chr01 NC_080387.1:4694736-4694747promoter 内 749-760 bp - 3241 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 4697988-4698093(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGAGCTGTCAC
SmilChr02G000076 Chr02 NC_080388.1:978164-978175promoter 内 712-723 bp + 3278 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 972487-974886(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCAG
SmilChr08G001037 Chr08 NC_080394.1:7898380-7898391promoter 内 564-575 bp + 3426 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 7901817-7906952(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCGA
SmilChr08G002383 Chr08 NC_080394.1:22603862-22603873promoter 内 517-528 bp - 3473 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 22598115-22600389(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTGAA
SmilChr08G003375 Chr08 NC_080394.1:35352614-35352625promoter 内 708-719 bp + 3282 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 9 35355907-35361726(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTGTG
SmilChr05G001706 Chr05 NC_080391.1:16295202-16295213promoter 内 3179-3190 bp + 811 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 4 16296024-16296868(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTGTA
SmilChr03G003047 Chr03 NC_080389.1:47375285-47375296promoter 内 3944-3955 bp + 46 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 3 47374089-47375239(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGAGCTGTCAA
SmilChr07G004555 Chr07 NC_080393.1:58276757-58276768promoter 内 2567-2578 bp + 1423 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 3 58274415-58275334(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGAGCTGTCAA
SmilChr04G003858 Chr04 NC_080390.1:54526405-54526416promoter 内 2266-2277 bp - 1724 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 3 54518280-54524681(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTGTA
SmilChr03G004167 Chr03 NC_080389.1:60433963-60433974promoter 内 1065-1076 bp - 2925 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 3 60429488-60431038(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCTA
SmilChr07G004556 Chr07 NC_080393.1:58276757-58276768promoter 内 748-759 bp + 3242 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 3 58280010-58286783(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCTA
SmilChr03G001958 Chr03 NC_080389.1:27996742-27996753promoter 内 482-493 bp + 3508 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 3 27992014-27993234(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGAGCTGTCAC
SmilChr01G005758 Chr01 NC_080387.1:73675621-73675632promoter 内 301-312 bp - 3689 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 3 73661649-73671932(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCTA
SmilChr05G002136 Chr05 NC_080391.1:22449768-22449779promoter 内 253-264 bp - 3737 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 3 22453516-22454850(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTCGG
SmilChr05G003736 Chr05 NC_080391.1:50442418-50442429promoter 内 3952-3963 bp + 38 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 50438969-50442380(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGCCT
SmilChr01G002001 Chr01 NC_080387.1:35519059-35519070promoter 内 3904-3915 bp + 86 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 35519156-35526979(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCTA
SmilChr01G000341 Chr01 NC_080387.1:6957384-6957395promoter 内 3874-3885 bp + 116 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 6957511-6976830(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCTA
SmilChr02G000918 Chr02 NC_080388.1:15898672-15898683promoter 内 3720-3731 bp - 270 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 15898953-15902329(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGAGCTGTCAA
SmilChr01G004109 Chr01 NC_080387.1:59600532-59600543promoter 内 3549-3560 bp - 441 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 59600984-59603871(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCTA
SmilChr01G002711 Chr01 NC_080387.1:45362916-45362927promoter 内 3453-3464 bp - 537 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 45358651-45362379(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCTA
SmilChr07G002572 Chr07 NC_080393.1:24552595-24552606promoter 内 3423-3434 bp + 567 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 24553173-24559396(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTGTA
SmilChr02G005557 Chr02 NC_080388.1:75534459-75534470promoter 内 3177-3188 bp + 813 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 75525210-75533646(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGAGCTGTCAA
SmilChr02G004435 Chr02 NC_080388.1:66745993-66746004promoter 内 3164-3175 bp - 826 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 66741004-66745167(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCTA
SmilChr01G005813 Chr01 NC_080387.1:74137847-74137858promoter 内 2948-2959 bp + 1042 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 74130223-74136805(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCCC
SmilChr02G005500 Chr02 NC_080388.1:75144587-75144598promoter 内 2888-2899 bp - 1102 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 75145700-75149372(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGAGCTGTCAA
SmilChr08G000971 Chr08 NC_080394.1:7222240-7222251promoter 内 2787-2798 bp + 1203 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 7220411-7221037(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGAGCTGTCAA
SmilChr02G005138 Chr02 NC_080388.1:72816998-72817009promoter 内 2713-2724 bp + 1277 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 72811791-72815721(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTCGG
SmilChr01G005814 Chr01 NC_080387.1:74137847-74137858promoter 内 2630-2641 bp + 1360 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 74139218-74141307(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTGTA
SmilChr08G001171 Chr08 NC_080394.1:9373002-9373013promoter 内 2443-2454 bp - 1547 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 9367538-9371455(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCTA
SmilChr06G000703 Chr06 NC_080392.1:6276014-6276025promoter 内 2428-2439 bp + 1562 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 6277587-6283797(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCTA
SmilChr05G004323 Chr05 NC_080391.1:56878170-56878181promoter 内 2371-2382 bp - 1619 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 56874476-56876551(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCTA
SmilChr07G002984 Chr07 NC_080393.1:30408788-30408799promoter 内 2197-2208 bp + 1793 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 30403529-30406995(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCCC
SmilChr06G002425 Chr06 NC_080392.1:34987912-34987923promoter 内 1994-2005 bp - 1996 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 34989919-34991760(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGAGCTGTCAA
SmilChr07G002437 Chr07 NC_080393.1:22783186-22783197promoter 内 1904-1915 bp + 2086 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 22785283-22786216(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCTA
SmilChr02G003071 Chr02 NC_080388.1:51567828-51567839promoter 内 1848-1859 bp - 2142 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 51561803-51565686(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTGTA
SmilChr07G002571 Chr07 NC_080393.1:24552595-24552606promoter 内 1712-1723 bp + 2278 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 24549203-24550317(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCTA
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SmilChr05G002391 Chr05 NC_080391.1:26421522-26421533promoter 内 1516-1527 bp - 2474 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 26417710-26419048(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCTA
SmilChr03G003000 Chr03 NC_080389.1:46817153-46817164promoter 内 1315-1326 bp + 2675 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 46819839-46820705(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCTA
SmilChr01G004709 Chr01 NC_080387.1:65220516-65220527promoter 内 1222-1233 bp + 2768 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 65223295-65227170(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCTA
SmilChr01G001118 Chr01 NC_080387.1:22815220-22815231promoter 内 1014-1025 bp + 2976 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 22811251-22812244(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGAGCTGTCAA
SmilChr02G003698 Chr02 NC_080388.1:58439454-58439465promoter 内 890-901 bp + 3100 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 58442565-58448672(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTGTA
SmilChr02G005559 Chr02 NC_080388.1:75534459-75534470promoter 内 890-901 bp + 3100 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 75537570-75540144(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCTA
SmilChr04G001424 Chr04 NC_080390.1:23190358-23190369promoter 内 669-680 bp - 3321 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 23185042-23187037(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCTA