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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 19 / 136 下载 TSV

上一页 19 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G001035 Chr06 NC_080392.1:10272509-10272519promoter 内 1310-1320 bp - 2681 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 10269755-10269828(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACTCAGCGCC
SmilChr06G001034 Chr06 NC_080392.1:10272509-10272519promoter 内 1244-1254 bp - 2747 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 10267852-10269762(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACTCAGCGCC
SmilChr03G000898 Chr03 NC_080389.1:10266380-10266390promoter 内 1231-1241 bp + 2760 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 10261530-10263620(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGTG
SmilChr03G000793 Chr03 NC_080389.1:9013187-9013197promoter 内 923-933 bp - 3068 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 9016265-9021580(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGTG
SmilChr02G003632 Chr02 NC_080388.1:57667828-57667838promoter 内 909-919 bp + 3082 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 57670920-57673337(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACTCAGCGCC
SmilChr03G000503 Chr03 NC_080389.1:5419008-5419018promoter 内 865-875 bp - 3126 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 5422144-5426627(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGTG
SmilChr03G003981 Chr03 NC_080389.1:58817855-58817865promoter 内 751-761 bp + 3240 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 58821105-58823702(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGGC
SmilChr07G003684 Chr07 NC_080393.1:44344105-44344115promoter 内 745-755 bp - 3246 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 44347361-44355567(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCGCTGAGCA
SmilChr08G004004 Chr08 NC_080394.1:48347488-48347498promoter 内 605-615 bp + 3386 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 48342924-48344102(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCGCTGAGCA
SmilChr08G001262 Chr08 NC_080394.1:9994185-9994195promoter 内 393-403 bp + 3598 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 9997793-10001216(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACTCAGCGCC
SmilChr05G003818 Chr05 NC_080391.1:51489391-51489401promoter 内 375-385 bp + 3616 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 51483959-51485775(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGTG
SmilChr03G001306 Chr03 NC_080389.1:15322148-15322158promoter 内 301-311 bp - 3690 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 15309028-15318458(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGGC
SmilChr01G000890 Chr01 NC_080387.1:18945395-18945405promoter 内 284-294 bp + 3707 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 18941142-18941688(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCGCTGAGCA
SmilChr03G003568 Chr03 NC_080389.1:54339258-54339268promoter 内 230-240 bp + 3761 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 54334338-54335497(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCGCTGAGCA
SmilChr03G000498 Chr03 NC_080389.1:5316486-5316496promoter 内 137-147 bp + 3854 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 5320350-5320955(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACTCAGCGCC
SmilChr03G000792 Chr03 NC_080389.1:9013187-9013197promoter 内 131-141 bp - 3860 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 9008719-9009327(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACTCAGCGCC
SmilChr01G003993 Chr01 NC_080387.1:58356120-58356130promoter 内 13-23 bp + 3978 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 58360108-58362362(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACTCAGCGCC
SmilChr03G004671 Chr03 NC_080389.1:64166125-64166135promoter 内 3567-3577 bp + 424 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 3 64166559-64168856(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCTCAGCGGG
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SmilChr05G000750 Chr05 NC_080391.1:5810915-5810925promoter 内 2711-2721 bp - 1280 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 3 5806255-5809635(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCTCAGCGCC
SmilChr01G005539 Chr01 NC_080387.1:72224736-72224746promoter 内 2593-2603 bp + 1398 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 3 72226144-72227093(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGGGCG
SmilChr04G001844 Chr04 NC_080390.1:29997451-29997461promoter 内 2375-2385 bp + 1616 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 3 29999077-30005186(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGGGCG
SmilChr05G000184 Chr05 NC_080391.1:1482981-1482991promoter 内 194-204 bp + 3797 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 3 1486788-1488731(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCTCAGCGCC
SmilChr02G002352 Chr02 NC_080388.1:41315465-41315475promoter 内 113-123 bp + 3878 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 3 41309914-41311587(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACGCTGAGCG
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SmilChr02G001527 Chr02 NC_080388.1:28400671-28400681promoter 内 3773-3783 bp + 218 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 28400899-28404000(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACTCAGCGGG
SmilChr06G002143 Chr06 NC_080392.1:29117587-29117597promoter 内 3746-3756 bp + 245 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 29116242-29117342(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGGA
SmilChr04G000983 Chr04 NC_080390.1:13251937-13251947promoter 内 3719-3729 bp + 272 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 13250427-13251665(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACGCTGAGCG
SmilChr07G003449 Chr07 NC_080393.1:38389094-38389104promoter 内 3515-3525 bp - 476 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 38389580-38392982(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCCCTGAGCC
SmilChr07G000122 Chr07 NC_080393.1:704370-704380promoter 内 3228-3238 bp + 763 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 701916-703607(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGGA
SmilChr04G000986 Chr04 NC_080390.1:13383218-13383228promoter 内 3138-3148 bp - 853 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 13379206-13382365(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCGTC
SmilChr08G001009 Chr08 NC_080394.1:7587157-7587167promoter 内 3135-3145 bp - 856 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 7588023-7590917(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGGA
SmilChr08G004273 Chr08 NC_080394.1:52235492-52235502promoter 内 2877-2887 bp + 1114 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 52236616-52238820(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACTCAGCGGG
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SmilChr08G001867 Chr08 NC_080394.1:16025386-16025396promoter 内 2713-2723 bp + 1278 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 16026674-16028158(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCTCAGCGCC
SmilChr05G004344 Chr05 NC_080391.1:57079539-57079549promoter 内 2680-2690 bp - 1311 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 57074314-57078228(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCTCAGCGCC
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SmilChr05G002994 Chr05 NC_080391.1:36758246-36758256promoter 内 2082-2092 bp + 1909 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 36760165-36762168(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACTCAGCGGG
SmilChr05G003546 Chr05 NC_080391.1:47359607-47359617promoter 内 1830-1840 bp - 2161 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 47356931-47357446(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCTCAGCGGG
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SmilChr07G000121 Chr07 NC_080393.1:704370-704380promoter 内 1478-1488 bp + 2513 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 699582-701857(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGGA
SmilChr04G004125 Chr04 NC_080390.1:56096017-56096027promoter 内 1057-1067 bp - 2934 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 56098961-56100930(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGGA
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SmilChr08G003207 Chr08 NC_080394.1:32887154-32887164promoter 内 795-805 bp - 3196 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 32890360-32892302(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGGA
SmilChr05G002968 Chr05 NC_080391.1:36035550-36035560promoter 内 755-765 bp - 3236 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 36029094-36032314(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCGTC
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SmilChr05G002750 Chr05 NC_080391.1:31727807-31727817promoter 内 343-353 bp + 3648 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 31722956-31724159(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGGG
SmilChr04G001188 Chr04 NC_080390.1:18137542-18137552promoter 内 3980-3990 bp - 11 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 18137563-18138114(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACGCTGAGCG
SmilChr01G004691 Chr01 NC_080387.1:64967636-64967646promoter 内 3676-3686 bp - 315 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 64965598-64967321(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGGGCG
SmilChr08G000231 Chr08 NC_080394.1:1548226-1548236promoter 内 3630-3640 bp - 361 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 1546608-1547865(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCTCAGCGCC