转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G001518; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00023584-RA_Salv SmilChr05G001518 WRKY XP_057765511.1 MP00455 AACGTTGACTATT

可能结合的靶基因

9792 个结合位点 6900 个候选靶基因 第 19 / 138 下载 TSV

上一页 19 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G003564 Chr03 NC_080389.1:54291562-54291574promoter 内 1428-1440 bp + 2561 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 54284146-54289001(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTCAGTCAACGGA
SmilChr01G001627 Chr01 NC_080387.1:30332601-30332613promoter 内 1365-1377 bp - 2624 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 30335237-30340440(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GTCGGTCAACGAT
SmilChr02G001009 Chr02 NC_080388.1:17845450-17845462promoter 内 1245-1257 bp - 2744 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 17841831-17842706(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCCGTTGACTGCC
SmilChr02G002991 Chr02 NC_080388.1:50580391-50580403promoter 内 1152-1164 bp - 2837 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 50574042-50577554(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TCCGTTGACTCGT
SmilChr02G005573 Chr02 NC_080388.1:75610789-75610801promoter 内 1079-1091 bp - 2910 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 75605921-75607879(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TGCGTTGACTAAC
SmilChr03G002083 Chr03 NC_080389.1:32044264-32044276promoter 内 685-697 bp - 3304 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 32047580-32052217(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CGTGGTCAACGAT
SmilChr03G004242 Chr03 NC_080389.1:60929586-60929598promoter 内 651-663 bp + 3338 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 60932936-60936598(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CACGTTGACCTGC
SmilChr02G000084 Chr02 NC_080388.1:1104714-1104726promoter 内 638-650 bp - 3351 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 1108077-1110129(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCCGGTCAACGTG
SmilChr01G001624 Chr01 NC_080387.1:30332601-30332613promoter 内 443-455 bp - 3546 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 30328983-30329055(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATCGTTGACCGAC
SmilChr03G001277 Chr03 NC_080389.1:14946090-14946102promoter 内 265-277 bp - 3724 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 14949826-14953038(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AGTAGTCAACGTC
SmilChr01G001772 Chr01 NC_080387.1:32639340-32639352promoter 内 193-205 bp + 3796 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 32630790-32635544(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GAAAGTCAACGAT
SmilChr03G004168 Chr03 NC_080389.1:60440232-60440244promoter 内 3474-3486 bp + 515 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 3 60438161-60439717(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CCAAGTCAACGAG
SmilChr01G005632 Chr01 NC_080387.1:72768590-72768602promoter 内 3389-3401 bp + 600 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 3 72766936-72767990(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CCCAGTCAACGAG
SmilChr02G005281 Chr02 NC_080388.1:73859837-73859849promoter 内 1056-1068 bp - 2933 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 3 73855582-73856904(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TGCGTTGACTACT
SmilChr03G004169 Chr03 NC_080389.1:60440232-60440244promoter 内 413-425 bp + 3576 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 3 60443820-60446787(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CTCGTTGACTTGG
SmilChr03G002408 Chr03 NC_080389.1:38270715-38270727promoter 内 2895-2907 bp - 1094 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 38271821-38274358(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACTAGTCAAAGCT
SmilChr02G000048 Chr02 NC_080388.1:649133-649145promoter 内 2621-2633 bp + 1368 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 650513-656626(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACCTTTGACTAGG
SmilChr02G000173 Chr02 NC_080388.1:2219451-2219463promoter 内 2595-2607 bp - 1394 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 2211989-2218057(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACCTTTGACTAGG
SmilChr01G003271 Chr01 NC_080387.1:51421781-51421793promoter 内 2559-2571 bp - 1430 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 51423223-51427377(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACTAGTCAAAGCT
SmilChr02G001118 Chr02 NC_080388.1:20156638-20156650promoter 内 1910-1922 bp + 2079 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 20154472-20154559(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AGAGGTCAACGAT
SmilChr03G001006 Chr03 NC_080389.1:11388566-11388578promoter 内 1207-1219 bp - 2782 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 11391360-11392626(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CATAGTCAAAGCT
SmilChr03G000527 Chr03 NC_080389.1:5641483-5641495promoter 内 739-751 bp - 3250 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 5644745-5645521(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CATAGTCAAAGCT
SmilChr01G003039 Chr01 NC_080387.1:49386383-49386395promoter 内 629-641 bp - 3360 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 49382181-49383023(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AGCTTTGACTAGG
SmilChr03G004213 Chr03 NC_080389.1:60725978-60725990promoter 内 570-582 bp + 3419 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 60720102-60722559(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CTCAGTCAACGTA
SmilChr02G003332 Chr02 NC_080388.1:54563570-54563582promoter 内 3718-3730 bp + 271 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 54563853-54572590(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TACGTTGACTTTA
SmilChr03G002153 Chr03 NC_080389.1:33486961-33486973promoter 内 3355-3367 bp + 634 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 33483435-33486327(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AGTAGTCAACGCA
SmilChr02G005499 Chr02 NC_080388.1:75139452-75139464promoter 内 3258-3270 bp + 731 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 75140195-75145256(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TGCGTTGACTGAC
SmilChr02G001708 Chr02 NC_080388.1:31430607-31430619promoter 内 3224-3236 bp + 765 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 31428694-31429842(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AGAAGTCAACGTC
SmilChr03G004215 Chr03 NC_080389.1:60725978-60725990promoter 内 3172-3184 bp + 817 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 60726807-60730533(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TACGTTGACTGAG
SmilChr01G001973 Chr01 NC_080387.1:35112967-35112979promoter 内 2752-2764 bp + 1237 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 35114216-35115779(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TGCGTTGACCACA
SmilChr01G001962 Chr01 NC_080387.1:34910328-34910340promoter 内 2657-2669 bp + 1332 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 34911672-34914031(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TGCGTTGACCACA
SmilChr02G003864 Chr02 NC_080388.1:60603232-60603244promoter 内 2604-2616 bp - 1385 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 60604629-60606214(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CTTAGTCAACGTA
SmilChr02G000698 Chr02 NC_080388.1:11120663-11120675promoter 内 2514-2526 bp - 1475 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 11114974-11119188(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CTCGTTGACCAAG
SmilChr03G004128 Chr03 NC_080389.1:60104701-60104713promoter 内 2125-2137 bp - 1864 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 60106577-60115463(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TATGGTCAACGAG
SmilChr02G005107 Chr02 NC_080388.1:72586602-72586614promoter 内 2076-2088 bp - 1913 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 72588527-72590966(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CGCAGTCAACGTC
SmilChr01G005840 Chr01 NC_080387.1:74412212-74412224promoter 内 1869-1881 bp - 2120 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 74405949-74410092(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AGCTTTGACTAGT
SmilChr03G002319 Chr03 NC_080389.1:36554261-36554273promoter 内 1753-1765 bp - 2236 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 36550814-36552025(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CTCGTTGACCATA
SmilChr03G000543 Chr03 NC_080389.1:5889845-5889857promoter 内 1445-1457 bp - 2544 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 5892401-5893673(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CATAGTCAAAGCT
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SmilChr02G003858 Chr02 NC_080388.1:60375683-60375695promoter 内 799-811 bp + 3190 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 60369218-60372493(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TATGGTCAACGAG
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SmilChr02G001040 Chr02 NC_080388.1:18486543-18486555promoter 内 708-720 bp - 3281 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 18489836-18489909(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTAGGTCAACGTA
SmilChr01G006041 Chr01 NC_080387.1:75947797-75947809promoter 内 539-551 bp + 3450 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 75941861-75944347(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TATGGTCAACGAG
SmilChr01G002699 Chr01 NC_080387.1:45257551-45257563promoter 内 288-300 bp + 3701 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 45261264-45263971(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TGCGTTGACTTCG
SmilChr03G003496 Chr03 NC_080389.1:53586286-53586298promoter 内 200-212 bp - 3789 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 53581454-53582497(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CTCGTTGACCATA
SmilChr01G005437 Chr01 NC_080387.1:71501333-71501345promoter 内 1015-1027 bp - 2974 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 4 71504319-71509382(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CAAAGTCAACGAG
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SmilChr01G000754 Chr01 NC_080387.1:16624870-16624882promoter 内 2299-2311 bp - 1690 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 3 16616861-16623180(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GTCGTTGACCCAT
SmilChr03G004311 Chr03 NC_080389.1:61474155-61474167promoter 内 2198-2210 bp + 1791 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 3 61475958-61478151(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AGCTTTGACTATT
SmilChr01G003723 Chr01 NC_080387.1:55554198-55554210promoter 内 1925-1937 bp + 2064 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 3 55542510-55552134(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACCAGTCAACGAG