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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G004408; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00011278-RA_Salv SmilChr08G004408 MYB XP_057780613.1 MP00114 AAGTTGGTAGGTGAG

可能结合的靶基因

9897 个结合位点 8151 个候选靶基因 第 19 / 164 下载 TSV

上一页 19 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G003256 Chr05 NC_080391.1:42072313-42072327promoter 内 277-291 bp - 3710 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 42076037-42077085(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCCACCTACTACCTA
SmilChr07G002382 Chr07 NC_080393.1:22214458-22214472promoter 内 58-72 bp + 3929 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 22207718-22210529(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GCCACCTACCCACCC
SmilChr03G003454 Chr03 NC_080389.1:52905053-52905067promoter 内 3926-3940 bp - 61 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 52905128-52906180(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCATACT
SmilChr01G000612 Chr01 NC_080387.1:13515951-13515965promoter 内 3925-3939 bp + 62 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 13514420-13515889(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CACACCTACCTACTT
SmilChr06G001261 Chr06 NC_080392.1:13140363-13140377promoter 内 3902-3916 bp - 85 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 13140462-13142095(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CACACCTACCTACTT
SmilChr02G000285 Chr02 NC_080388.1:3646774-3646788promoter 内 3786-3800 bp + 201 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 3641492-3646573(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCATACT
SmilChr08G001966 Chr08 NC_080394.1:17347914-17347928promoter 内 3720-3734 bp - 267 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 17348195-17353428(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCATACT
SmilChr05G003917 Chr05 NC_080391.1:52905310-52905324promoter 内 3527-3541 bp - 460 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 52905784-52908703(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCATACT
SmilChr03G003381 Chr03 NC_080389.1:52170460-52170474promoter 内 3389-3403 bp + 598 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 52168285-52169862(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCATACT
SmilChr04G000497 Chr04 NC_080390.1:5432500-5432514promoter 内 3359-3373 bp + 628 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 5422966-5431872(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCTTCTT
SmilChr04G000505 Chr04 NC_080390.1:5510601-5510615promoter 内 3331-3345 bp + 656 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 5511271-5516428(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TGGATGGTAGGTGGC
SmilChr05G002846 Chr05 NC_080391.1:33939408-33939422promoter 内 3128-3142 bp + 859 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 33940281-33942272(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTATGGTAGGTGAA
SmilChr02G003098 Chr02 NC_080388.1:51847736-51847750promoter 内 3111-3125 bp + 876 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 51843357-51846860(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCATACT
SmilChr02G005316 Chr02 NC_080388.1:74048372-74048386promoter 内 2940-2954 bp + 1047 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 74044426-74047325(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCCACCTACCTTGTT
SmilChr02G000712 Chr02 NC_080388.1:11481237-11481251promoter 内 2811-2825 bp - 1176 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 11478624-11480061(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GTTTGGGTAGGTGAG
SmilChr02G005195 Chr02 NC_080388.1:73210647-73210661promoter 内 2786-2800 bp - 1201 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 73211862-73215804(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TCCACCTACCTATTT
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SmilChr02G002568 Chr02 NC_080388.1:44681494-44681508promoter 内 2690-2704 bp + 1297 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 44676486-44680197(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCATACT
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SmilChr06G002251 Chr06 NC_080392.1:31933562-31933576promoter 内 2398-2412 bp + 1589 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 31929138-31931973(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCCACCTACTACCTA
SmilChr03G003363 Chr03 NC_080389.1:51975625-51975639promoter 内 2160-2174 bp + 1827 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 51977466-51980894(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTATGGTAGGTGAA
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SmilChr04G004058 Chr04 NC_080390.1:55736271-55736285promoter 内 1892-1906 bp + 2095 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 55731732-55734176(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCATACT
SmilChr03G002032 Chr03 NC_080389.1:30465382-30465396promoter 内 1863-1877 bp + 2124 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 30459959-30463258(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCCACCTACTACCTA
SmilChr05G001269 Chr05 NC_080391.1:10833852-10833866promoter 内 1681-1695 bp + 2306 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 10836172-10840484(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TAGGTAGTAGGTGGG
SmilChr01G005024 Chr01 NC_080387.1:68214469-68214483promoter 内 1648-1662 bp + 2339 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 68208685-68212130(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCCACCTACCTTGTT
SmilChr05G000325 Chr05 NC_080391.1:2437619-2437633promoter 内 1646-1660 bp - 2341 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 2432308-2435278(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GATAAGGTAGGTGAG
SmilChr08G001965 Chr08 NC_080394.1:17347914-17347928promoter 内 1645-1659 bp - 2342 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 17345063-17345572(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTATGGTAGGTGAA
SmilChr01G000920 Chr01 NC_080387.1:19434780-19434794promoter 内 1485-1499 bp + 2502 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 19430555-19432278(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCATACT
SmilChr08G002642 Chr08 NC_080394.1:25873818-25873832promoter 内 1371-1385 bp + 2616 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 25876448-25877837(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTATGGTAGGTGAA
SmilChr03G001538 Chr03 NC_080389.1:19290648-19290662promoter 内 1117-1131 bp - 2870 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 19286477-19287778(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TAGGTAGTAGGTGGG
SmilChr04G001055 Chr04 NC_080390.1:15017834-15017848promoter 内 1105-1119 bp + 2882 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 15020730-15023338(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TAGGTAGTAGGTGGG
SmilChr04G001186 Chr04 NC_080390.1:18107067-18107081promoter 内 1095-1109 bp + 2892 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 18109973-18112965(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TAGGTAGTAGGTGGG
SmilChr05G002922 Chr05 NC_080391.1:35171010-35171024promoter 内 1029-1043 bp + 2958 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 35173982-35176679(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TAGGTAGTAGGTGGG
SmilChr06G002207 Chr06 NC_080392.1:30661599-30661613promoter 内 1003-1017 bp - 2984 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 30657473-30658615(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TAGGTAGTAGGTGGG
SmilChr01G003748 Chr01 NC_080387.1:55799340-55799354promoter 内 812-826 bp + 3175 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 55802529-55803993(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTATGGTAGGTGAA
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SmilChr04G000670 Chr04 NC_080390.1:7572256-7572270promoter 内 785-799 bp - 3202 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 7566103-7569054(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTTTGGTAGGTGTG
SmilChr07G003782 Chr07 NC_080393.1:46375459-46375473promoter 内 683-697 bp + 3304 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 46378777-46381803(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TAGGTAGTAGGTGGG
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SmilChr07G003714 Chr07 NC_080393.1:44886648-44886662promoter 内 478-492 bp - 3509 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 44881784-44883139(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TAGGTAGTAGGTGGG
SmilChr05G000041 Chr05 NC_080391.1:193730-193744promoter 内 423-437 bp - 3564 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 197308-201104(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCAACCTACCAACCT
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SmilChr02G000397 Chr02 NC_080388.1:4911736-4911750promoter 内 373-387 bp - 3614 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 4915364-4916889(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCATCGT
SmilChr01G001242 Chr01 NC_080387.1:24913377-24913391promoter 内 327-341 bp - 3660 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 24917051-24919720(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCCACCTACTACCTA