转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 2 / 143 下载 TSV

上一页 2 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr07G003269 Chr07 NC_080393.1:34448269-34448280promoter 内 18-29 bp + 3972 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 2 34441622-34444297(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GACAGCTGTCAA
SmilChr04G001103 Chr04 NC_080390.1:15789390-15789401promoter 内 2863-2874 bp + 1127 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 1 15785082-15788263(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGCAC
SmilChr02G002183 Chr02 NC_080388.1:39031151-39031162promoter 内 52-63 bp + 3938 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 1 39035100-39037243(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGCCAGCTGTG
SmilChr08G001769 Chr08 NC_080394.1:14898272-14898283promoter 内 3912-3923 bp + 78 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 2 14898361-14904617(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGCCAGCTGTG
SmilChr04G000143 Chr04 NC_080390.1:1238815-1238826promoter 内 3673-3684 bp + 317 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 2 1239143-1242531(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGCCAGCTGTG
SmilChr04G001906 Chr04 NC_080390.1:31138866-31138877promoter 内 3640-3651 bp + 350 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 2 31135768-31138516(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGCAC
SmilChr01G004437 Chr01 NC_080387.1:62462057-62462068promoter 内 2373-2384 bp - 1617 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 2 62463685-62465291(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGCAC
SmilChr03G001939 Chr03 NC_080389.1:27570704-27570715promoter 内 826-837 bp - 3164 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 2 27564948-27567540(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGCCAGCTGTG
SmilChr01G004694 Chr01 NC_080387.1:64989302-64989313promoter 内 3766-3777 bp + 224 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 1 64989537-64990530(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGCCAGCTGTG
SmilChr04G002510 Chr04 NC_080390.1:40084651-40084662promoter 内 2913-2924 bp + 1077 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 1 40085739-40088968(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGCCAGCTGTG
SmilChr07G001388 Chr07 NC_080393.1:10776759-10776770promoter 内 1960-1971 bp - 2030 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 1 10770798-10774729(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGCCAGCTGTG
SmilChr05G000783 Chr05 NC_080391.1:6110175-6110186promoter 内 1888-1899 bp - 2102 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 1 6106539-6108073(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGCCAGCTGTG
SmilChr04G000487 Chr04 NC_080390.1:5244526-5244537promoter 内 1886-1897 bp - 2104 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 1 5246641-5247714(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGCAA
SmilChr03G000961 Chr03 NC_080389.1:10853158-10853169promoter 内 1392-1403 bp - 2598 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 1 10849459-10850560(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGCCAGCTGTG
SmilChr07G003635 Chr07 NC_080393.1:43053162-43053173promoter 内 74-85 bp + 3916 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 1 43043182-43049246(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGCAA
SmilChr05G000476 Chr05 NC_080391.1:3658915-3658926promoter 内 3058-3069 bp - 932 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 4 3659858-3662144(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GACAGCTGTCAT
SmilChr08G001016 Chr08 NC_080394.1:7689493-7689504promoter 内 89-100 bp - 3901 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 2 7677929-7685592(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGTC
SmilChr06G003167 Chr06 NC_080392.1:44621441-44621452promoter 内 2706-2717 bp - 1284 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 1 44618699-44620157(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGCCAGCTGTG
SmilChr01G003942 Chr01 NC_080387.1:57757265-57757276promoter 内 2583-2594 bp - 1407 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 1 57754694-57755858(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGCCAGCTGTG
SmilChr01G005688 Chr01 NC_080387.1:73174071-73174082promoter 内 600-611 bp + 3390 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 1 73168441-73170681(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGCAT
SmilChr04G001000 Chr04 NC_080390.1:13890402-13890413promoter 内 3976-3987 bp + 14 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.9/ 100 4 13890427-13890912(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGCCAGCTGTT
SmilChr03G000684 Chr03 NC_080389.1:7631873-7631884promoter 内 642-653 bp + 3348 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.9/ 100 4 7635232-7652488(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTGGA
SmilChr02G002526 Chr02 NC_080388.1:43950443-43950454promoter 内 639-650 bp - 3351 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.9/ 100 4 43953805-43955960(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTCAC
SmilChr02G004101 Chr02 NC_080388.1:63332359-63332370promoter 内 561-572 bp - 3429 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.9/ 100 4 63335799-63337026(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTCAC
SmilChr08G001526 Chr08 NC_080394.1:12418705-12418716promoter 内 2179-2190 bp + 1811 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.9/ 100 3 12420527-12421409(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTGGA
SmilChr03G004633 Chr03 NC_080389.1:63961448-63961459promoter 内 1841-1852 bp + 2149 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.9/ 100 3 63963608-63965703(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGCCAGCTGTT
SmilChr03G000823 Chr03 NC_080389.1:9429534-9429545promoter 内 424-435 bp + 3566 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.9/ 100 3 9424805-9425968(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGCAA
SmilChr04G002256 Chr04 NC_080390.1:36521918-36521929promoter 内 3486-3497 bp - 504 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.9/ 100 2 36522433-36523368(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTCAC
SmilChr07G004580 Chr07 NC_080393.1:58591050-58591061promoter 内 3030-3041 bp + 960 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.9/ 100 2 58577592-58590090(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTCAC
SmilChr04G001351 Chr04 NC_080390.1:21906101-21906112promoter 内 2775-2786 bp - 1215 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.9/ 100 2 21907327-21907914(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGCAA
SmilChr02G004318 Chr02 NC_080388.1:65502105-65502116promoter 内 2731-2742 bp + 1259 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.9/ 100 2 65503375-65507356(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTGTA
SmilChr03G004246 Chr03 NC_080389.1:60964965-60964976promoter 内 2577-2588 bp - 1413 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.9/ 100 2 60963097-60963552(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTGGA
SmilChr04G001014 Chr04 NC_080390.1:14125187-14125198promoter 内 2277-2288 bp + 1713 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.9/ 100 2 14126911-14128089(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGCCAGCTGTT
SmilChr04G001352 Chr04 NC_080390.1:21906101-21906112promoter 内 1755-1766 bp - 2235 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.9/ 100 2 21908347-21909101(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGCAA
SmilChr07G004164 Chr07 NC_080393.1:53517442-53517453promoter 内 1065-1076 bp - 2925 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.9/ 100 2 53520378-53524900(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCAC
SmilChr04G003050 Chr04 NC_080390.1:47041387-47041398promoter 内 1027-1038 bp + 2963 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.9/ 100 2 47044361-47046574(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTGGA
SmilChr04G003164 Chr04 NC_080390.1:48269841-48269852promoter 内 900-911 bp - 3090 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.9/ 100 2 48264670-48266751(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTGGA
SmilChr08G002678 Chr08 NC_080394.1:26309756-26309767promoter 内 839-850 bp + 3151 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.9/ 100 2 26299173-26306605(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTCAC
SmilChr01G002427 Chr01 NC_080387.1:41809428-41809439promoter 内 619-630 bp - 3371 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.9/ 100 2 41802750-41806057(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGCCAGCTGTT
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SmilChr01G001708 Chr01 NC_080387.1:31499388-31499399promoter 内 317-328 bp - 3673 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.9/ 100 2 31503072-31504277(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGCAA
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SmilChr01G005654 Chr01 NC_080387.1:72905907-72905918promoter 内 1295-1306 bp - 2695 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 3 72902302-72903212(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGCCAGCTGTC
SmilChr08G002986 Chr08 NC_080394.1:29984329-29984340promoter 内 30-41 bp + 3960 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 3 29978743-29980369(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTCAA
SmilChr02G002996 Chr02 NC_080388.1:50653183-50653194promoter 内 29-40 bp + 3961 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 3 50648417-50649222(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTCAA
SmilChr08G002987 Chr08 NC_080394.1:29984329-29984340promoter 内 3833-3844 bp + 157 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 2 29983626-29984172(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTCAA
SmilChr03G001971 Chr03 NC_080389.1:28412172-28412183promoter 内 3305-3316 bp - 685 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 2 28412868-28414304(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GACAGCTGGCAG