Red Sage Omics 丹参基因组信息平台
首页 基因查询 ID 对照表 功能注释 结构域预测 Pfam 基因组工具 蛋白互作 亚细胞定位 表达量 共表达 同源/共线性 GO/KEGG 注释 TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变 JBrowse BLAST 下载 关于 帮助
数据资源
ID 对照表 功能注释 功能检索 次生代谢专题 文献证据 结构域预测 Pfam 同源/共线性
分析工具
基因组工具 引物设计 同源重组引物设计 核酸翻译 BLAST 蛋白互作 亚细胞定位 共表达 GO/KEGG 注释 功能检索
调控/突变
TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变
帮助
关于 帮助 资源与版本
中文 EN

转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G006187; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027306-RA_Salv SmilChr01G006187 GRAS XP_057798078.1 MP00611 AAGAAAAAGACAAAAAAAAA

可能结合的靶基因

9807 个结合位点 6232 个候选靶基因 第 20 / 125 下载 TSV

上一页 20 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G004251 Chr02 NC_080388.1:64699244-64699263promoter 内 3424-3443 bp + 558 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 3 64695755-64698686(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTTCCTTTTTTCTTTTTCCG
SmilChr03G001898 Chr03 NC_080389.1:26525831-26525850promoter 内 2096-2115 bp - 1886 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 3 26518850-26523945(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAGAAAAAAACAAAAGATGA
SmilChr01G000498 Chr01 NC_080387.1:10137973-10137992promoter 内 1953-1972 bp + 2029 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 3 10140021-10143058(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAGAAAAAGAAAAAGAAAGG
SmilChr03G001591 Chr03 NC_080389.1:20163981-20164000promoter 内 1170-1189 bp + 2812 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 3 20166812-20167687(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TGGATGAAGACAAAAGGGGA
SmilChr01G006186 Chr01 NC_080387.1:77409996-77410015promoter 内 196-215 bp - 3786 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 3 77401606-77406210(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AGAAAAAAGAGAAAAGAAAA
SmilChr02G003681 Chr02 NC_080388.1:58177996-58178015promoter 内 3975-3994 bp + 7 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 58178022-58180943(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAGAAAAAGAAAAAGGAAAG
SmilChr02G002854 Chr02 NC_080388.1:48749971-48749990promoter 内 3790-3809 bp - 192 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 48750182-48753986(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CCCTTTTTTCTTTTTTTCTT
SmilChr02G004964 Chr02 NC_080388.1:71555806-71555825promoter 内 3710-3729 bp - 272 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 71556097-71562272(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CTCTCTTTTCTTTTTTTCTT
SmilChr02G002457 Chr02 NC_080388.1:42865179-42865198promoter 内 3486-3505 bp + 496 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 42865694-42866620(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GAGAAAAAAAGAAAAGAAAC
SmilChr01G000546 Chr01 NC_080387.1:11272705-11272724promoter 内 3383-3402 bp - 599 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 11270593-11272106(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GAGAAAAAGAAAAAAATGGG
SmilChr03G003519 Chr03 NC_080389.1:53788341-53788360promoter 内 3340-3359 bp + 642 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 53789002-53791554(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAGAAAAAGAAAAAAAAAGA
SmilChr01G004149 Chr01 NC_080387.1:60024193-60024212promoter 内 3185-3204 bp + 797 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 60016671-60023396(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TCGGTTTTTGTTTTCTTCTT
SmilChr02G003556 Chr02 NC_080388.1:56734182-56734201promoter 内 3016-3035 bp - 966 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 56735167-56739212(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTTTTTTTTCTTTCTTTCTC
SmilChr01G005631 Chr01 NC_080387.1:72765931-72765950promoter 内 2521-2540 bp + 1461 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 72760374-72764470(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTTTTTTTTGTCTCTCAGTC
SmilChr02G004480 Chr02 NC_080388.1:67263813-67263832promoter 内 2432-2451 bp - 1550 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 67265382-67267034(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TCTTTTTTTTTCTTTTTCTT
SmilChr02G003710 Chr02 NC_080388.1:58691085-58691104promoter 内 2260-2279 bp - 1722 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 58688629-58689363(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAGAAAAAGAAAAAAAAGGG
SmilChr01G002717 Chr01 NC_080387.1:45437606-45437625promoter 内 2130-2149 bp + 1852 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 45432075-45435754(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 ACTTTTTTTGTTTCTTTCTT
SmilChr02G000874 Chr02 NC_080388.1:15070044-15070063promoter 内 2125-2144 bp + 1857 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 15071920-15075086(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAGAAAAAGAAAAAGAAAGG
SmilChr02G003241 Chr02 NC_080388.1:53676908-53676927promoter 内 2078-2097 bp + 1904 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 53678831-53681910(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAAAGAAAGACAAAAATAAA
SmilChr03G002461 Chr03 NC_080389.1:38977730-38977749promoter 内 1936-1955 bp - 2046 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 38967393-38975684(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAGAAAAAGAAAAAAAAAGA
SmilChr01G002753 Chr01 NC_080387.1:45852278-45852297promoter 内 1824-1843 bp + 2158 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 45847328-45850120(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTTTTTTTTCTCTCTTTCCA
SmilChr03G001310 Chr03 NC_080389.1:15395714-15395733promoter 内 1517-1536 bp + 2465 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 15389588-15393249(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CCCATTTTTTTCTTTTTCTC
SmilChr01G003954 Chr01 NC_080387.1:57918469-57918488promoter 内 1445-1464 bp - 2537 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 57921025-57976435(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTTTCTTTTTTCTTTTTCTT
SmilChr01G001370 Chr01 NC_080387.1:27043668-27043687promoter 内 1429-1448 bp - 2553 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 27046240-27050291(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTTTGTTTTGTTTTTTTCTT
SmilChr02G004963 Chr02 NC_080388.1:71555806-71555825promoter 内 944-963 bp - 3038 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 71547117-71552768(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAGAAAAAAAGAAAAGAGAG
SmilChr03G000549 Chr03 NC_080389.1:5948624-5948643promoter 内 719-738 bp + 3263 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 5951906-5957114(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAGAAAAAGAAAAAGGAAAG
SmilChr01G003375 Chr01 NC_080387.1:52451981-52452000promoter 内 656-675 bp + 3326 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 52444309-52448655(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTTTCTTTTTTCTTTTTCTT
SmilChr03G001296 Chr03 NC_080389.1:15153752-15153771promoter 内 462-481 bp + 3520 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 15157291-15160121(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CAGGACAAGACAAAATGAGC
SmilChr01G004980 Chr01 NC_080387.1:67855623-67855642promoter 内 97-116 bp - 3885 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 67848459-67851738(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAGAAAAAAAGAAAAAAGGG
SmilChr02G005561 Chr02 NC_080388.1:75546140-75546159promoter 内 3708-3727 bp - 274 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 75546433-75548590(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTTCATTTTGTCTCTTTTTT
SmilChr02G002771 Chr02 NC_080388.1:47765767-47765786promoter 内 3628-3647 bp + 354 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 47763997-47765413(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTTTTTTTTCTCTCTTTTTT
SmilChr01G001255 Chr01 NC_080387.1:25192095-25192114promoter 内 3559-3578 bp + 423 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 25192537-25198619(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GAGAAAGAGACAAATAAAGT
SmilChr01G004846 Chr01 NC_080387.1:66606817-66606836promoter 内 3516-3535 bp + 466 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 66607302-66612035(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAGAAAAAAACAAAACAAAA
SmilChr03G001590 Chr03 NC_080389.1:20163981-20164000promoter 内 3381-3400 bp + 601 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 20164601-20166011(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TGGATGAAGACAAAAGGGGA
SmilChr01G000180 Chr01 NC_080387.1:3043249-3043268promoter 内 3172-3191 bp - 810 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 3040681-3042439(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CGCAAAAAGAGAAAAATGAG
SmilChr01G003376 Chr01 NC_080387.1:52451981-52452000promoter 内 3066-3085 bp + 916 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 52450397-52451065(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTTTCTTTTTTCTTTTTCTT
SmilChr03G000746 Chr03 NC_080389.1:8532265-8532284promoter 内 2895-2914 bp - 1087 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 8525452-8531178(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CACAAGAGGACAAAAGATAA
SmilChr01G004714 Chr01 NC_080387.1:65323472-65323491promoter 内 2765-2784 bp + 1217 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 65324708-65326861(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAGAAAAAGAAAAAAGAGAG
SmilChr03G002340 Chr03 NC_080389.1:36890475-36890494promoter 内 2466-2485 bp - 1516 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 36885893-36888959(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GCGAAGACGACAAAATCAAG
SmilChr03G002400 Chr03 NC_080389.1:38063938-38063957promoter 内 2424-2443 bp + 1558 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 38065515-38065859(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAGAAAAAGAAAAAGAAAGG
SmilChr03G000400 Chr03 NC_080389.1:4375995-4376014promoter 内 1980-1999 bp + 2002 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 4372476-4373993(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CTTTCTTCTCTCTTTTTTTT
SmilChr02G002815 Chr02 NC_080388.1:48224203-48224222promoter 内 1846-1865 bp - 2136 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 48217897-48222067(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAGAAAAAGAGAAGAGATGG
SmilChr02G000037 Chr02 NC_080388.1:464755-464774promoter 内 1729-1748 bp + 2253 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 467027-467542(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AGGAGAAAGAGAAAAAAAAT
SmilChr01G004843 Chr01 NC_080387.1:66572965-66572984promoter 内 1465-1484 bp + 2517 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 66562443-66570448(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TCTATTTTTGTTTTCTTCTT
SmilChr01G000222 Chr01 NC_080387.1:3930341-3930360promoter 内 958-977 bp - 3024 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 3924057-3927317(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAGAAAAAAACAGAGGGAAA
SmilChr02G000450 Chr02 NC_080388.1:5927521-5927540promoter 内 928-947 bp + 3054 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 5930594-5933617(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAGAAAACGACGAAAACACA
SmilChr02G005560 Chr02 NC_080388.1:75546140-75546159promoter 内 910-929 bp - 3072 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 75540696-75543068(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAAAAAGAGACAAAATGAAA
SmilChr01G004486 Chr01 NC_080387.1:62994146-62994165promoter 内 859-878 bp + 3123 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 62987204-62991023(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CTCTCTTTTTTCTTTTTCTT
SmilChr02G005562 Chr02 NC_080388.1:75546140-75546159promoter 内 686-705 bp - 3296 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 75549455-75554805(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTTCATTTTGTCTCTTTTTT
SmilChr02G002853 Chr02 NC_080388.1:48711031-48711050promoter 内 553-572 bp + 3429 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 48714479-48715254(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GGGAAAAAAAGAAAAAAAGA