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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G002743; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00022510-RA_Salv SmilChr01G002743 MYB_related XP_057765725.1 MP00565 AACCTTATCCATAAA

可能结合的靶基因

9785 个结合位点 7412 个候选靶基因 第 21 / 149 下载 TSV

上一页 21 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G006140 Chr01 NC_080387.1:76914682-76914696promoter 内 2588-2602 bp - 1399 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 76909055-76913283(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AGCATTATCCATTAT
SmilChr01G001678 Chr01 NC_080387.1:30986681-30986695promoter 内 2584-2598 bp - 1403 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 30978791-30985278(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATCATTATCCAAAAT
SmilChr01G001625 Chr01 NC_080387.1:30332579-30332593promoter 内 2569-2583 bp - 1418 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 30329325-30331161(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 CACCTTATCCTATCC
SmilChr01G001298 Chr01 NC_080387.1:25851074-25851088promoter 内 2542-2556 bp + 1445 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 25852533-25856306(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GACCTTATCTATAAA
SmilChr02G003943 Chr02 NC_080388.1:61575281-61575295promoter 内 2509-2523 bp + 1478 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 61576773-61582490(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATCATTATCCAAAAT
SmilChr01G005813 Chr01 NC_080387.1:74138291-74138305promoter 内 2501-2515 bp + 1486 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 74130223-74136805(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 CGAATGGATAAGGGT
SmilChr03G003636 Chr03 NC_080389.1:55047903-55047917promoter 内 2499-2513 bp - 1488 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 55049405-55050626(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TGATTAGATAAGGTT
SmilChr01G004750 Chr01 NC_080387.1:65680587-65680601promoter 内 2294-2308 bp - 1693 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 65682294-65684219(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TAAGTGGATAAGATG
SmilChr01G002598 Chr01 NC_080387.1:44156131-44156145promoter 内 2220-2234 bp - 1767 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 44146211-44154364(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GGCCTTATCCTTTTC
SmilChr02G001406 Chr02 NC_080388.1:26654909-26654923promoter 内 2168-2182 bp + 1819 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 26650290-26653090(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GATATGGATAAAATT
SmilChr04G000665 Chr04 NC_080390.1:7508341-7508355promoter 内 2158-2172 bp - 1829 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 7505399-7506512(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TACTTTATCCATAAT
SmilChr04G000591 Chr04 NC_080390.1:6613240-6613254promoter 内 2018-2032 bp - 1969 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 6609468-6611271(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AGCATTATCCATTAT
SmilChr01G003748 Chr01 NC_080387.1:55800540-55800554promoter 内 2012-2026 bp + 1975 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 55802529-55803993(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 CACCTTATCTAAATC
SmilChr02G002721 Chr02 NC_080388.1:47056356-47056370promoter 内 1780-1794 bp + 2207 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 47051765-47054149(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TAAATGGATAATGTC
SmilChr02G001184 Chr02 NC_080388.1:21759707-21759721promoter 内 1618-1632 bp + 2369 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 21756307-21757338(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATTTGGATAATGAT
SmilChr02G001185 Chr02 NC_080388.1:21765123-21765137promoter 内 1618-1632 bp + 2369 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 21761723-21762754(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATTTGGATAATGAT
SmilChr04G000174 Chr04 NC_080390.1:1569429-1569443promoter 内 1525-1539 bp + 2462 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 1571905-1573135(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATATTATCCAAAAA
SmilChr03G002497 Chr03 NC_080389.1:39762778-39762792promoter 内 1501-1515 bp - 2486 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 39758229-39760292(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TGCCTTATCCGATTC
SmilChr03G004211 Chr03 NC_080389.1:60718552-60718566promoter 内 1364-1378 bp - 2623 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 60713264-60715929(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TACTTTATCCAAATA
SmilChr01G001627 Chr01 NC_080387.1:30332579-30332593promoter 内 1343-1357 bp - 2644 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 30335237-30340440(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GGATAGGATAAGGTG
SmilChr04G001160 Chr04 NC_080390.1:17167420-17167434promoter 内 1325-1339 bp - 2662 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 17161589-17164758(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AGCATTATCCACAAA
SmilChr02G001148 Chr02 NC_080388.1:20883848-20883862promoter 内 1298-1312 bp - 2689 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 20878858-20881159(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TTCCTTATCCACTCT
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SmilChr01G002382 Chr01 NC_080387.1:41018400-41018414promoter 内 720-734 bp + 3267 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 41013243-41015133(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TTTTTGGATAATATT
SmilChr04G000593 Chr04 NC_080390.1:6613240-6613254promoter 内 586-600 bp - 3401 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 6616655-6632838(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATAATGGATAATGCT
SmilChr01G004640 Chr01 NC_080387.1:64443067-64443081promoter 内 524-538 bp + 3463 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 64446544-64447775(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATCTTATCCATTGG
SmilChr01G003855 Chr01 NC_080387.1:56816936-56816950promoter 内 500-514 bp + 3487 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 56820437-56822342(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TACCTTATCTAAAAT
SmilChr01G001624 Chr01 NC_080387.1:30332579-30332593promoter 内 463-477 bp - 3524 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 30328983-30329055(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 CACCTTATCCTATCC
SmilChr03G001518 Chr03 NC_080389.1:18647733-18647747promoter 内 451-465 bp + 3536 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 18641663-18644197(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATTTGGATAATGAT
SmilChr01G005815 Chr01 NC_080387.1:74138291-74138305promoter 内 398-412 bp + 3589 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 74141894-74144092(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ACCCTTATCCATTCG
SmilChr03G003050 Chr03 NC_080389.1:47401842-47401856promoter 内 168-182 bp + 3819 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 47393487-47398023(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TTTTTGGATAATATT
SmilChr01G004704 Chr01 NC_080387.1:65141959-65141973promoter 内 156-170 bp - 3831 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 65145804-65147888(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GGTTTGGATAAGCTA
SmilChr02G001832 Chr02 NC_080388.1:33337078-33337092promoter 内 77-91 bp - 3910 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 33341002-33345584(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GTTAAGGATAAGATC
SmilChr02G005108 Chr02 NC_080388.1:72595365-72595379promoter 内 3586-3600 bp + 401 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 5 72591050-72594964(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GGTTTGGATAATGAT
SmilChr02G000458 Chr02 NC_080388.1:6122185-6122199promoter 内 3063-3077 bp - 924 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 4 6118977-6121261(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATCCTATCCATAAC
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SmilChr01G001666 Chr01 NC_080387.1:30752970-30752984promoter 内 1922-1936 bp + 2065 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 3 30748494-30750905(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 CAAATGGATAATGAT
SmilChr01G005272 Chr01 NC_080387.1:70156622-70156636promoter 内 1915-1929 bp - 2072 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 3 70158708-70159433(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TATAAGGATAAGATA
SmilChr04G002685 Chr04 NC_080390.1:42292797-42292811promoter 内 1573-1587 bp + 2414 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 3 42288245-42290383(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AGAATGGATAAGGGT
SmilChr03G001236 Chr03 NC_080389.1:14275763-14275777promoter 内 3931-3945 bp + 56 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 14275833-14278119(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TTCCTTATCCTTATT
SmilChr01G001982 Chr01 NC_080387.1:35212570-35212584promoter 内 3917-3931 bp - 70 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 35210483-35212500(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATTCTTATCCACACA
SmilChr02G001499 Chr02 NC_080388.1:28037441-28037455promoter 内 3631-3645 bp - 356 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 28037811-28041256(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AGAATGGATAAGGCG
SmilChr01G001936 Chr01 NC_080387.1:34557102-34557116promoter 内 3530-3544 bp + 457 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 34555603-34556645(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TATGTAGATAAGGTA
SmilChr01G001754 Chr01 NC_080387.1:32264881-32264895promoter 内 3525-3539 bp - 462 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 32265357-32270789(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GTTATGGATAGGATT